Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.392e-7■■■■■ 62.5
FMR1Q06787 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.71e-7■■■■■ 62
FMR1Q06787 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.047e-17■■■■■ 61.9
FMR1Q06787 PABPC1-219ENST00000522387 2331 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.067e-17■■■■■ 61.9
FMR1Q06787 PABPC1-224ENST00000610907 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.517e-17■■■■■ 61.9
FMR1Q06787 PABPC1-202ENST00000517403 560 ntTSL 511.39□□□□□ -0.597e-17■■■■■ 61.9
FMR1Q06787 PABPC1-207ENST00000518716 694 ntTSL 28.14□□□□□ -1.117e-17■■■■■ 61.9
FMR1Q06787 PABPC1-223ENST00000523636 818 ntTSL 57.37□□□□□ -1.237e-17■■■■■ 61.9
FMR1Q06787 PABPC1-211ENST00000519596 771 ntTSL 34.08□□□□□ -1.767e-17■■■■■ 61.9
FMR1Q06787 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.721e-17■■■■■ 61.8
FMR1Q06787 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.721e-17■■■■■ 61.8
FMR1Q06787 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.481e-17■■■■■ 61.8
FMR1Q06787 KIF13A-208ENST00000503342 738 ntTSL 312.5□□□□□ -0.415e-10■■■■■ 61.6
FMR1Q06787 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.418e-7■■■■■ 61.5
FMR1Q06787 FDPS-212ENST00000487002 2017 ntTSL 219.28■□□□□ 0.686e-15■■■■■ 61.4
FMR1Q06787 FDPS-208ENST00000470171 746 ntTSL 219.06■□□□□ 0.646e-15■■■■■ 61.4
FMR1Q06787 FDPS-205ENST00000465559 677 ntTSL 319.01■□□□□ 0.636e-15■■■■■ 61.4
FMR1Q06787 FDPS-213ENST00000489003 976 ntTSL 218.48■□□□□ 0.556e-15■■■■■ 61.4
FMR1Q06787 FDPS-210ENST00000474345 713 ntTSL 318.48■□□□□ 0.556e-15■■■■■ 61.4
FMR1Q06787 FDPS-216ENST00000491013 912 ntTSL 518.3■□□□□ 0.526e-15■■■■■ 61.4
FMR1Q06787 FDPS-219ENST00000495308 808 ntTSL 216.67■□□□□ 0.266e-15■■■■■ 61.4
FMR1Q06787 FDPS-204ENST00000461507 1022 ntTSL 216.17■□□□□ 0.186e-15■■■■■ 61.4
FMR1Q06787 FDPS-207ENST00000468479 938 ntTSL 215.98■□□□□ 0.156e-15■■■■■ 61.4
FMR1Q06787 FDPS-211ENST00000477057 741 ntTSL 215.56■□□□□ 0.086e-15■■■■■ 61.4
FMR1Q06787 FDPS-209ENST00000471117 630 ntTSL 310.56□□□□□ -0.726e-15■■■■■ 61.4
FMR1Q06787 C22orf34-205ENST00000416411 542 ntTSL 416.73■□□□□ 0.274e-13■■■■■ 61.3
FMR1Q06787 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.124e-13■■■■■ 61.3
FMR1Q06787 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.131e-9■■■■■ 61.1
FMR1Q06787 SDF2-203ENST00000585749 823 ntTSL 312.35□□□□□ -0.431e-9■■■■■ 61.1
FMR1Q06787 SDF2-204ENST00000587338 583 ntTSL 311.53□□□□□ -0.561e-9■■■■■ 61.1
FMR1Q06787 SDF2-207ENST00000588472 681 ntTSL 211.14□□□□□ -0.631e-9■■■■■ 61.1
FMR1Q06787 SDF2-210ENST00000592250 1025 ntTSL 29.25□□□□□ -0.931e-9■■■■■ 61.1
FMR1Q06787 NPHP4-209ENST00000489180 5548 ntTSL 218.78■□□□□ 0.62e-17■■■■■ 60.8
FMR1Q06787 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.492e-17■■■■■ 60.8
FMR1Q06787 NPHP4-205ENST00000466897 1192 ntTSL 1 (best)18.02■□□□□ 0.482e-17■■■■■ 60.8
FMR1Q06787 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.22e-17■■■■■ 60.8
FMR1Q06787 NPHP4-208ENST00000478423 4467 ntTSL 215.38■□□□□ 0.052e-17■■■■■ 60.8
FMR1Q06787 NPHP4-203ENST00000378169 4213 ntTSL 1 (best)14.46□□□□□ -0.12e-17■■■■■ 60.8
FMR1Q06787 SMAD5-208ENST00000513418 523 ntTSL 55.19□□□□□ -1.582e-17■■■■■ 60.8
FMR1Q06787 SDF2-202ENST00000585428 924 ntTSL 1 (best)19■□□□□ 0.632e-9■■■■■ 60.2
FMR1Q06787 SMYD3-207ENST00000462422 971 ntTSL 515.9■□□□□ 0.144e-6■■■■■ 60.1
FMR1Q06787 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.412e-8■■■■■ 60
FMR1Q06787 CHCHD3-202ENST00000423635 1310 ntTSL 1 (best)22.35■■□□□ 1.172e-8■■■■■ 60
FMR1Q06787 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.782e-8■■■■■ 60
FMR1Q06787 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.145e-17■■■■■ 59.7
FMR1Q06787 DNMT1-218ENST00000589294 575 ntTSL 214.43□□□□□ -0.15e-17■■■■■ 59.7
FMR1Q06787 USP45-213ENST00000513344 801 ntTSL 38.12□□□□□ -1.115e-17■■■■■ 59.7
FMR1Q06787 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.465e-17■■■■■ 59.7
FMR1Q06787 USP45-207ENST00000496518 5319 ntTSL 1 (best)3.25□□□□□ -1.895e-17■■■■■ 59.7
