RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490633.1

LAMTOR4-211, Transcript of late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 4, humanhuman

TSL 3

Gene LAMTOR4, Length 401 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR4-211ENST00000490633 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.33■■■■□ 3.25
LAMTOR4-211ENST00000490633 ABCC9O60706 1549 aa31.97■■■□□ 2.71
LAMTOR4-211ENST00000490633 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.76■■■□□ 2.67
LAMTOR4-211ENST00000490633 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.3■■■□□ 2.44
LAMTOR4-211ENST00000490633 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.11■■■□□ 2.41
LAMTOR4-211ENST00000490633 NACADO15069 1562 aa30.04■■■□□ 2.4
LAMTOR4-211ENST00000490633 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.88■■■□□ 2.37
LAMTOR4-211ENST00000490633 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.72■■■□□ 2.35
LAMTOR4-211ENST00000490633 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.69■■■□□ 2.34
LAMTOR4-211ENST00000490633 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.55■■■□□ 2.32
LAMTOR4-211ENST00000490633 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.49■■■□□ 2.31
LAMTOR4-211ENST00000490633 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
LAMTOR4-211ENST00000490633 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.13■■■□□ 2.25
LAMTOR4-211ENST00000490633 SCRIBQ14160 1630 aa29.01■■■□□ 2.23
LAMTOR4-211ENST00000490633 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.96■■■□□ 2.23
LAMTOR4-211ENST00000490633 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.86■■■□□ 2.21
LAMTOR4-211ENST00000490633 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.78■■■□□ 2.2
LAMTOR4-211ENST00000490633 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
LAMTOR4-211ENST00000490633 NCAPD3P42695 1498 aa27.73■■■□□ 2.03
LAMTOR4-211ENST00000490633 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.67■■■□□ 2.02
LAMTOR4-211ENST00000490633 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.66■■■□□ 2.02
LAMTOR4-211ENST00000490633 SMARCA4P51532 1647 aa27.62■■■□□ 2.01
LAMTOR4-211ENST00000490633 ERCC6Q03468 1493 aa27.57■■■□□ 2
LAMTOR4-211ENST00000490633 SMARCA2P51531 1590 aa27.55■■■□□ 2
LAMTOR4-211ENST00000490633 CUX2O14529 1486 aa27.54■■■□□ 2
LAMTOR4-211ENST00000490633 HMGXB3Q12766 1538 aa27.54■■■□□ 2
LAMTOR4-211ENST00000490633 NESP48681 1621 aa27.44■■□□□ 1.98
LAMTOR4-211ENST00000490633 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
LAMTOR4-211ENST00000490633 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
LAMTOR4-211ENST00000490633 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.31■■□□□ 1.96
LAMTOR4-211ENST00000490633 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.27■■□□□ 1.96
LAMTOR4-211ENST00000490633 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
LAMTOR4-211ENST00000490633 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.14■■□□□ 1.94
LAMTOR4-211ENST00000490633 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.08■■□□□ 1.92
LAMTOR4-211ENST00000490633 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.96■■□□□ 1.91
LAMTOR4-211ENST00000490633 WIZO95785 1651 aa26.95■■□□□ 1.9
LAMTOR4-211ENST00000490633 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.88■■□□□ 1.89
LAMTOR4-211ENST00000490633 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.79■■□□□ 1.88
LAMTOR4-211ENST00000490633 WDR62O43379 1518 aa26.74■■□□□ 1.87
LAMTOR4-211ENST00000490633 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.65■■□□□ 1.86
LAMTOR4-211ENST00000490633 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.62■■□□□ 1.85
LAMTOR4-211ENST00000490633 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
LAMTOR4-211ENST00000490633 CFTRP13569 1480 aa26.56■■□□□ 1.84
LAMTOR4-211ENST00000490633 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
LAMTOR4-211ENST00000490633 TRIM41Q8WV44 630 aa26.46■■□□□ 1.83
LAMTOR4-211ENST00000490633 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
LAMTOR4-211ENST00000490633 PRDM2Q13029 1718 aa26.31■■□□□ 1.8
