RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.71■■■■□ 3.15
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.87■■■□□ 2.37
HCLS1-202ENST00000428394 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
HCLS1-202ENST00000428394 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.96■■■□□ 2.23
HCLS1-202ENST00000428394 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.87■■■□□ 2.21
HCLS1-202ENST00000428394 ABCC9O60706 1549 aa28.73■■■□□ 2.19
HCLS1-202ENST00000428394 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
HCLS1-202ENST00000428394 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.17■■■□□ 2.1
HCLS1-202ENST00000428394 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.05■■■□□ 2.08
HCLS1-202ENST00000428394 NACADO15069 1562 aa27.88■■■□□ 2.05
HCLS1-202ENST00000428394 DCAF8L2P0C7V8 631 aa27.87■■■□□ 2.05
HCLS1-202ENST00000428394 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.77■■■□□ 2.04
HCLS1-202ENST00000428394 HRCP23327 699 aa27.73■■■□□ 2.03
HCLS1-202ENST00000428394 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.39■■□□□ 1.98
HCLS1-202ENST00000428394 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
HCLS1-202ENST00000428394 SCRIBQ14160 1630 aa27.36■■□□□ 1.97
HCLS1-202ENST00000428394 PCGF6Q9BYE7 350 aa27.24■■□□□ 1.95
HCLS1-202ENST00000428394 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.21■■□□□ 1.95
HCLS1-202ENST00000428394 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.08■■□□□ 1.93
HCLS1-202ENST00000428394 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.98■■□□□ 1.91
HCLS1-202ENST00000428394 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.92■■□□□ 1.9
HCLS1-202ENST00000428394 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
HCLS1-202ENST00000428394 TRIM41Q8WV44 630 aa26.87■■□□□ 1.89
HCLS1-202ENST00000428394 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
HCLS1-202ENST00000428394 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.79■■□□□ 1.88
HCLS1-202ENST00000428394 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.75■■□□□ 1.87
HCLS1-202ENST00000428394 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.72■■□□□ 1.87
HCLS1-202ENST00000428394 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
HCLS1-202ENST00000428394 WIZO95785 1651 aa26.64■■□□□ 1.86
HCLS1-202ENST00000428394 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
HCLS1-202ENST00000428394 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
HCLS1-202ENST00000428394 SMARCA4P51532 1647 aa26.42■■□□□ 1.82
HCLS1-202ENST00000428394 EEA1Q15075 1411 aa26.27■■□□□ 1.8
HCLS1-202ENST00000428394 SMARCA2P51531 1590 aa26.27■■□□□ 1.8
HCLS1-202ENST00000428394 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.25■■□□□ 1.79
HCLS1-202ENST00000428394 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.16■■□□□ 1.78
HCLS1-202ENST00000428394 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.13■■□□□ 1.77
HCLS1-202ENST00000428394 TNIKQ9UKE5 1360 aa26.03■■□□□ 1.76
HCLS1-202ENST00000428394 ABCC8Q09428 1581 aa25.99■■□□□ 1.75
HCLS1-202ENST00000428394 CEP162Q5TB80 1403 aa25.93■■□□□ 1.74
HCLS1-202ENST00000428394 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.9■■□□□ 1.74
HCLS1-202ENST00000428394 GOLGA3Q08378 1498 aa25.86■■□□□ 1.73
HCLS1-202ENST00000428394 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
HCLS1-202ENST00000428394 KIF21BO75037 1637 aa25.82■■□□□ 1.72
HCLS1-202ENST00000428394 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.79■■□□□ 1.72
HCLS1-202ENST00000428394 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.77■■□□□ 1.72
HCLS1-202ENST00000428394 SOGA1O94964 1423 aa25.76■■□□□ 1.71
HCLS1-202ENST00000428394 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.74■■□□□ 1.71
