RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477446.5

EPHB4-204, Transcript of EPH receptor B4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene EPHB4, Length 1,551 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4-204ENST00000477446 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.96■■■■□ 3.99
EPHB4-204ENST00000477446 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.31■■■■□ 3.24
EPHB4-204ENST00000477446 ABCC9O60706 1549 aa34.13■■■■□ 3.05
EPHB4-204ENST00000477446 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.38■■■□□ 2.93
EPHB4-204ENST00000477446 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.23■■■□□ 2.91
EPHB4-204ENST00000477446 NACADO15069 1562 aa33.08■■■□□ 2.89
EPHB4-204ENST00000477446 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.06■■■□□ 2.88
EPHB4-204ENST00000477446 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.02■■■□□ 2.88
EPHB4-204ENST00000477446 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.01■■■□□ 2.87
EPHB4-204ENST00000477446 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.33■■■□□ 2.77
EPHB4-204ENST00000477446 SCRIBQ14160 1630 aa32.29■■■□□ 2.76
EPHB4-204ENST00000477446 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.02■■■□□ 2.72
EPHB4-204ENST00000477446 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.98■■■□□ 2.71
EPHB4-204ENST00000477446 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.88■■■□□ 2.69
EPHB4-204ENST00000477446 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
EPHB4-204ENST00000477446 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.1■■■□□ 2.57
EPHB4-204ENST00000477446 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.93■■■□□ 2.54
EPHB4-204ENST00000477446 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
EPHB4-204ENST00000477446 SMARCA4P51532 1647 aa30.91■■■□□ 2.54
EPHB4-204ENST00000477446 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.89■■■□□ 2.54
EPHB4-204ENST00000477446 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.82■■■□□ 2.52
EPHB4-204ENST00000477446 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
EPHB4-204ENST00000477446 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.61■■■□□ 2.49
EPHB4-204ENST00000477446 SMARCA2P51531 1590 aa30.59■■■□□ 2.49
EPHB4-204ENST00000477446 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.59■■■□□ 2.49
EPHB4-204ENST00000477446 WIZO95785 1651 aa30.53■■■□□ 2.48
EPHB4-204ENST00000477446 NCAPD3P42695 1498 aa30.52■■■□□ 2.48
EPHB4-204ENST00000477446 HMGXB3Q12766 1538 aa30.41■■■□□ 2.46
EPHB4-204ENST00000477446 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.39■■■□□ 2.46
EPHB4-204ENST00000477446 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
EPHB4-204ENST00000477446 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
EPHB4-204ENST00000477446 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.86■■■□□ 2.37
EPHB4-204ENST00000477446 NESP48681 1621 aa29.69■■■□□ 2.34
EPHB4-204ENST00000477446 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.66■■■□□ 2.34
EPHB4-204ENST00000477446 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.65■■■□□ 2.34
EPHB4-204ENST00000477446 CFTRP13569 1480 aa29.59■■■□□ 2.33
EPHB4-204ENST00000477446 PRDM2Q13029 1718 aa29.43■■■□□ 2.3
EPHB4-204ENST00000477446 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.42■■■□□ 2.3
EPHB4-204ENST00000477446 ERCC6Q03468 1493 aa29.35■■■□□ 2.29
EPHB4-204ENST00000477446 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.35■■■□□ 2.29
EPHB4-204ENST00000477446 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.33■■■□□ 2.29
EPHB4-204ENST00000477446 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.24■■■□□ 2.27
EPHB4-204ENST00000477446 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
EPHB4-204ENST00000477446 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.1■■■□□ 2.25
EPHB4-204ENST00000477446 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
EPHB4-204ENST00000477446 WDR62O43379 1518 aa28.99■■■□□ 2.23
EPHB4-204ENST00000477446 ABCC8Q09428 1581 aa28.93■■■□□ 2.22
