RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529795.1

PACS1-210, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene PACS1, Length 448 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-210ENST00000529795 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31■■■□□ 2.55
PACS1-210ENST00000529795 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.72■■■□□ 2.03
PACS1-210ENST00000529795 ABCC9O60706 1549 aa27.19■■□□□ 1.94
PACS1-210ENST00000529795 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.2■■□□□ 1.78
PACS1-210ENST00000529795 NACADO15069 1562 aa26.12■■□□□ 1.77
PACS1-210ENST00000529795 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.03■■□□□ 1.76
PACS1-210ENST00000529795 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.92■■□□□ 1.74
PACS1-210ENST00000529795 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
PACS1-210ENST00000529795 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.71■■□□□ 1.71
PACS1-210ENST00000529795 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.51■■□□□ 1.68
PACS1-210ENST00000529795 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.36■■□□□ 1.65
PACS1-210ENST00000529795 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.27■■□□□ 1.64
PACS1-210ENST00000529795 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.17■■□□□ 1.62
PACS1-210ENST00000529795 SCRIBQ14160 1630 aa25.16■■□□□ 1.62
PACS1-210ENST00000529795 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.05■■□□□ 1.6
PACS1-210ENST00000529795 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
PACS1-210ENST00000529795 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.61■■□□□ 1.53
PACS1-210ENST00000529795 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.5■■□□□ 1.51
PACS1-210ENST00000529795 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
PACS1-210ENST00000529795 SMARCA4P51532 1647 aa24.1■■□□□ 1.45
PACS1-210ENST00000529795 SMARCA2P51531 1590 aa24.06■■□□□ 1.44
PACS1-210ENST00000529795 NCAPD3P42695 1498 aa24.06■■□□□ 1.44
PACS1-210ENST00000529795 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24■■□□□ 1.43
PACS1-210ENST00000529795 HMGXB3Q12766 1538 aa23.94■■□□□ 1.42
PACS1-210ENST00000529795 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.89■■□□□ 1.41
PACS1-210ENST00000529795 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
PACS1-210ENST00000529795 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.83■■□□□ 1.41
PACS1-210ENST00000529795 WIZO95785 1651 aa23.58■■□□□ 1.37
PACS1-210ENST00000529795 ERCC6Q03468 1493 aa23.55■■□□□ 1.36
PACS1-210ENST00000529795 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
PACS1-210ENST00000529795 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.5■■□□□ 1.35
PACS1-210ENST00000529795 NESP48681 1621 aa23.43■■□□□ 1.34
PACS1-210ENST00000529795 CUX2O14529 1486 aa23.38■■□□□ 1.33
PACS1-210ENST00000529795 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.37■■□□□ 1.33
PACS1-210ENST00000529795 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PACS1-210ENST00000529795 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.36■■□□□ 1.33
PACS1-210ENST00000529795 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.22■■□□□ 1.31
PACS1-210ENST00000529795 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
PACS1-210ENST00000529795 CFTRP13569 1480 aa23.15■■□□□ 1.3
PACS1-210ENST00000529795 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.08■■□□□ 1.29
PACS1-210ENST00000529795 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.06■■□□□ 1.28
PACS1-210ENST00000529795 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.06■■□□□ 1.28
PACS1-210ENST00000529795 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.06■■□□□ 1.28
PACS1-210ENST00000529795 PRDM2Q13029 1718 aa23.03■■□□□ 1.28
PACS1-210ENST00000529795 WDR62O43379 1518 aa22.98■■□□□ 1.27
PACS1-210ENST00000529795 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.86■■□□□ 1.25
