RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473950.5

SRSF11-211, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 11, humanhuman

TSL 5

Gene SRSF11, Length 796 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11-211ENST00000473950 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.06■■■■■ 7.05
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SRSF11-211ENST00000473950 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.61■■■■■ 5.53
SRSF11-211ENST00000473950 NACADO15069 1562 aa49.52■■■■■ 5.52
SRSF11-211ENST00000473950 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.27■■■■■ 5.48
SRSF11-211ENST00000473950 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.19■■■■■ 5.46
SRSF11-211ENST00000473950 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.18■■■■■ 5.46
SRSF11-211ENST00000473950 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.89■■■■■ 5.42
SRSF11-211ENST00000473950 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.54■■■■■ 5.36
SRSF11-211ENST00000473950 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.35■■■■■ 5.33
SRSF11-211ENST00000473950 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.17■■■■■ 5.32e-6■■■■□ 19.7
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SRSF11-211ENST00000473950 SCRIBQ14160 1630 aa47.96■■■■■ 5.27
SRSF11-211ENST00000473950 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.64■■■■■ 5.22
SRSF11-211ENST00000473950 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.88■■■■■ 5.1
SRSF11-211ENST00000473950 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.73■■■■■ 5.07
SRSF11-211ENST00000473950 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.43■■■■■ 5.02
SRSF11-211ENST00000473950 SMARCA4P51532 1647 aa45.89■■■■■ 4.94
SRSF11-211ENST00000473950 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.79■■■■■ 4.92
SRSF11-211ENST00000473950 NCAPD3P42695 1498 aa45.68■■■■■ 4.9
SRSF11-211ENST00000473950 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.68■■■■■ 4.9
SRSF11-211ENST00000473950 SMARCA2P51531 1590 aa45.62■■■■■ 4.89
SRSF11-211ENST00000473950 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.51■■■■■ 4.88
SRSF11-211ENST00000473950 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.48■■■■■ 4.87
SRSF11-211ENST00000473950 HMGXB3Q12766 1538 aa45.47■■■■■ 4.87
SRSF11-211ENST00000473950 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.27■■■■■ 4.84
SRSF11-211ENST00000473950 WIZO95785 1651 aa45.02■■■■■ 4.8
SRSF11-211ENST00000473950 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.91■■■■■ 4.78
SRSF11-211ENST00000473950 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.74■■■■■ 4.75
SRSF11-211ENST00000473950 NESP48681 1621 aa44.64■■■■■ 4.74
SRSF11-211ENST00000473950 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.54■■■■■ 4.72
SRSF11-211ENST00000473950 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.52■■■■■ 4.72
SRSF11-211ENST00000473950 ERCC6Q03468 1493 aa44.5■■■■■ 4.71
SRSF11-211ENST00000473950 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.31■■■■■ 4.68
SRSF11-211ENST00000473950 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.18■■■■■ 4.66
SRSF11-211ENST00000473950 CUX2O14529 1486 aa44.15■■■■■ 4.66
SRSF11-211ENST00000473950 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.14■■■■■ 4.66
SRSF11-211ENST00000473950 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.06■■■■■ 4.64
SRSF11-211ENST00000473950 CFTRP13569 1480 aa44.04■■■■■ 4.64
SRSF11-211ENST00000473950 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.98■■■■■ 4.63
SRSF11-211ENST00000473950 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.82■■■■■ 4.6
SRSF11-211ENST00000473950 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.78■■■■■ 4.6
SRSF11-211ENST00000473950 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.77■■■■■ 4.6
SRSF11-211ENST00000473950 PRDM2Q13029 1718 aa43.74■■■■■ 4.59
SRSF11-211ENST00000473950 WDR62O43379 1518 aa43.67■■■■■ 4.58
SRSF11-211ENST00000473950 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.51■■■■■ 4.56
SRSF11-211ENST00000473950 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.42■■■■■ 4.54