HCLS1-202ENST00000428394 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
HCLS1-202ENST00000428394 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
HCLS1-202ENST00000428394 NCAPD3P42695 1498 aa25.69■■□□□ 1.7
HCLS1-202ENST00000428394 HMGXB3Q12766 1538 aa25.67■■□□□ 1.7
HCLS1-202ENST00000428394 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.66■■□□□ 1.7
HCLS1-202ENST00000428394 SYNJ1O43426 1573 aa25.58■■□□□ 1.69
HCLS1-202ENST00000428394 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
HCLS1-202ENST00000428394 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.54■■□□□ 1.68
HCLS1-202ENST00000428394 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.53■■□□□ 1.68
HCLS1-202ENST00000428394 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
HCLS1-202ENST00000428394 TOP2BQ02880 1626 aa25.47■■□□□ 1.67
HCLS1-202ENST00000428394 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.46■■□□□ 1.67
HCLS1-202ENST00000428394 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.46■■□□□ 1.67
HCLS1-202ENST00000428394 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
HCLS1-202ENST00000428394 CLIP1P30622 1438 aa25.43■■□□□ 1.66
HCLS1-202ENST00000428394 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.41■■□□□ 1.66
HCLS1-202ENST00000428394 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
HCLS1-202ENST00000428394 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
HCLS1-202ENST00000428394 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
HCLS1-202ENST00000428394 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.23■■□□□ 1.63
HCLS1-202ENST00000428394 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.22■■□□□ 1.63
HCLS1-202ENST00000428394 PRXQ9BXM0 1461 aa25.21■■□□□ 1.63
HCLS1-202ENST00000428394 APLP2Q06481 763 aa25.16■■□□□ 1.62
HCLS1-202ENST00000428394 PRDM2Q13029 1718 aa25.11■■□□□ 1.61
HCLS1-202ENST00000428394 NEUROD1Q13562 356 aa25.08■■□□□ 1.61
HCLS1-202ENST00000428394 KIF27Q86VH2 1401 aa25.02■■□□□ 1.6
HCLS1-202ENST00000428394 ARAP1Q96P48 1450 aa25.01■■□□□ 1.59
HCLS1-202ENST00000428394 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
HCLS1-202ENST00000428394 CFTRP13569 1480 aa25■■□□□ 1.59
HCLS1-202ENST00000428394 CUX2O14529 1486 aa24.99■■□□□ 1.59
HCLS1-202ENST00000428394 CUX1P39880 1505 aa24.99■■□□□ 1.59
HCLS1-202ENST00000428394 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
HCLS1-202ENST00000428394 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.95■■□□□ 1.58
HCLS1-202ENST00000428394 CADPSQ9ULU8 1353 aa24.94■■□□□ 1.58
HCLS1-202ENST00000428394 MAP3K1Q13233 1512 aa24.93■■□□□ 1.58
HCLS1-202ENST00000428394 NESP48681 1621 aa24.88■■□□□ 1.57
HCLS1-202ENST00000428394 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
HCLS1-202ENST00000428394 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.88■■□□□ 1.57
HCLS1-202ENST00000428394 ERCC6Q03468 1493 aa24.86■■□□□ 1.57
HCLS1-202ENST00000428394 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
HCLS1-202ENST00000428394 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.76■■□□□ 1.55
HCLS1-202ENST00000428394 MYT1Q01538 1121 aa24.76■■□□□ 1.55
HCLS1-202ENST00000428394 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.7■■□□□ 1.54
HCLS1-202ENST00000428394 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.69■■□□□ 1.54
HCLS1-202ENST00000428394 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.68■■□□□ 1.54
HCLS1-202ENST00000428394 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.67■■□□□ 1.54
HCLS1-202ENST00000428394 TIAM1Q13009 1591 aa24.67■■□□□ 1.54
HCLS1-202ENST00000428394 MIER1Q8N108 512 aa24.65■■□□□ 1.54
HCLS1-202ENST00000428394 CFAP43Q8NDM7 1665 aa24.61■■□□□ 1.53
HCLS1-202ENST00000428394 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.59■■□□□ 1.53
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