RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.57■■■■■ 4.41
SYF2-204ENST00000476231 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.07■■■■□ 3.52
SYF2-204ENST00000476231 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.8■■■■□ 3.32
SYF2-204ENST00000476231 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.23■■■■□ 3.23
SYF2-204ENST00000476231 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.04■■■■□ 3.2
SYF2-204ENST00000476231 ABCC9O60706 1549 aa34.81■■■■□ 3.16
SYF2-204ENST00000476231 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.8■■■■□ 3.16
SYF2-204ENST00000476231 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.75■■■■□ 3.15
SYF2-204ENST00000476231 NACADO15069 1562 aa34.47■■■■□ 3.11
SYF2-204ENST00000476231 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.12■■■■□ 3.05
SYF2-204ENST00000476231 SCRIBQ14160 1630 aa34.07■■■■□ 3.04
SYF2-204ENST00000476231 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP33.6■■■□□ 2.97
SYF2-204ENST00000476231 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.43■■■□□ 2.94
SYF2-204ENST00000476231 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.09■■■□□ 2.89
SYF2-204ENST00000476231 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.07■■■□□ 2.88
SYF2-204ENST00000476231 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.04■■■□□ 2.88
SYF2-204ENST00000476231 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.88■■■□□ 2.85
SYF2-204ENST00000476231 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.87■■■□□ 2.85
SYF2-204ENST00000476231 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.85■■■□□ 2.85
SYF2-204ENST00000476231 SMARCA4P51532 1647 aa32.69■■■□□ 2.82
SYF2-204ENST00000476231 WIZO95785 1651 aa32.63■■■□□ 2.81
SYF2-204ENST00000476231 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
SYF2-204ENST00000476231 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.3■■■□□ 2.76
SYF2-204ENST00000476231 CHIC1Q5VXU3 224 aa32.28■■■□□ 2.76
SYF2-204ENST00000476231 SMARCA2P51531 1590 aa32.1■■■□□ 2.73
SYF2-204ENST00000476231 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.09■■■□□ 2.73
SYF2-204ENST00000476231 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.06■■■□□ 2.72
SYF2-204ENST00000476231 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.98■■■□□ 2.71
SYF2-204ENST00000476231 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.93■■■□□ 2.7
SYF2-204ENST00000476231 NCAPD3P42695 1498 aa31.8■■■□□ 2.68
SYF2-204ENST00000476231 HMGXB3Q12766 1538 aa31.79■■■□□ 2.68
SYF2-204ENST00000476231 TRIM41Q8WV44 630 aa31.6■■■□□ 2.65
SYF2-204ENST00000476231 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.53■■■□□ 2.64
SYF2-204ENST00000476231 ABCC8Q09428 1581 aa31.35■■■□□ 2.61
SYF2-204ENST00000476231 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.15■■■□□ 2.58
SYF2-204ENST00000476231 CFTRP13569 1480 aa31.14■■■□□ 2.58
SYF2-204ENST00000476231 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.03■■■□□ 2.56
SYF2-204ENST00000476231 PRDM2Q13029 1718 aa31.03■■■□□ 2.56
SYF2-204ENST00000476231 SYNJ1O43426 1573 aa31.01■■■□□ 2.55
SYF2-204ENST00000476231 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.99■■■□□ 2.55
SYF2-204ENST00000476231 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.99■■■□□ 2.55
SYF2-204ENST00000476231 TOP2BQ02880 1626 aa30.89■■■□□ 2.54
SYF2-204ENST00000476231 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.86■■■□□ 2.53
SYF2-204ENST00000476231 EEA1Q15075 1411 aa30.84■■■□□ 2.53
SYF2-204ENST00000476231 SOGA1O94964 1423 aa30.8■■■□□ 2.52
SYF2-204ENST00000476231 CUX1P39880 1505 aa30.74■■■□□ 2.51
SYF2-204ENST00000476231 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.7■■■□□ 2.51
SYF2-204ENST00000476231 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.66■■■□□ 2.5
SYF2-204ENST00000476231 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.65■■■□□ 2.5
