RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318158.10

GRHPR-201, Transcript of glyoxylate and hydroxypyruvate reductase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRHPR, Length 1,280 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHPR-201ENST00000318158 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.72■■■■■ 4.11
GRHPR-201ENST00000318158 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.2■■■■□ 3.39
GRHPR-201ENST00000318158 ABCC9O60706 1549 aa34.91■■■■□ 3.18
GRHPR-201ENST00000318158 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34■■■■□ 3.03
GRHPR-201ENST00000318158 NACADO15069 1562 aa33.91■■■■□ 3.02
GRHPR-201ENST00000318158 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.87■■■■□ 3.01
GRHPR-201ENST00000318158 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.87■■■■□ 3.01
GRHPR-201ENST00000318158 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.81■■■■□ 3
GRHPR-201ENST00000318158 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.69■■■□□ 2.98
GRHPR-201ENST00000318158 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.09■■■□□ 2.89
GRHPR-201ENST00000318158 SCRIBQ14160 1630 aa32.88■■■□□ 2.85
GRHPR-201ENST00000318158 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.76■■■□□ 2.84
GRHPR-201ENST00000318158 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.62■■■□□ 2.81
GRHPR-201ENST00000318158 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.59■■■□□ 2.81
GRHPR-201ENST00000318158 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.9■■■□□ 2.7
GRHPR-201ENST00000318158 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.68■■■□□ 2.66
GRHPR-201ENST00000318158 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.67■■■□□ 2.66
GRHPR-201ENST00000318158 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
GRHPR-201ENST00000318158 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.59■■■□□ 2.65
GRHPR-201ENST00000318158 SMARCA4P51532 1647 aa31.55■■■□□ 2.64
GRHPR-201ENST00000318158 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.33■■■□□ 2.61
GRHPR-201ENST00000318158 SMARCA2P51531 1590 aa31.32■■■□□ 2.6
GRHPR-201ENST00000318158 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.3■■■□□ 2.6
GRHPR-201ENST00000318158 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.27■■■□□ 2.6
GRHPR-201ENST00000318158 NCAPD3P42695 1498 aa31.25■■■□□ 2.59
GRHPR-201ENST00000318158 HMGXB3Q12766 1538 aa31.18■■■□□ 2.58
GRHPR-201ENST00000318158 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
GRHPR-201ENST00000318158 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
GRHPR-201ENST00000318158 WIZO95785 1651 aa31.02■■■□□ 2.56
GRHPR-201ENST00000318158 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.78■■■□□ 2.52
GRHPR-201ENST00000318158 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.42■■■□□ 2.46
GRHPR-201ENST00000318158 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
GRHPR-201ENST00000318158 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.33■■■□□ 2.45
GRHPR-201ENST00000318158 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.31■■■□□ 2.44
GRHPR-201ENST00000318158 NESP48681 1621 aa30.29■■■□□ 2.44
GRHPR-201ENST00000318158 CFTRP13569 1480 aa30.22■■■□□ 2.43
GRHPR-201ENST00000318158 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.16■■■□□ 2.42
GRHPR-201ENST00000318158 PRDM2Q13029 1718 aa30.14■■■□□ 2.42
GRHPR-201ENST00000318158 ERCC6Q03468 1493 aa30.12■■■□□ 2.41
GRHPR-201ENST00000318158 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.04■■■□□ 2.4
GRHPR-201ENST00000318158 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30■■■□□ 2.39
GRHPR-201ENST00000318158 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.96■■■□□ 2.39
GRHPR-201ENST00000318158 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.93■■■□□ 2.38
GRHPR-201ENST00000318158 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
GRHPR-201ENST00000318158 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.83■■■□□ 2.37
GRHPR-201ENST00000318158 CUX2O14529 1486 aa29.79■■■□□ 2.36
