RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468693.5

HCLS1-204, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 3

Gene HCLS1, Length 502 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-204ENST00000468693 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.77■■■□□ 2.2
HCLS1-204ENST00000468693 ABCC9O60706 1549 aa27.31■■□□□ 1.96
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HCLS1-204ENST00000468693 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.24■■□□□ 1.79
HCLS1-204ENST00000468693 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.47■■□□□ 1.67
HCLS1-204ENST00000468693 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.64
HCLS1-204ENST00000468693 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.06■■□□□ 1.6
HCLS1-204ENST00000468693 NACADO15069 1562 aa25.03■■□□□ 1.6
HCLS1-204ENST00000468693 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.95■■□□□ 1.58
HCLS1-204ENST00000468693 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.84■■□□□ 1.57
HCLS1-204ENST00000468693 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.74■■□□□ 1.55
HCLS1-204ENST00000468693 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.68■■□□□ 1.54
HCLS1-204ENST00000468693 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.61■■□□□ 1.53
HCLS1-204ENST00000468693 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.3■■□□□ 1.48
HCLS1-204ENST00000468693 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
HCLS1-204ENST00000468693 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.27■■□□□ 1.48
HCLS1-204ENST00000468693 SCRIBQ14160 1630 aa23.92■■□□□ 1.42
HCLS1-204ENST00000468693 CUX2O14529 1486 aa23.88■■□□□ 1.41
HCLS1-204ENST00000468693 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.64■■□□□ 1.38
HCLS1-204ENST00000468693 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
HCLS1-204ENST00000468693 ERCC6Q03468 1493 aa23.62■■□□□ 1.37
HCLS1-204ENST00000468693 TRIM41Q8WV44 630 aa23.6■■□□□ 1.37
HCLS1-204ENST00000468693 NESP48681 1621 aa23.2■■□□□ 1.3
HCLS1-204ENST00000468693 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
HCLS1-204ENST00000468693 NCAPD3P42695 1498 aa23.13■■□□□ 1.29
HCLS1-204ENST00000468693 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.95■■□□□ 1.26
HCLS1-204ENST00000468693 SMARCA2P51531 1590 aa22.94■■□□□ 1.26
HCLS1-204ENST00000468693 HMGXB3Q12766 1538 aa22.87■■□□□ 1.25
HCLS1-204ENST00000468693 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.84■■□□□ 1.25
HCLS1-204ENST00000468693 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.77■■□□□ 1.24
HCLS1-204ENST00000468693 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
HCLS1-204ENST00000468693 SMARCA4P51532 1647 aa22.68■■□□□ 1.22
HCLS1-204ENST00000468693 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
HCLS1-204ENST00000468693 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.66■■□□□ 1.22
HCLS1-204ENST00000468693 OSCARQ8IYS5 282 aa22.61■■□□□ 1.21
HCLS1-204ENST00000468693 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.58■■□□□ 1.2
HCLS1-204ENST00000468693 WDR62O43379 1518 aa22.56■■□□□ 1.2
HCLS1-204ENST00000468693 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.51■■□□□ 1.19
HCLS1-204ENST00000468693 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.51■■□□□ 1.19
HCLS1-204ENST00000468693 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.51■■□□□ 1.19
HCLS1-204ENST00000468693 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.42■■□□□ 1.18
HCLS1-204ENST00000468693 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.38■■□□□ 1.17
HCLS1-204ENST00000468693 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
HCLS1-204ENST00000468693 ARHGEF11O15085 1522 aa22.32■■□□□ 1.16
HCLS1-204ENST00000468693 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
HCLS1-204ENST00000468693 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.28■■□□□ 1.16
HCLS1-204ENST00000468693 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.2■■□□□ 1.14
HCLS1-204ENST00000468693 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.2■■□□□ 1.14
HCLS1-204ENST00000468693 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.16■■□□□ 1.14
HCLS1-204ENST00000468693 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
HCLS1-204ENST00000468693 ARAP1Q96P48 1450 aa22.05■■□□□ 1.12
HCLS1-204ENST00000468693 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
HCLS1-204ENST00000468693 CFTRP13569 1480 aa21.92■■□□□ 1.1
HCLS1-204ENST00000468693 WIZO95785 1651 aa21.89■■□□□ 1.1
HCLS1-204ENST00000468693 IFT140Q96RY7 1462 aa21.84■■□□□ 1.09
HCLS1-204ENST00000468693 CHD1O14646 1710 aa21.83■■□□□ 1.09
HCLS1-204ENST00000468693 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
HCLS1-204ENST00000468693 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
HCLS1-204ENST00000468693 FBLN2P98095 1184 aa21.68■■□□□ 1.06
HCLS1-204ENST00000468693 TOPBP1Q92547 1522 aa21.64■■□□□ 1.05
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HCLS1-204ENST00000468693 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
HCLS1-204ENST00000468693 PRDM2Q13029 1718 aa21.6■■□□□ 1.05
HCLS1-204ENST00000468693 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.55■■□□□ 1.04
HCLS1-204ENST00000468693 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HCLS1-204ENST00000468693 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
HCLS1-204ENST00000468693 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.45■■□□□ 1.02
HCLS1-204ENST00000468693 ABCC8Q09428 1581 aa21.43■■□□□ 1.02
HCLS1-204ENST00000468693 SYNJ1O43426 1573 aa21.4■■□□□ 1.02
HCLS1-204ENST00000468693 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.39■■□□□ 1.02
HCLS1-204ENST00000468693 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.39■■□□□ 1.01
HCLS1-204ENST00000468693 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
HCLS1-204ENST00000468693 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
HCLS1-204ENST00000468693 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.32■■□□□ 1
HCLS1-204ENST00000468693 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
HCLS1-204ENST00000468693 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.28■■□□□ 1
HCLS1-204ENST00000468693 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
HCLS1-204ENST00000468693 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa21.22■□□□□ 0.99
HCLS1-204ENST00000468693 SOGA1O94964 1423 aa21.21■□□□□ 0.99
HCLS1-204ENST00000468693 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.2■□□□□ 0.98
HCLS1-204ENST00000468693 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.2■□□□□ 0.98
HCLS1-204ENST00000468693 SYNJ2O15056 1496 aa21.2■□□□□ 0.98
HCLS1-204ENST00000468693 WDR97A6NE52 1622 aa21.15■□□□□ 0.98
HCLS1-204ENST00000468693 GRIN2BQ13224 1484 aa21.13■□□□□ 0.97
HCLS1-204ENST00000468693 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.08■□□□□ 0.97
HCLS1-204ENST00000468693 PBRM1Q86U86 1689 aa21.02■□□□□ 0.96
HCLS1-204ENST00000468693 CEP170Q5SW79 1584 aa21.01■□□□□ 0.95
HCLS1-204ENST00000468693 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.95■□□□□ 0.94
HCLS1-204ENST00000468693 KDM6BO15054 1643 aa20.95■□□□□ 0.94
HCLS1-204ENST00000468693 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.92■□□□□ 0.94
HCLS1-204ENST00000468693 CUX1P39880 1505 aa20.92■□□□□ 0.94
HCLS1-204ENST00000468693 GRIN2AQ12879 1464 aa20.89■□□□□ 0.94
HCLS1-204ENST00000468693 SHROOM2Q13796 1616 aa20.89■□□□□ 0.93
HCLS1-204ENST00000468693 DIP2BQ9P265 1576 aa20.87■□□□□ 0.93
HCLS1-204ENST00000468693 HECW2Q9P2P5 1572 aa20.86■□□□□ 0.93
HCLS1-204ENST00000468693 NUP160Q12769 1436 aa20.85■□□□□ 0.93
HCLS1-204ENST00000468693 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.84■□□□□ 0.93
HCLS1-204ENST00000468693 ADGRL1O94910 1474 aa20.81■□□□□ 0.92
HCLS1-204ENST00000468693 MAPKBP1O60336 1514 aa20.79■□□□□ 0.92
HCLS1-204ENST00000468693 ADAMTS12P58397 1594 aa20.77■□□□□ 0.92
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