SYF2-204ENST00000476231 NESP48681 1621 aa30.62■■■□□ 2.49
SYF2-204ENST00000476231 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.61■■■□□ 2.49
SYF2-204ENST00000476231 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.61■■■□□ 2.49
SYF2-204ENST00000476231 EHMT2Q96KQ7 1210 aa30.52■■■□□ 2.48
SYF2-204ENST00000476231 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.45■■■□□ 2.46
SYF2-204ENST00000476231 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.44■■■□□ 2.46
SYF2-204ENST00000476231 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.43■■■□□ 2.46
SYF2-204ENST00000476231 KIF21BO75037 1637 aa30.42■■■□□ 2.46
SYF2-204ENST00000476231 GOLGA3Q08378 1498 aa30.4■■■□□ 2.46
SYF2-204ENST00000476231 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.37■■■□□ 2.45
SYF2-204ENST00000476231 KIF27Q86VH2 1401 aa30.35■■■□□ 2.45
SYF2-204ENST00000476231 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.34■■■□□ 2.45
SYF2-204ENST00000476231 TOPBP1Q92547 1522 aa30.34■■■□□ 2.45
SYF2-204ENST00000476231 HRCP23327 699 aa30.32■■■□□ 2.44
SYF2-204ENST00000476231 PCGF6Q9BYE7 350 aa30.32■■■□□ 2.44
SYF2-204ENST00000476231 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.29■■■□□ 2.44
SYF2-204ENST00000476231 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.25■■■□□ 2.43
SYF2-204ENST00000476231 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
SYF2-204ENST00000476231 CUX2O14529 1486 aa30.21■■■□□ 2.43
SYF2-204ENST00000476231 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
SYF2-204ENST00000476231 PRXQ9BXM0 1461 aa30.2■■■□□ 2.42
SYF2-204ENST00000476231 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.18■■■□□ 2.42
SYF2-204ENST00000476231 CEP162Q5TB80 1403 aa30.17■■■□□ 2.42
SYF2-204ENST00000476231 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.17■■■□□ 2.42
SYF2-204ENST00000476231 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
SYF2-204ENST00000476231 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.13■■■□□ 2.41
SYF2-204ENST00000476231 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.09■■■□□ 2.41
SYF2-204ENST00000476231 IGF1RP08069 1367 aa30.04■■■□□ 2.4
SYF2-204ENST00000476231 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.03■■■□□ 2.4
SYF2-204ENST00000476231 WDR97A6NE52 1622 aa30.02■■■□□ 2.4
SYF2-204ENST00000476231 CLIP1P30622 1438 aa29.91■■■□□ 2.38
SYF2-204ENST00000476231 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa29.9■■■□□ 2.38
SYF2-204ENST00000476231 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
SYF2-204ENST00000476231 WDR62O43379 1518 aa29.87■■■□□ 2.37
SYF2-204ENST00000476231 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.87■■■□□ 2.37
SYF2-204ENST00000476231 ERCC6Q03468 1493 aa29.85■■■□□ 2.37
SYF2-204ENST00000476231 CUL7Q14999 1698 aa29.84■■■□□ 2.37
SYF2-204ENST00000476231 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.78■■■□□ 2.36
SYF2-204ENST00000476231 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
SYF2-204ENST00000476231 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
SYF2-204ENST00000476231 IFT140Q96RY7 1462 aa29.71■■■□□ 2.35
SYF2-204ENST00000476231 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.68■■■□□ 2.34
SYF2-204ENST00000476231 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
SYF2-204ENST00000476231 PBRM1Q86U86 1689 aa29.62■■■□□ 2.33
SYF2-204ENST00000476231 ARAP1Q96P48 1450 aa29.59■■■□□ 2.33
SYF2-204ENST00000476231 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.56■■■□□ 2.327e-7■■■■□ 25.2
SYF2-204ENST00000476231 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa29.55■■■□□ 2.32
SYF2-204ENST00000476231 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
SYF2-204ENST00000476231 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa29.53■■■□□ 2.32
SYF2-204ENST00000476231 GRIN2BQ13224 1484 aa29.53■■■□□ 2.32
SYF2-204ENST00000476231 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms