Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 RPL17-218ENST00000583637 758 ntTSL 320.5■□□□□ 0.872e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 EPHB4-207ENST00000489808 921 ntTSL 1 (best)20.4■□□□□ 0.864e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 MEF2D-205ENST00000475587 1627 ntTSL 520.35■□□□□ 0.852e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 ACP1-208ENST00000442386 546 ntTSL 420.25■□□□□ 0.832e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 NCOR2-221ENST00000494460 339 ntTSL 319.87■□□□□ 0.772e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.772e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.682e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.672e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.632e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.622e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 SMC6-206ENST00000446852 2460 ntTSL 1 (best)18.92■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.582e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.562e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 LUC7L-209ENST00000429378 721 ntTSL 318.55■□□□□ 0.564e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 RPL17-209ENST00000580387 827 ntTSL 518.09■□□□□ 0.492e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 EPHB4-204ENST00000477446 1551 ntTSL 1 (best)18.04■□□□□ 0.484e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 RPL17-221ENST00000615760 650 ntTSL 318■□□□□ 0.472e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.472e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 RPL28-211ENST00000560881 1692 ntTSL 517.95■□□□□ 0.462e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.462e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 SAFB2-204ENST00000589925 506 ntTSL 317.9■□□□□ 0.462e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 RPL17-223ENST00000618613 856 ntAPPRIS P1 TSL 317.89■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 APLP2-207ENST00000525604 1590 ntTSL 217.64■□□□□ 0.415e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 HCLS1-208ENST00000487290 1078 ntTSL 217.63■□□□□ 0.412e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 HCLS1-210ENST00000491824 646 ntTSL 317.59■□□□□ 0.412e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 HCLS1-212ENST00000497391 533 ntTSL 417.59■□□□□ 0.412e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 GIPR-204ENST00000588816 709 ntTSL 517.29■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.362e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 NFXL1-205ENST00000507131 2664 ntTSL 217.21■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.342e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 PDXK-208ENST00000461123 637 ntTSL 317.06■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 APLP2-222ENST00000533860 1424 ntTSL 1 (best)16.96■□□□□ 0.315e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 NDRG1-203ENST00000517331 584 ntTSL 516.77■□□□□ 0.282e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 HDAC6-218ENST00000470942 668 ntTSL 316.75■□□□□ 0.272e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 ALKBH6-211ENST00000481257 553 ntTSL 516.54■□□□□ 0.245e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 HDAC6-236ENST00000498808 566 ntTSL 516.49■□□□□ 0.232e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.212e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 RBPJ-223ENST00000512671 795 ntTSL 216.27■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 NDRG1-223ENST00000522665 411 ntTSL 216.22■□□□□ 0.192e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.182e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 RPL28-202ENST00000426763 5620 ntTSL 1 (best)16.04■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 LAMTOR4-210ENST00000488338 533 ntTSL 315.79■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 HCLS1-203ENST00000464274 552 ntTSL 415.77■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 ATP11A-211ENST00000479193 621 ntTSL 215.77■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.112e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 FAM204A-201ENST00000369170 975 ntTSL 215.62■□□□□ 0.092e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 RHOC-219ENST00000534717 574 ntTSL 315.49■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 PACS1-207ENST00000528935 846 ntTSL 415.43■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 LAMTOR4-204ENST00000466498 371 ntTSL 215.26■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 LAMTOR4-208ENST00000474831 564 ntTSL 315.06■□□□□ 02e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 MAMDC4-205ENST00000485732 4112 ntTSL 1 (best)15.05■□□□□ -02e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 SLC1A5-206ENST00000598022 276 ntTSL 314.84□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 LAMTOR4-211ENST00000490633 401 ntTSL 314.73□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.082e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 LAMTOR4-202ENST00000441173 730 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 NFXL1-203ENST00000464756 3865 ntTSL 1 (best)14.41□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 AC091181.1-201ENST00000623762 2098 ntBASIC14.3□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 RHOC-209ENST00000414971 470 ntTSL 314.29□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 ATP11A-206ENST00000419631 2446 ntTSL 314.29□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 HCLS1-207ENST00000481314 1069 ntTSL 214.25□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 HCLS1-209ENST00000488033 584 ntTSL 414.25□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 AGAP5-202ENST00000443782 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 ALKBH6-207ENST00000468004 818 ntTSL 514.08□□□□□ -0.165e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 NFXL1-201ENST00000329043 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 ALKBH6-203ENST00000392183 1004 ntTSL 1 (best)13.9□□□□□ -0.185e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 ATP11A-203ENST00000415301 550 ntTSL 413.82□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 HDAC6-229ENST00000486665 598 ntTSL 213.77□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.232e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 HCLS1-211ENST00000495491 1219 ntTSL 213.53□□□□□ -0.242e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 PACS1-210ENST00000529795 448 ntTSL 213.45□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 NFXL1-202ENST00000381538 3728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 NFXL1-206ENST00000507489 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 RPL17-C18orf32-201ENST00000332968 948 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 NBEAL2-202ENST00000423436 765 ntTSL 312.98□□□□□ -0.332e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 NDRG1-226ENST00000523642 507 ntTSL 312.91□□□□□ -0.342e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 ACP1-202ENST00000272067 1552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 RPL17-220ENST00000615479 586 ntTSL 512.82□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 ZNF672-207ENST00000515369 500 ntTSL 512.81□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 FAM204A-202ENST00000369172 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 FAM204A-208ENST00000487269 659 ntTSL 212.68□□□□□ -0.382e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 HDAC6-228ENST00000486227 4718 ntTSL 212.54□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 CTDSPL-202ENST00000310189 1482 ntTSL 512.24□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 HCLS1-206ENST00000479994 450 ntTSL 312.23□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 PCMTD2-205ENST00000608844 528 ntTSL 412.23□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 ACP1-206ENST00000413140 689 ntTSL 212.21□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 ACP1-210ENST00000463831 1015 ntTSL 212.21□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 RPL28-201ENST00000344063 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.482e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 INTS10-206ENST00000520670 623 ntTSL 511.98□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 ACP1-209ENST00000453390 577 ntTSL 1 (best)11.97□□□□□ -0.492e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 LAMTOR4-207ENST00000474141 519 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.532e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 INTS10-209ENST00000521008 572 ntTSL 311.6□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 HCLS1-204ENST00000468693 502 ntTSL 311.49□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 DNM1L-223ENST00000550093 570 ntTSL 211.48□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 33.6
UTP3Q9NQZ2 ALKBH6-205ENST00000462793 700 ntTSL 311.33□□□□□ -0.65e-7■■■■■ 33.6
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