RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481314.5

HCLS1-207, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2

Gene HCLS1, Length 1,069 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-207ENST00000481314 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.5■■■■□ 3.11
HCLS1-207ENST00000481314 ABCC9O60706 1549 aa31.87■■■□□ 2.69
HCLS1-207ENST00000481314 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.2■■■□□ 2.59
HCLS1-207ENST00000481314 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.44■■■□□ 2.46
HCLS1-207ENST00000481314 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.03■■■□□ 2.4
HCLS1-207ENST00000481314 NACADO15069 1562 aa29.66■■■□□ 2.34
HCLS1-207ENST00000481314 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.6■■■□□ 2.33
HCLS1-207ENST00000481314 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.52■■■□□ 2.32
HCLS1-207ENST00000481314 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.36■■■□□ 2.29
HCLS1-207ENST00000481314 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.16■■■□□ 2.26
HCLS1-207ENST00000481314 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.01■■■□□ 2.23
HCLS1-207ENST00000481314 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.76■■■□□ 2.19
HCLS1-207ENST00000481314 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.73■■■□□ 2.19
HCLS1-207ENST00000481314 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.66■■■□□ 2.18
HCLS1-207ENST00000481314 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
HCLS1-207ENST00000481314 SCRIBQ14160 1630 aa28.44■■■□□ 2.14
HCLS1-207ENST00000481314 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
HCLS1-207ENST00000481314 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.42■■■□□ 2.14
HCLS1-207ENST00000481314 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.4■■■□□ 2.14
HCLS1-207ENST00000481314 CUX2O14529 1486 aa27.68■■■□□ 2.02
HCLS1-207ENST00000481314 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
HCLS1-207ENST00000481314 ERCC6Q03468 1493 aa27.57■■■□□ 2
HCLS1-207ENST00000481314 NCAPD3P42695 1498 aa27.38■■□□□ 1.97
HCLS1-207ENST00000481314 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.24■■□□□ 1.95
HCLS1-207ENST00000481314 NESP48681 1621 aa27.19■■□□□ 1.94
HCLS1-207ENST00000481314 SMARCA2P51531 1590 aa27.12■■□□□ 1.93
HCLS1-207ENST00000481314 HMGXB3Q12766 1538 aa27.11■■□□□ 1.93
HCLS1-207ENST00000481314 SMARCA4P51532 1647 aa27.05■■□□□ 1.92
HCLS1-207ENST00000481314 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
HCLS1-207ENST00000481314 TRIM41Q8WV44 630 aa26.97■■□□□ 1.91
HCLS1-207ENST00000481314 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
HCLS1-207ENST00000481314 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.88■■□□□ 1.89
HCLS1-207ENST00000481314 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
HCLS1-207ENST00000481314 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.81■■□□□ 1.88
HCLS1-207ENST00000481314 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.77■■□□□ 1.88
HCLS1-207ENST00000481314 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.75■■□□□ 1.87
HCLS1-207ENST00000481314 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.58■■□□□ 1.85
HCLS1-207ENST00000481314 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.56■■□□□ 1.84
HCLS1-207ENST00000481314 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.55■■□□□ 1.84
HCLS1-207ENST00000481314 WDR62O43379 1518 aa26.49■■□□□ 1.83
HCLS1-207ENST00000481314 OSCARQ8IYS5 282 aa26.37■■□□□ 1.81
HCLS1-207ENST00000481314 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.34■■□□□ 1.81
HCLS1-207ENST00000481314 WIZO95785 1651 aa26.25■■□□□ 1.79
HCLS1-207ENST00000481314 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.25■■□□□ 1.79
HCLS1-207ENST00000481314 CFTRP13569 1480 aa26.1■■□□□ 1.77
HCLS1-207ENST00000481314 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.06■■□□□ 1.76
HCLS1-207ENST00000481314 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.06■■□□□ 1.76
HCLS1-207ENST00000481314 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.06■■□□□ 1.76
HCLS1-207ENST00000481314 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
HCLS1-207ENST00000481314 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.98■■□□□ 1.75
HCLS1-207ENST00000481314 ARHGEF11O15085 1522 aa25.91■■□□□ 1.74
HCLS1-207ENST00000481314 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
HCLS1-207ENST00000481314 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
HCLS1-207ENST00000481314 IFT140Q96RY7 1462 aa25.83■■□□□ 1.73
HCLS1-207ENST00000481314 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.82■■□□□ 1.72
HCLS1-207ENST00000481314 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
HCLS1-207ENST00000481314 PRDM2Q13029 1718 aa25.8■■□□□ 1.72
HCLS1-207ENST00000481314 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
HCLS1-207ENST00000481314 TOPBP1Q92547 1522 aa25.68■■□□□ 1.7
HCLS1-207ENST00000481314 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
HCLS1-207ENST00000481314 CHD1O14646 1710 aa25.62■■□□□ 1.69
HCLS1-207ENST00000481314 ARAP1Q96P48 1450 aa25.61■■□□□ 1.69
HCLS1-207ENST00000481314 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.6■■□□□ 1.69
HCLS1-207ENST00000481314 ABCC8Q09428 1581 aa25.58■■□□□ 1.69
HCLS1-207ENST00000481314 FBLN2P98095 1184 aa25.58■■□□□ 1.69
HCLS1-207ENST00000481314 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.57■■□□□ 1.68
HCLS1-207ENST00000481314 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.52■■□□□ 1.68
HCLS1-207ENST00000481314 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
HCLS1-207ENST00000481314 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
HCLS1-207ENST00000481314 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.33■■□□□ 1.65
HCLS1-207ENST00000481314 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
HCLS1-207ENST00000481314 SOGA1O94964 1423 aa25.28■■□□□ 1.64
HCLS1-207ENST00000481314 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.28■■□□□ 1.64
HCLS1-207ENST00000481314 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.27■■□□□ 1.64
HCLS1-207ENST00000481314 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
HCLS1-207ENST00000481314 SYNJ1O43426 1573 aa25.23■■□□□ 1.63
HCLS1-207ENST00000481314 WDR97A6NE52 1622 aa25.16■■□□□ 1.62
HCLS1-207ENST00000481314 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
HCLS1-207ENST00000481314 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.14■■□□□ 1.61
HCLS1-207ENST00000481314 GRIN2BQ13224 1484 aa25.11■■□□□ 1.61
HCLS1-207ENST00000481314 SYNJ2O15056 1496 aa25.09■■□□□ 1.61
HCLS1-207ENST00000481314 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.09■■□□□ 1.61
HCLS1-207ENST00000481314 CUX1P39880 1505 aa25.01■■□□□ 1.59
HCLS1-207ENST00000481314 PBRM1Q86U86 1689 aa24.97■■□□□ 1.59
HCLS1-207ENST00000481314 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.86■■□□□ 1.57
HCLS1-207ENST00000481314 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.81■■□□□ 1.56
HCLS1-207ENST00000481314 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.81■■□□□ 1.56
HCLS1-207ENST00000481314 GRIN2AQ12879 1464 aa24.78■■□□□ 1.56
HCLS1-207ENST00000481314 CEP170Q5SW79 1584 aa24.76■■□□□ 1.55
HCLS1-207ENST00000481314 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.71■■□□□ 1.55
HCLS1-207ENST00000481314 NUP160Q12769 1436 aa24.7■■□□□ 1.55
HCLS1-207ENST00000481314 ADAMTS12P58397 1594 aa24.68■■□□□ 1.54
HCLS1-207ENST00000481314 SHROOM2Q13796 1616 aa24.65■■□□□ 1.54
HCLS1-207ENST00000481314 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.61■■□□□ 1.53
HCLS1-207ENST00000481314 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.61■■□□□ 1.53
HCLS1-207ENST00000481314 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
HCLS1-207ENST00000481314 FAM69CQ0P6D2 419 aa24.56■■□□□ 1.52
HCLS1-207ENST00000481314 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.51■■□□□ 1.51
HCLS1-207ENST00000481314 JPH4Q96JJ6 628 aa24.51■■□□□ 1.51
HCLS1-207ENST00000481314 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 121.8 ms