PACS1-210ENST00000529795 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PACS1-210ENST00000529795 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PACS1-210ENST00000529795 ABCC8Q09428 1581 aa22.79■■□□□ 1.24
PACS1-210ENST00000529795 TOPBP1Q92547 1522 aa22.66■■□□□ 1.22
PACS1-210ENST00000529795 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.65■■□□□ 1.22
PACS1-210ENST00000529795 IFT140Q96RY7 1462 aa22.62■■□□□ 1.21
PACS1-210ENST00000529795 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
PACS1-210ENST00000529795 OSCARQ8IYS5 282 aa22.42■■□□□ 1.18
PACS1-210ENST00000529795 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
PACS1-210ENST00000529795 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
PACS1-210ENST00000529795 SOGA1O94964 1423 aa22.4■■□□□ 1.18
PACS1-210ENST00000529795 CUX1P39880 1505 aa22.37■■□□□ 1.17
PACS1-210ENST00000529795 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
PACS1-210ENST00000529795 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.36■■□□□ 1.17
PACS1-210ENST00000529795 WDR97A6NE52 1622 aa22.36■■□□□ 1.17
PACS1-210ENST00000529795 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.3■■□□□ 1.166e-7■■■■■ 27.1
PACS1-210ENST00000529795 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.3■■□□□ 1.16
PACS1-210ENST00000529795 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PACS1-210ENST00000529795 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
PACS1-210ENST00000529795 TOP2BQ02880 1626 aa22.2■■□□□ 1.15
PACS1-210ENST00000529795 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.2■■□□□ 1.15
PACS1-210ENST00000529795 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS1-210ENST00000529795 GRIN2BQ13224 1484 aa22.17■■□□□ 1.14
PACS1-210ENST00000529795 FBLN2P98095 1184 aa22.16■■□□□ 1.14
PACS1-210ENST00000529795 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PACS1-210ENST00000529795 CHD1O14646 1710 aa22.14■■□□□ 1.14
PACS1-210ENST00000529795 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.14■■□□□ 1.13
PACS1-210ENST00000529795 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.1■■□□□ 1.13
PACS1-210ENST00000529795 SYNJ1O43426 1573 aa22.1■■□□□ 1.13
PACS1-210ENST00000529795 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PACS1-210ENST00000529795 PBRM1Q86U86 1689 aa22.09■■□□□ 1.13
PACS1-210ENST00000529795 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.06■■□□□ 1.12
PACS1-210ENST00000529795 SYNJ2O15056 1496 aa22.04■■□□□ 1.12
PACS1-210ENST00000529795 TRIM41Q8WV44 630 aa21.99■■□□□ 1.11
PACS1-210ENST00000529795 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.97■■□□□ 1.11
PACS1-210ENST00000529795 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.97■■□□□ 1.11
PACS1-210ENST00000529795 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.97■■□□□ 1.11
PACS1-210ENST00000529795 ARHGEF11O15085 1522 aa21.95■■□□□ 1.1
PACS1-210ENST00000529795 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.94■■□□□ 1.1
PACS1-210ENST00000529795 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.89■■□□□ 1.1
PACS1-210ENST00000529795 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.87■■□□□ 1.09
PACS1-210ENST00000529795 ADAMTS12P58397 1594 aa21.87■■□□□ 1.09
PACS1-210ENST00000529795 GRIN2AQ12879 1464 aa21.85■■□□□ 1.09
PACS1-210ENST00000529795 KIF27Q86VH2 1401 aa21.82■■□□□ 1.08
PACS1-210ENST00000529795 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.79■■□□□ 1.08
PACS1-210ENST00000529795 NUP160Q12769 1436 aa21.75■■□□□ 1.07
PACS1-210ENST00000529795 CUL7Q14999 1698 aa21.72■■□□□ 1.07
PACS1-210ENST00000529795 ARAP1Q96P48 1450 aa21.71■■□□□ 1.07
PACS1-210ENST00000529795 IGF1RP08069 1367 aa21.7■■□□□ 1.06
PACS1-210ENST00000529795 CEP170Q5SW79 1584 aa21.7■■□□□ 1.06
PACS1-210ENST00000529795 SHROOM2Q13796 1616 aa21.61■■□□□ 1.05
PACS1-210ENST00000529795 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa21.61■■□□□ 1.05
PACS1-210ENST00000529795 JPH4Q96JJ6 628 aa21.59■■□□□ 1.05
PACS1-210ENST00000529795 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa21.55■■□□□ 1.04
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