Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 NFATC2IP-203ENST00000564978 2350 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.24e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 DPP3-206ENST00000531272 572 ntTSL 47.28□□□□□ -1.244e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 LAMTOR1-207ENST00000544594 849 ntTSL 37.07□□□□□ -1.284e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 AGTRAP-207ENST00000471765 717 ntTSL 36.56□□□□□ -1.364e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 MAGT1-205ENST00000618282 2788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.374e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 PLXND1-213ENST00000511018 601 ntTSL 26.19□□□□□ -1.424e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 SNX5-211ENST00000483485 3087 ntTSL 25.99□□□□□ -1.454e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 RAB11A-206ENST00000567671 635 ntTSL 35.78□□□□□ -1.484e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.494e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.494e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 SNX5-218ENST00000606570 3931 nt5.36□□□□□ -1.554e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.614e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.774e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.784e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 FIP1L1-204ENST00000504094 2177 ntTSL 23.78□□□□□ -1.814e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 FIP1L1-213ENST00000514543 1465 ntTSL 53.7□□□□□ -1.824e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.934e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 SNX5-215ENST00000491090 819 ntTSL 32.61□□□□□ -1.994e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 FIP1L1-211ENST00000513008 1070 ntTSL 1 (best)1.84□□□□□ -2.114e-6■■■■■ 28.5
SUB1P53999 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -02e-10■■■■■ 28.5
SUB1P53999 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.242e-10■■■■■ 28.5
SUB1P53999 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.272e-10■■■■■ 28.5
SUB1P53999 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.292e-10■■■■■ 28.5
SUB1P53999 BSG-205ENST00000571735 2155 ntTSL 212.98□□□□□ -0.332e-10■■■■■ 28.5
SUB1P53999 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.382e-10■■■■■ 28.5
SUB1P53999 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.442e-10■■■■■ 28.5
SUB1P53999 BSG-216ENST00000618112 769 ntTSL 211.33□□□□□ -0.62e-10■■■■■ 28.5
SUB1P53999 EIF3M-205ENST00000525782 2236 ntTSL 29.22□□□□□ -0.933e-7■■■■■ 28.4
SUB1P53999 EIF3M-202ENST00000524711 1645 ntTSL 27.39□□□□□ -1.233e-7■■■■■ 28.4
SUB1P53999 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.281e-9■■■■■ 28.4
SUB1P53999 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.341e-9■■■■■ 28.4
SUB1P53999 NDUFB5-210ENST00000482604 671 ntTSL 58.65□□□□□ -1.022e-8■■■■■ 28.4
SUB1P53999 NDUFB5-211ENST00000488002 842 ntTSL 28.09□□□□□ -1.112e-8■■■■■ 28.4
SUB1P53999 NDUFB5-215ENST00000496904 175 ntTSL 56.32□□□□□ -1.42e-8■■■■■ 28.4
SUB1P53999 NDUFB5-212ENST00000491054 1014 ntTSL 23.09□□□□□ -1.912e-8■■■■■ 28.4
SUB1P53999 FARSA-203ENST00000586146 1707 ntTSL 517.01■□□□□ 0.313e-8■■■■■ 28.4
SUB1P53999 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.283e-8■■■■■ 28.4
SUB1P53999 FARSA-208ENST00000588965 1831 ntTSL 515.7■□□□□ 0.13e-8■■■■■ 28.4
SUB1P53999 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.043e-8■■■■■ 28.4
SUB1P53999 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.033e-8■■■■■ 28.4
SUB1P53999 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.234e-6■■■■■ 28.4
SUB1P53999 WNK4-204ENST00000591448 3909 ntTSL 1 (best)10.49□□□□□ -0.734e-6■■■■■ 28.4
SUB1P53999 WNK4-201ENST00000246914 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.834e-6■■■■■ 28.4
SUB1P53999 SEM1-201ENST00000248566 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.893e-13■■■■■ 28.4
SUB1P53999 SEM1-205ENST00000444799 1590 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.053e-13■■■■■ 28.4
SUB1P53999 SEM1-204ENST00000417009 350 ntTSL 3 BASIC8.36□□□□□ -1.073e-13■■■■■ 28.4
SUB1P53999 SEM1-206ENST00000449279 699 ntTSL 37.59□□□□□ -1.193e-13■■■■■ 28.4
SUB1P53999 SEM1-210ENST00000488005 775 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.223e-13■■■■■ 28.4
SUB1P53999 SEM1-223ENST00000623498 582 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.283e-13■■■■■ 28.4
SUB1P53999 SEM1-224ENST00000623693 729 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.33e-13■■■■■ 28.4
SUB1P53999 SEM1-203ENST00000413065 661 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.313e-13■■■■■ 28.4
SUB1P53999 SEM1-214ENST00000613919 610 ntTSL 26.72□□□□□ -1.333e-13■■■■■ 28.4
SUB1P53999 SEM1-207ENST00000466986 507 ntTSL 25.92□□□□□ -1.463e-13■■■■■ 28.4
SUB1P53999 SEM1-219ENST00000618105 544 ntTSL 23.37□□□□□ -1.873e-13■■■■■ 28.4
SUB1P53999 SEM1-220ENST00000619259 462 ntTSL 23.37□□□□□ -1.873e-13■■■■■ 28.4
SUB1P53999 SEM1-217ENST00000617133 591 ntTSL 23.37□□□□□ -1.873e-13■■■■■ 28.4
SUB1P53999 SEM1-209ENST00000482389 2773 ntTSL 21.32□□□□□ -2.23e-13■■■■■ 28.4
SUB1P53999 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.975e-9■■■■■ 28.4
SUB1P53999 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.925e-9■■■■■ 28.4
SUB1P53999 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.395e-7■■■■■ 28.4
SUB1P53999 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.665e-7■■■■■ 28.4
SUB1P53999 MRPL33-206ENST00000483992 729 ntTSL 25.55□□□□□ -1.521e-7■■■■■ 28.4
SUB1P53999 MRPL33-205ENST00000476552 587 ntTSL 23.97□□□□□ -1.771e-7■■■■■ 28.4
SUB1P53999 SNHG16-201ENST00000448136 3607 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.157e-7■■■■■ 28.4
SUB1P53999 SNHG16-207ENST00000590435 1947 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.27e-7■■■■■ 28.4
SUB1P53999 SNHG16-202ENST00000493536 2424 ntTSL 1 (best)7.06□□□□□ -1.287e-7■■■■■ 28.4
SUB1P53999 PDCD4-202ENST00000393104 3697 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.995e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 PDCD4-201ENST00000280154 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.195e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 PDCD4-211ENST00000498367 975 ntTSL 36.08□□□□□ -1.445e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 SYF2-204ENST00000476231 1962 ntTSL 1 (best)15.28■□□□□ 0.045e-8■■■■■ 28.3
SUB1P53999 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.245e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.895e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.745e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.685e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.665e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.655e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.645e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 RING1-202ENST00000478431 1532 ntTSL 1 (best)19.01■□□□□ 0.635e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 PDIA5-207ENST00000489923 1651 ntTSL 1 (best)18.62■□□□□ 0.575e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.565e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.555e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.545e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.55e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.415e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.365e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.255e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.235e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.225e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.195e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.145e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.135e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.085e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.065e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.055e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.035e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.025e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.045e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.055e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.075e-6■■■■■ 28.3
SUB1P53999 STK25-224ENST00000472181 464 ntTSL 314.63□□□□□ -0.075e-6■■■■■ 28.3
Retrieved 100 of 11,644 protein–RNA pairs in 141.9 ms