LAMTOR4-211ENST00000490633 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.26■■□□□ 1.79
LAMTOR4-211ENST00000490633 OSCARQ8IYS5 282 aa26.22■■□□□ 1.79
LAMTOR4-211ENST00000490633 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
LAMTOR4-211ENST00000490633 TOPBP1Q92547 1522 aa26.11■■□□□ 1.77
LAMTOR4-211ENST00000490633 IFT140Q96RY7 1462 aa26.11■■□□□ 1.77
LAMTOR4-211ENST00000490633 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26■■□□□ 1.75
LAMTOR4-211ENST00000490633 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26■■□□□ 1.75
LAMTOR4-211ENST00000490633 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26■■□□□ 1.75
LAMTOR4-211ENST00000490633 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
LAMTOR4-211ENST00000490633 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.99■■□□□ 1.75
LAMTOR4-211ENST00000490633 ABCC8Q09428 1581 aa25.95■■□□□ 1.75
LAMTOR4-211ENST00000490633 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
LAMTOR4-211ENST00000490633 ARHGEF11O15085 1522 aa25.89■■□□□ 1.74
LAMTOR4-211ENST00000490633 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.86■■□□□ 1.733e-7■■■■■ 31.1
LAMTOR4-211ENST00000490633 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
LAMTOR4-211ENST00000490633 CHD1O14646 1710 aa25.83■■□□□ 1.73
LAMTOR4-211ENST00000490633 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.77■■□□□ 1.72
LAMTOR4-211ENST00000490633 FBLN2P98095 1184 aa25.7■■□□□ 1.7
LAMTOR4-211ENST00000490633 SOGA1O94964 1423 aa25.68■■□□□ 1.7
LAMTOR4-211ENST00000490633 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
LAMTOR4-211ENST00000490633 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.67■■□□□ 1.7
LAMTOR4-211ENST00000490633 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.66■■□□□ 1.7
LAMTOR4-211ENST00000490633 ARAP1Q96P48 1450 aa25.64■■□□□ 1.69
LAMTOR4-211ENST00000490633 CUX1P39880 1505 aa25.63■■□□□ 1.69
LAMTOR4-211ENST00000490633 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.61■■□□□ 1.69
LAMTOR4-211ENST00000490633 WDR97A6NE52 1622 aa25.55■■□□□ 1.68
LAMTOR4-211ENST00000490633 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.52■■□□□ 1.68
LAMTOR4-211ENST00000490633 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
LAMTOR4-211ENST00000490633 GRIN2BQ13224 1484 aa25.47■■□□□ 1.67
LAMTOR4-211ENST00000490633 SYNJ1O43426 1573 aa25.44■■□□□ 1.66
LAMTOR4-211ENST00000490633 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
LAMTOR4-211ENST00000490633 PBRM1Q86U86 1689 aa25.42■■□□□ 1.66
LAMTOR4-211ENST00000490633 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
LAMTOR4-211ENST00000490633 SYNJ2O15056 1496 aa25.4■■□□□ 1.66
LAMTOR4-211ENST00000490633 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.37■■□□□ 1.65
LAMTOR4-211ENST00000490633 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.34■■□□□ 1.65
LAMTOR4-211ENST00000490633 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
LAMTOR4-211ENST00000490633 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.33■■□□□ 1.65
LAMTOR4-211ENST00000490633 GRIN2AQ12879 1464 aa25.17■■□□□ 1.62
LAMTOR4-211ENST00000490633 ADAMTS12P58397 1594 aa25.17■■□□□ 1.62
LAMTOR4-211ENST00000490633 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.16■■□□□ 1.62
LAMTOR4-211ENST00000490633 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.62
LAMTOR4-211ENST00000490633 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.16■■□□□ 1.62
LAMTOR4-211ENST00000490633 TOP2BQ02880 1626 aa25.14■■□□□ 1.61
LAMTOR4-211ENST00000490633 CEP170Q5SW79 1584 aa25.13■■□□□ 1.61
LAMTOR4-211ENST00000490633 NUP160Q12769 1436 aa25.08■■□□□ 1.61
LAMTOR4-211ENST00000490633 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.03■■□□□ 1.6
LAMTOR4-211ENST00000490633 SHROOM2Q13796 1616 aa25.01■■□□□ 1.59
LAMTOR4-211ENST00000490633 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.99■■□□□ 1.59
LAMTOR4-211ENST00000490633 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
LAMTOR4-211ENST00000490633 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.82■■□□□ 1.56
LAMTOR4-211ENST00000490633 JPH4Q96JJ6 628 aa24.78■■□□□ 1.56
LAMTOR4-211ENST00000490633 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.7 ms