RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487290.5

HCLS1-208, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,078 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-208	ENST00000487290	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		40.26	■■■■■ 4.04
HCLS1-208	ENST00000487290	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		35.83	■■■■□ 3.33
HCLS1-208	ENST00000487290	ABCC9	O60706	1549 aa		34.52	■■■■□ 3.12
HCLS1-208	ENST00000487290	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	33.65	■■■□□ 2.98
HCLS1-208	ENST00000487290	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		33.56	■■■□□ 2.96
HCLS1-208	ENST00000487290	NACAD	O15069	1562 aa		33.55	■■■□□ 2.96
HCLS1-208	ENST00000487290	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		33.48	■■■□□ 2.95
HCLS1-208	ENST00000487290	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		33.48	■■■□□ 2.95
HCLS1-208	ENST00000487290	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		33.08	■■■□□ 2.89
HCLS1-208	ENST00000487290	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		32.8	■■■□□ 2.84
HCLS1-208	ENST00000487290	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		32.5	■■■□□ 2.79
HCLS1-208	ENST00000487290	SCRIB	Q14160	1630 aa		32.49	■■■□□ 2.79
HCLS1-208	ENST00000487290	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		32.32	■■■□□ 2.76
HCLS1-208	ENST00000487290	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	32.17	■■■□□ 2.74
HCLS1-208	ENST00000487290	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	31.59	■■■□□ 2.65
HCLS1-208	ENST00000487290	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		31.42	■■■□□ 2.62
HCLS1-208	ENST00000487290	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		31.36	■■■□□ 2.61
HCLS1-208	ENST00000487290	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		31.25	■■■□□ 2.59
HCLS1-208	ENST00000487290	SMARCA4	P51532	1647 aa		31.21	■■■□□ 2.59
HCLS1-208	ENST00000487290	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	31.21	■■■□□ 2.59
HCLS1-208	ENST00000487290	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		31.02	■■■□□ 2.56
HCLS1-208	ENST00000487290	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		30.98	■■■□□ 2.55
HCLS1-208	ENST00000487290	SMARCA2	P51531	1590 aa		30.95	■■■□□ 2.54
HCLS1-208	ENST00000487290	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		30.95	■■■□□ 2.54
HCLS1-208	ENST00000487290	NCAPD3	P42695	1498 aa		30.93	■■■□□ 2.54
HCLS1-208	ENST00000487290	HMGXB3	Q12766	1538 aa		30.87	■■■□□ 2.53
HCLS1-208	ENST00000487290	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	30.71	■■■□□ 2.51
HCLS1-208	ENST00000487290	WIZ	O95785	1651 aa		30.65	■■■□□ 2.5
HCLS1-208	ENST00000487290	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	30.65	■■■□□ 2.5
HCLS1-208	ENST00000487290	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	30.42	■■■□□ 2.46
HCLS1-208	ENST00000487290	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		30.09	■■■□□ 2.41
HCLS1-208	ENST00000487290	NES	P48681	1621 aa		29.98	■■■□□ 2.39
HCLS1-208	ENST00000487290	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		29.97	■■■□□ 2.39
HCLS1-208	ENST00000487290	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		29.96	■■■□□ 2.39
HCLS1-208	ENST00000487290	CFTR	P13569	1480 aa		29.9	■■■□□ 2.38
HCLS1-208	ENST00000487290	PRDM2	Q13029	1718 aa		29.82	■■■□□ 2.36
HCLS1-208	ENST00000487290	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	29.79	■■■□□ 2.36
HCLS1-208	ENST00000487290	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		29.78	■■■□□ 2.36
HCLS1-208	ENST00000487290	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		29.73	■■■□□ 2.35
HCLS1-208	ENST00000487290	ERCC6	Q03468	1493 aa		29.73	■■■□□ 2.35
HCLS1-208	ENST00000487290	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	29.64	■■■□□ 2.34
HCLS1-208	ENST00000487290	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		29.61	■■■□□ 2.33
HCLS1-208	ENST00000487290	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		29.56	■■■□□ 2.32
HCLS1-208	ENST00000487290	CUX2	O14529	1486 aa		29.5	■■■□□ 2.31
HCLS1-208	ENST00000487290	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		29.49	■■■□□ 2.31
HCLS1-208	ENST00000487290	WDR62	O43379	1518 aa		29.47	■■■□□ 2.31
HCLS1-208	ENST00000487290	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	29.33	■■■□□ 2.29
HCLS1-208	ENST00000487290	ABCC8	Q09428	1581 aa		29.24	■■■□□ 2.27