SRSF11-211ENST00000473950 TOPBP1Q92547 1522 aa43.11■■■■■ 4.49
SRSF11-211ENST00000473950 ABCC8Q09428 1581 aa43.07■■■■■ 4.49
SRSF11-211ENST00000473950 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.05■■■■■ 4.48
SRSF11-211ENST00000473950 IFT140Q96RY7 1462 aa42.88■■■■■ 4.46
SRSF11-211ENST00000473950 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.73■■■■■ 4.43
SRSF11-211ENST00000473950 CUX1P39880 1505 aa42.71■■■■■ 4.43
SRSF11-211ENST00000473950 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.71■■■■■ 4.43
SRSF11-211ENST00000473950 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.68■■■■■ 4.42
SRSF11-211ENST00000473950 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.59■■■■■ 4.41
SRSF11-211ENST00000473950 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.56■■■■■ 4.4
SRSF11-211ENST00000473950 TRIM41Q8WV44 630 aa42.55■■■■■ 4.4
SRSF11-211ENST00000473950 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.52■■■■■ 4.4
SRSF11-211ENST00000473950 SOGA1O94964 1423 aa42.51■■■■■ 4.4
SRSF11-211ENST00000473950 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.41■■■■■ 4.383e-16■□□□□ 8.9
SRSF11-211ENST00000473950 WDR97A6NE52 1622 aa42.35■■■■■ 4.37
SRSF11-211ENST00000473950 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.33■■■■■ 4.37
SRSF11-211ENST00000473950 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.31■■■■■ 4.36
SRSF11-211ENST00000473950 TOP2BQ02880 1626 aa42.3■■■■■ 4.36
SRSF11-211ENST00000473950 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.29■■■■■ 4.36
SRSF11-211ENST00000473950 SYNJ1O43426 1573 aa42.27■■■■■ 4.36
SRSF11-211ENST00000473950 OSCARQ8IYS5 282 aa42.21■■■■■ 4.35
SRSF11-211ENST00000473950 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.18■■■■■ 4.34
SRSF11-211ENST00000473950 CHD1O14646 1710 aa42.06■■■■■ 4.32
SRSF11-211ENST00000473950 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.06■■■■■ 4.32
SRSF11-211ENST00000473950 GRIN2BQ13224 1484 aa42.06■■■■■ 4.32
SRSF11-211ENST00000473950 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.04■■■■■ 4.32
SRSF11-211ENST00000473950 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.04■■■■■ 4.32
SRSF11-211ENST00000473950 PBRM1Q86U86 1689 aa42■■■■■ 4.31
SRSF11-211ENST00000473950 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.99■■■■■ 4.31
SRSF11-211ENST00000473950 FBLN2P98095 1184 aa41.86■■■■■ 4.29
SRSF11-211ENST00000473950 SYNJ2O15056 1496 aa41.83■■■■■ 4.29
SRSF11-211ENST00000473950 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.75■■■■■ 4.27
SRSF11-211ENST00000473950 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.68■■■■■ 4.26
SRSF11-211ENST00000473950 ADAMTS12P58397 1594 aa41.67■■■■■ 4.26
SRSF11-211ENST00000473950 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.64■■■■■ 4.26
SRSF11-211ENST00000473950 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.64■■■■■ 4.26
SRSF11-211ENST00000473950 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.64■■■■■ 4.26
SRSF11-211ENST00000473950 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.61■■■■■ 4.25
SRSF11-211ENST00000473950 ARHGEF11O15085 1522 aa41.6■■■■■ 4.25
SRSF11-211ENST00000473950 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.54■■■■■ 4.24
SRSF11-211ENST00000473950 GRIN2AQ12879 1464 aa41.53■■■■■ 4.24
SRSF11-211ENST00000473950 KIF27Q86VH2 1401 aa41.46■■■■■ 4.23
SRSF11-211ENST00000473950 NUP160Q12769 1436 aa41.38■■■■■ 4.22
SRSF11-211ENST00000473950 CEP170Q5SW79 1584 aa41.35■■■■■ 4.21
SRSF11-211ENST00000473950 IGF1RP08069 1367 aa41.32■■■■■ 4.21
SRSF11-211ENST00000473950 ARAP1Q96P48 1450 aa41.27■■■■■ 4.2
SRSF11-211ENST00000473950 CUL7Q14999 1698 aa41.26■■■■■ 4.2
SRSF11-211ENST00000473950 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.15■■■■■ 4.18
SRSF11-211ENST00000473950 SHROOM2Q13796 1616 aa41.11■■■■■ 4.17
SRSF11-211ENST00000473950 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.06■■■■■ 4.16
SRSF11-211ENST00000473950 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.05■■■■■ 4.16
SRSF11-211ENST00000473950 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41■■■■■ 4.15
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