EPHB4-204ENST00000477446 TOPBP1Q92547 1522 aa28.91■■■□□ 2.22
EPHB4-204ENST00000477446 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.91■■■□□ 2.22
EPHB4-204ENST00000477446 CUX1P39880 1505 aa28.88■■■□□ 2.21
EPHB4-204ENST00000477446 CUX2O14529 1486 aa28.87■■■□□ 2.21
EPHB4-204ENST00000477446 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.86■■■□□ 2.21
EPHB4-204ENST00000477446 SYNJ1O43426 1573 aa28.78■■■□□ 2.2
EPHB4-204ENST00000477446 TOP2BQ02880 1626 aa28.75■■■□□ 2.19
EPHB4-204ENST00000477446 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.75■■■□□ 2.19
EPHB4-204ENST00000477446 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.19
EPHB4-204ENST00000477446 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.7■■■□□ 2.19
EPHB4-204ENST00000477446 IFT140Q96RY7 1462 aa28.6■■■□□ 2.17
EPHB4-204ENST00000477446 SOGA1O94964 1423 aa28.6■■■□□ 2.17
EPHB4-204ENST00000477446 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.59■■■□□ 2.17
EPHB4-204ENST00000477446 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
EPHB4-204ENST00000477446 TRIM41Q8WV44 630 aa28.51■■■□□ 2.15
EPHB4-204ENST00000477446 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.48■■■□□ 2.15
EPHB4-204ENST00000477446 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.47■■■□□ 2.15
EPHB4-204ENST00000477446 WDR97A6NE52 1622 aa28.45■■■□□ 2.14
EPHB4-204ENST00000477446 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.44■■■□□ 2.14
EPHB4-204ENST00000477446 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
EPHB4-204ENST00000477446 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.37■■■□□ 2.135e-7■■■■■ 31.6
EPHB4-204ENST00000477446 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.36■■■□□ 2.13
EPHB4-204ENST00000477446 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.3■■■□□ 2.12
EPHB4-204ENST00000477446 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.26■■■□□ 2.12
EPHB4-204ENST00000477446 KIF27Q86VH2 1401 aa28.2■■■□□ 2.11
EPHB4-204ENST00000477446 PBRM1Q86U86 1689 aa28.2■■■□□ 2.1
EPHB4-204ENST00000477446 GRIN2BQ13224 1484 aa28.19■■■□□ 2.1
EPHB4-204ENST00000477446 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.15■■■□□ 2.1
EPHB4-204ENST00000477446 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.1■■■□□ 2.09
EPHB4-204ENST00000477446 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.1■■■□□ 2.09
EPHB4-204ENST00000477446 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
EPHB4-204ENST00000477446 IGF1RP08069 1367 aa28.05■■■□□ 2.08
EPHB4-204ENST00000477446 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.03■■■□□ 2.08
EPHB4-204ENST00000477446 ADAMTS12P58397 1594 aa27.98■■■□□ 2.07
EPHB4-204ENST00000477446 EEA1Q15075 1411 aa27.96■■■□□ 2.07
EPHB4-204ENST00000477446 SYNJ2O15056 1496 aa27.96■■■□□ 2.07
EPHB4-204ENST00000477446 CUL7Q14999 1698 aa27.94■■■□□ 2.06
EPHB4-204ENST00000477446 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.94■■■□□ 2.06
EPHB4-204ENST00000477446 CHD1O14646 1710 aa27.94■■■□□ 2.06
EPHB4-204ENST00000477446 FBLN2P98095 1184 aa27.94■■■□□ 2.06
EPHB4-204ENST00000477446 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
EPHB4-204ENST00000477446 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
EPHB4-204ENST00000477446 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.9■■■□□ 2.06
EPHB4-204ENST00000477446 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.89■■■□□ 2.05
EPHB4-204ENST00000477446 GRIN2AQ12879 1464 aa27.84■■■□□ 2.05
EPHB4-204ENST00000477446 PRXQ9BXM0 1461 aa27.79■■■□□ 2.04
EPHB4-204ENST00000477446 OSCARQ8IYS5 282 aa27.78■■■□□ 2.04
EPHB4-204ENST00000477446 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.77■■■□□ 2.04
EPHB4-204ENST00000477446 CEP170Q5SW79 1584 aa27.69■■■□□ 2.02
EPHB4-204ENST00000477446 NUP160Q12769 1436 aa27.68■■■□□ 2.02
EPHB4-204ENST00000477446 KIF21BO75037 1637 aa27.66■■■□□ 2.02
EPHB4-204ENST00000477446 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.61■■■□□ 2.01
EPHB4-204ENST00000477446 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.56■■■□□ 2
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