HCLS1-208	ENST00000487290	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		29.23	■■■□□ 2.27
HCLS1-208	ENST00000487290	TOPBP1	Q92547	1522 aa		29.2	■■■□□ 2.26
HCLS1-208	ENST00000487290	CUX1	P39880	1505 aa		29.07	■■■□□ 2.24
HCLS1-208	ENST00000487290	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		28.98	■■■□□ 2.23
HCLS1-208	ENST00000487290	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
HCLS1-208	ENST00000487290	IFT140	Q96RY7	1462 aa		28.97	■■■□□ 2.23
HCLS1-208	ENST00000487290	TOP2B	Q02880	1626 aa		28.94	■■■□□ 2.22
HCLS1-208	ENST00000487290	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	28.93	■■■□□ 2.22
HCLS1-208	ENST00000487290	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	28.93	■■■□□ 2.22
HCLS1-208	ENST00000487290	SYNJ1	O43426	1573 aa		28.9	■■■□□ 2.22
HCLS1-208	ENST00000487290	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		28.9	■■■□□ 2.22
HCLS1-208	ENST00000487290	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.83	■■■□□ 2.21
HCLS1-208	ENST00000487290	SOGA1	O94964	1423 aa		28.76	■■■□□ 2.19
HCLS1-208	ENST00000487290	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
HCLS1-208	ENST00000487290	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		28.74	■■■□□ 2.19
HCLS1-208	ENST00000487290	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
HCLS1-208	ENST00000487290	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		28.71	■■■□□ 2.19
HCLS1-208	ENST00000487290	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		28.62	■■■□□ 2.17
HCLS1-208	ENST00000487290	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	28.56	■■■□□ 2.16
HCLS1-208	ENST00000487290	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	28.51	■■■□□ 2.16
HCLS1-208	ENST00000487290	PBRM1	Q86U86	1689 aa		28.5	■■■□□ 2.15
HCLS1-208	ENST00000487290	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		28.48	■■■□□ 2.15
HCLS1-208	ENST00000487290	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.47	■■■□□ 2.15
HCLS1-208	ENST00000487290	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	28.42	■■■□□ 2.14
HCLS1-208	ENST00000487290	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		28.38	■■■□□ 2.13
HCLS1-208	ENST00000487290	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	28.38	■■■□□ 2.13
HCLS1-208	ENST00000487290	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.37	■■■□□ 2.13
HCLS1-208	ENST00000487290	CHD1	O14646	1710 aa		28.32	■■■□□ 2.12
HCLS1-208	ENST00000487290	ADAMTS12	P58397	1594 aa		28.3	■■■□□ 2.12
HCLS1-208	ENST00000487290	KIF27	Q86VH2	1401 aa		28.29	■■■□□ 2.12
HCLS1-208	ENST00000487290	SYNJ2	O15056	1496 aa		28.27	■■■□□ 2.12
HCLS1-208	ENST00000487290	TRIM41	Q8WV44	630 aa		28.21	■■■□□ 2.11
HCLS1-208	ENST00000487290	CUL7	Q14999	1698 aa		28.19	■■■□□ 2.1
HCLS1-208	ENST00000487290	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		28.18	■■■□□ 2.1
HCLS1-208	ENST00000487290	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		28.15	■■■□□ 2.1
HCLS1-208	ENST00000487290	IGF1R	P08069	1367 aa		28.14	■■■□□ 2.1
HCLS1-208	ENST00000487290	GRIN2A	Q12879	1464 aa		28.12	■■■□□ 2.09
HCLS1-208	ENST00000487290	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		28.11	■■■□□ 2.09
HCLS1-208	ENST00000487290	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		28.1	■■■□□ 2.09
HCLS1-208	ENST00000487290	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		28.08	■■■□□ 2.08
HCLS1-208	ENST00000487290	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		28.06	■■■□□ 2.08
HCLS1-208	ENST00000487290	NUP160	Q12769	1436 aa		28.04	■■■□□ 2.08
HCLS1-208	ENST00000487290	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.04	■■■□□ 2.08
HCLS1-208	ENST00000487290	EEA1	Q15075	1411 aa		28	■■■□□ 2.07
HCLS1-208	ENST00000487290	CEP170	Q5SW79	1584 aa		27.99	■■■□□ 2.07
HCLS1-208	ENST00000487290	FBLN2	P98095	1184 aa		27.97	■■■□□ 2.07
HCLS1-208	ENST00000487290	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		27.95	■■■□□ 2.06
HCLS1-208	ENST00000487290	PRX	Q9BXM0	1461 aa		27.89	■■■□□ 2.06
HCLS1-208	ENST00000487290	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		27.87	■■■□□ 2.05
HCLS1-208	ENST00000487290	SHROOM2	Q13796	1616 aa		27.86	■■■□□ 2.05
HCLS1-208	ENST00000487290	ARHGEF11	O15085	1522 aa		27.81	■■■□□ 2.04
HCLS1-208	ENST00000487290	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		27.79	■■■□□ 2.04

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