GRHPR-201ENST00000318158 WDR62O43379 1518 aa29.74■■■□□ 2.35
GRHPR-201ENST00000318158 ABCC8Q09428 1581 aa29.64■■■□□ 2.33
GRHPR-201ENST00000318158 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
GRHPR-201ENST00000318158 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.56■■■□□ 2.32
GRHPR-201ENST00000318158 TOPBP1Q92547 1522 aa29.52■■■□□ 2.32
GRHPR-201ENST00000318158 CUX1P39880 1505 aa29.39■■■□□ 2.3
GRHPR-201ENST00000318158 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.33■■■□□ 2.29
GRHPR-201ENST00000318158 IFT140Q96RY7 1462 aa29.3■■■□□ 2.28
GRHPR-201ENST00000318158 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.3■■■□□ 2.28
GRHPR-201ENST00000318158 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
GRHPR-201ENST00000318158 TOP2BQ02880 1626 aa29.28■■■□□ 2.28
GRHPR-201ENST00000318158 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.25■■■□□ 2.27
GRHPR-201ENST00000318158 SYNJ1O43426 1573 aa29.22■■■□□ 2.27
GRHPR-201ENST00000318158 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
GRHPR-201ENST00000318158 SOGA1O94964 1423 aa29.15■■■□□ 2.26
GRHPR-201ENST00000318158 WDR97A6NE52 1622 aa29.12■■■□□ 2.25
GRHPR-201ENST00000318158 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.08■■■□□ 2.25
GRHPR-201ENST00000318158 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
GRHPR-201ENST00000318158 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
GRHPR-201ENST00000318158 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.03■■■□□ 2.24
GRHPR-201ENST00000318158 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.91■■■□□ 2.226e-7■■■■□ 20.2
GRHPR-201ENST00000318158 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.91■■■□□ 2.22
GRHPR-201ENST00000318158 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
GRHPR-201ENST00000318158 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.85■■■□□ 2.21
GRHPR-201ENST00000318158 PBRM1Q86U86 1689 aa28.83■■■□□ 2.21
GRHPR-201ENST00000318158 GRIN2BQ13224 1484 aa28.82■■■□□ 2.2
GRHPR-201ENST00000318158 TRIM41Q8WV44 630 aa28.76■■■□□ 2.19
GRHPR-201ENST00000318158 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
GRHPR-201ENST00000318158 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.72■■■□□ 2.19
GRHPR-201ENST00000318158 KIF27Q86VH2 1401 aa28.71■■■□□ 2.19
GRHPR-201ENST00000318158 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.7■■■□□ 2.18
GRHPR-201ENST00000318158 CHD1O14646 1710 aa28.62■■■□□ 2.17
GRHPR-201ENST00000318158 SYNJ2O15056 1496 aa28.61■■■□□ 2.17
GRHPR-201ENST00000318158 ADAMTS12P58397 1594 aa28.59■■■□□ 2.17
GRHPR-201ENST00000318158 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.58■■■□□ 2.17
GRHPR-201ENST00000318158 CUL7Q14999 1698 aa28.55■■■□□ 2.16
GRHPR-201ENST00000318158 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.54■■■□□ 2.16
GRHPR-201ENST00000318158 OSCARQ8IYS5 282 aa28.51■■■□□ 2.15
GRHPR-201ENST00000318158 IGF1RP08069 1367 aa28.5■■■□□ 2.15
GRHPR-201ENST00000318158 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.49■■■□□ 2.15
GRHPR-201ENST00000318158 FBLN2P98095 1184 aa28.45■■■□□ 2.14
GRHPR-201ENST00000318158 GRIN2AQ12879 1464 aa28.45■■■□□ 2.14
GRHPR-201ENST00000318158 EEA1Q15075 1411 aa28.43■■■□□ 2.14
GRHPR-201ENST00000318158 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.41■■■□□ 2.14
GRHPR-201ENST00000318158 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.35■■■□□ 2.13
GRHPR-201ENST00000318158 NUP160Q12769 1436 aa28.32■■■□□ 2.12
GRHPR-201ENST00000318158 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.32■■■□□ 2.12
GRHPR-201ENST00000318158 CEP170Q5SW79 1584 aa28.28■■■□□ 2.12
GRHPR-201ENST00000318158 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa28.26■■■□□ 2.11
GRHPR-201ENST00000318158 PRXQ9BXM0 1461 aa28.22■■■□□ 2.11
GRHPR-201ENST00000318158 CSRNP3Q8WYN3 585 aa28.22■■■□□ 2.11
GRHPR-201ENST00000318158 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa28.13■■■□□ 2.09
GRHPR-201ENST00000318158 SHROOM2Q13796 1616 aa28.11■■■□□ 2.09
GRHPR-201ENST00000318158 KIF21BO75037 1637 aa28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.6 ms