Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 SCAP-213ENST00000494938 579 ntTSL 415.35■□□□□ 0.051e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 PSMC6-205ENST00000553899 706 ntTSL 314.46□□□□□ -0.091e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 PSMC6-207ENST00000554952 1037 ntTSL 1 (best)12.62□□□□□ -0.391e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 PSMC6-204ENST00000553798 563 ntTSL 312.43□□□□□ -0.421e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 PSMC6-202ENST00000458604 1093 ntTSL 212.36□□□□□ -0.431e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 PSMC6-215ENST00000557517 580 ntTSL 311.17□□□□□ -0.621e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 CD46-214ENST00000480003 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.771e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 CD46-202ENST00000322918 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.791e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 PSMC6-206ENST00000554044 844 ntTSL 59.72□□□□□ -0.851e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 PSMC6-208ENST00000554956 535 ntTSL 39.5□□□□□ -0.891e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 CD46-206ENST00000360212 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.911e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 CD46-209ENST00000367047 3089 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.941e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 CD46-205ENST00000358170 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.941e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 PSMC6-218ENST00000606149 1560 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.971e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 CD46-208ENST00000367042 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.981e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 CD46-212ENST00000469535 7826 ntTSL 1 (best)8.64□□□□□ -1.031e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.091e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 CD46-203ENST00000354848 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.11e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 CCAR2-207ENST00000521020 614 ntTSL 38.17□□□□□ -1.11e-9■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 PSMC6-211ENST00000555887 573 ntTSL 28.12□□□□□ -1.111e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.111e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.111e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 PSMC6-214ENST00000557240 625 ntTSL 57.74□□□□□ -1.171e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.21e-9■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 TNRC6A-207ENST00000491718 7956 ntTSL 1 (best)7.49□□□□□ -1.211e-9■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 CD46-217ENST00000493796 408 ntTSL 57.44□□□□□ -1.221e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.261e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 WDR59-206ENST00000562539 536 ntTSL 26.88□□□□□ -1.311e-9■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 PSMC6-212ENST00000556813 785 ntTSL 56.68□□□□□ -1.341e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.351e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.361e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 PSMC6-210ENST00000555339 583 ntTSL 55.48□□□□□ -1.531e-8■■■■■ 43.5
UTP3Q9NQZ2 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.097e-7■■■■■ 43.4
UTP3Q9NQZ2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.878e-8■■■■■ 43.4
UTP3Q9NQZ2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.858e-8■■■■■ 43.4
UTP3Q9NQZ2 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.68e-8■■■■■ 43.4
UTP3Q9NQZ2 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.148e-8■■■■■ 43.4
UTP3Q9NQZ2 RTN4-206ENST00000394611 4161 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.828e-8■■■■■ 43.4
UTP3Q9NQZ2 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.768e-8■■■■■ 43.4
UTP3Q9NQZ2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.762e-6■■■■■ 43.4
UTP3Q9NQZ2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.462e-6■■■■■ 43.4
UTP3Q9NQZ2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.952e-6■■■■■ 43.4
UTP3Q9NQZ2 EZH2-209ENST00000492143 3641 ntTSL 217.74■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 43.4
UTP3Q9NQZ2 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 43.4
UTP3Q9NQZ2 EZH2-203ENST00000460911 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.092e-6■■■■■ 43.4
UTP3Q9NQZ2 KDELR2-204ENST00000462052 382 ntTSL 28.37□□□□□ -1.072e-6■■■■■ 43.4
UTP3Q9NQZ2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.561e-6■■■■■ 43.4
UTP3Q9NQZ2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.941e-6■■■■■ 43.4
UTP3Q9NQZ2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.721e-6■■■■■ 43.4
UTP3Q9NQZ2 AHCY-206ENST00000606061 1170 ntTSL 221.35■■□□□ 1.016e-9■■■■■ 43.4
UTP3Q9NQZ2 AHCY-202ENST00000468908 675 ntTSL 514.47□□□□□ -0.096e-9■■■■■ 43.4
UTP3Q9NQZ2 AHCY-203ENST00000473516 488 ntTSL 313.54□□□□□ -0.246e-9■■■■■ 43.4
UTP3Q9NQZ2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.376e-8■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.366e-8■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 LINC01089-203ENST00000535614 480 ntTSL 417.11■□□□□ 0.336e-8■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 LINC01089-205ENST00000536662 560 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.216e-8■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 LINC01089-204ENST00000535643 1014 ntTSL 1 (best)12.02□□□□□ -0.496e-8■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 LINC01089-212ENST00000545885 559 ntTSL 29.85□□□□□ -0.836e-8■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 SMC4-203ENST00000462668 4235 ntTSL 24.48□□□□□ -1.695e-8■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 OGT-203ENST00000444774 556 ntTSL 411.89□□□□□ -0.517e-8■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 ARPC1B-218ENST00000484375 785 ntTSL 324.09■■□□□ 1.451e-6■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.341e-9■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.151e-9■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 MCRIP2-202ENST00000474840 702 ntTSL 1 (best)28.41■■■□□ 2.141e-9■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 MCRIP2-203ENST00000491999 1050 ntTSL 524.91■■□□□ 1.581e-9■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.361e-6■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.191e-9■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 LRRC14-206ENST00000529995 940 ntTSL 222.18■■□□□ 1.141e-6■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 MCRIP2-210ENST00000620462 1594 ntTSL 520.47■□□□□ 0.871e-9■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 DPH7-210ENST00000479650 1797 ntTSL 520.1■□□□□ 0.811e-6■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 MCRIP2-206ENST00000615744 1379 ntTSL 319.83■□□□□ 0.771e-9■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 DPH7-213ENST00000491359 999 ntTSL 219.72■□□□□ 0.751e-6■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.581e-9■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.581e-9■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.574e-6■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.461e-6■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 CDK2-206ENST00000554619 1802 ntTSL 517.8■□□□□ 0.441e-6■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 SPPL2B-201ENST00000585725 583 ntTSL 317.65■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 DPH7-207ENST00000475100 919 ntTSL 317.39■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.08■□□□□ 0.321e-9■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.291e-6■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 TTC38-205ENST00000451998 582 ntTSL 216.86■□□□□ 0.291e-9■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 DPH7-208ENST00000476303 922 ntTSL 1 (best)16.72■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 DPH7-202ENST00000460572 394 ntTSL 516.56■□□□□ 0.241e-6■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 MCRIP2-205ENST00000611328 628 ntTSL 316.38■□□□□ 0.211e-9■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 DPH7-206ENST00000472113 1414 ntTSL 516.24■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.149e-7■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 ESPL1-205ENST00000552462 6447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.011e-6■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 ARHGAP4-209ENST00000422918 642 ntTSL 514.82□□□□□ -0.044e-9■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 PIBF1-204ENST00000489797 616 ntTSL 314.82□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 DPH7-204ENST00000467768 750 ntTSL 514.64□□□□□ -0.071e-6■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 CDK2-208ENST00000555408 2598 ntTSL 314.32□□□□□ -0.121e-6■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 CDK2-207ENST00000555357 1367 ntTSL 513.98□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 FBXO42-202ENST00000444116 945 ntTSL 513.96□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 PPFIA4-210ENST00000599966 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 ESPL1-201ENST00000257934 6623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 TACC1-218ENST00000521935 967 ntTSL 213.74□□□□□ -0.211e-9■■■■■ 43.3
UTP3Q9NQZ2 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 43.3
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