RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550078.2

ZBED6-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED6, Length 12,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ZBED6-202ENST00000550078 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
ZBED6-202ENST00000550078 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
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ZBED6-202ENST00000550078 SLC24A1O60721 1099 aa8.28□□□□□ -1.08
ZBED6-202ENST00000550078 BCL11AQ9H165 835 aa8.28□□□□□ -1.08
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ZBED6-202ENST00000550078 POLR3GLQ9BT43 218 aa8.24□□□□□ -1.09
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ZBED6-202ENST00000550078 ERICH6Q7L0X2 663 aa8.21□□□□□ -1.1
ZBED6-202ENST00000550078 A0A0G2JS52 829 aa8.2□□□□□ -1.1
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ZBED6-202ENST00000550078 BCANQ96GW7 911 aa8.11□□□□□ -1.11
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ZBED6-202ENST00000550078 PRM3Q9NNZ6 103 aa7.67□□□□□ -1.18
ZBED6-202ENST00000550078 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
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ZBED6-202ENST00000550078 WDR70Q9NW82 654 aa7.48□□□□□ -1.21
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ZBED6-202ENST00000550078 NBR1Q14596 966 aa7.43□□□□□ -1.22
ZBED6-202ENST00000550078 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
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ZBED6-202ENST00000550078 TRIM41Q8WV44 630 aa7.42□□□□□ -1.22
ZBED6-202ENST00000550078 PDE4CQ08493 712 aa7.41□□□□□ -1.22
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ZBED6-202ENST00000550078 FKBP8Q14318 412 aa7.39□□□□□ -1.23
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ZBED6-202ENST00000550078 NEUROD1Q13562 356 aa7.3□□□□□ -1.24
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ZBED6-202ENST00000550078 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
ZBED6-202ENST00000550078 MSH5O43196 834 aa7.28□□□□□ -1.24
ZBED6-202ENST00000550078 VSIG10Q8N0Z9 540 aa7.28□□□□□ -1.24
ZBED6-202ENST00000550078 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.246e-7■□□□□ 9.8
ZBED6-202ENST00000550078 GOLGA2Q08379 1002 aa7.27□□□□□ -1.25
ZBED6-202ENST00000550078 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
ZBED6-202ENST00000550078 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
ZBED6-202ENST00000550078 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
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