FMR1Q06787 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.935e-17■■■■■ 59.7
FMR1Q06787 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.49e-7■■■■■ 59.2
FMR1Q06787 TPTEP1-204ENST00000426585 5725 ntTSL 1 (best)13.82□□□□□ -0.29e-7■■■■■ 59.2
FMR1Q06787 FAM49B-207ENST00000518285 507 ntTSL 323.82■■□□□ 1.43e-12■■■■■ 58.9
FMR1Q06787 FAM49B-227ENST00000523514 533 ntTSL 49.43□□□□□ -0.93e-12■■■■■ 58.9
FMR1Q06787 TMEM14B-203ENST00000460341 565 ntTSL 421.22■□□□□ 0.991e-16■■■■■ 58.7
FMR1Q06787 MYL12A-208ENST00000580353 565 ntTSL 219.31■□□□□ 0.682e-32■■■■■ 58.7
FMR1Q06787 TMEM14B-206ENST00000463448 1589 ntTSL 1 (best)18.69■□□□□ 0.581e-16■■■■■ 58.7
FMR1Q06787 TMEM14B-209ENST00000473166 752 ntTSL 318.49■□□□□ 0.551e-16■■■■■ 58.7
FMR1Q06787 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.291e-16■■■■■ 58.7
FMR1Q06787 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.261e-16■■■■■ 58.7
FMR1Q06787 TMEM14B-211ENST00000473807 559 ntTSL 416.11■□□□□ 0.171e-16■■■■■ 58.7
FMR1Q06787 TMEM14B-213ENST00000478732 344 ntTSL 516.03■□□□□ 0.161e-16■■■■■ 58.7
FMR1Q06787 MYL12A-206ENST00000578611 1004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.012e-32■■■■■ 58.7
FMR1Q06787 MYL12A-207ENST00000579226 947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.132e-32■■■■■ 58.7
FMR1Q06787 TMEM14B-205ENST00000463100 502 ntTSL 414.1□□□□□ -0.151e-16■■■■■ 58.7
FMR1Q06787 MYL12A-210ENST00000583449 334 ntTSL 213.76□□□□□ -0.212e-32■■■■■ 58.7
FMR1Q06787 MYL12A-201ENST00000217652 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.312e-32■■■■■ 58.7
FMR1Q06787 MYL6B-203ENST00000548571 223 ntTSL 411.11□□□□□ -0.631e-16■■■■■ 58.7
FMR1Q06787 TMEM14B-207ENST00000467229 483 ntTSL 38.73□□□□□ -1.011e-16■■■■■ 58.7
FMR1Q06787 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.381e-7■■■■■ 58.4
FMR1Q06787 GOLGA4-204ENST00000429018 2036 ntTSL 1 (best)18.48■□□□□ 0.551e-7■■■■■ 58.4
FMR1Q06787 GOLGA4-201ENST00000356847 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.451e-7■■■■■ 58.4
FMR1Q06787 GOLGA4-202ENST00000361924 7772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.51e-7■■■■■ 58.4
FMR1Q06787 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC7.31□□□□□ -1.242e-16■■■■■ 58.2
FMR1Q06787 USP34-203ENST00000436269 1827 ntTSL 55.11□□□□□ -1.595e-9■■■■■ 58.2
FMR1Q06787 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.362e-16■■■■■ 57.7
FMR1Q06787 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.052e-16■■■■■ 57.7
FMR1Q06787 STAG1-203ENST00000434713 5064 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.322e-16■■■■■ 57.7
FMR1Q06787 PHKB-202ENST00000323584 4283 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.322e-16■■■■■ 57.7
FMR1Q06787 PHKB-217ENST00000570047 797 ntTSL 312.11□□□□□ -0.472e-16■■■■■ 57.7
FMR1Q06787 PHKB-214ENST00000567402 1617 ntTSL 1 (best)11.85□□□□□ -0.512e-16■■■■■ 57.7
FMR1Q06787 STAG1-210ENST00000629124 4322 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.692e-16■■■■■ 57.7
FMR1Q06787 STAG1-207ENST00000483235 5206 ntTSL 1 (best)10.7□□□□□ -0.72e-16■■■■■ 57.7
FMR1Q06787 STAG1-208ENST00000487065 2914 ntTSL 1 (best)9.45□□□□□ -0.92e-16■■■■■ 57.7
FMR1Q06787 STAG1-202ENST00000383202 6055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.142e-16■■■■■ 57.7
FMR1Q06787 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.152e-16■■■■■ 57.7
FMR1Q06787 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.32e-16■■■■■ 57.7
FMR1Q06787 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.562e-6■■■■■ 57.1
FMR1Q06787 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 57.1
FMR1Q06787 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.222e-20■■■■■ 57
FMR1Q06787 WEE1-201ENST00000299613 3436 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.412e-25■■■■■ 56.8
FMR1Q06787 WEE1-203ENST00000524549 5187 ntTSL 26.98□□□□□ -1.292e-25■■■■■ 56.8
FMR1Q06787 WEE1-204ENST00000524612 573 ntTSL 46.58□□□□□ -1.362e-25■■■■■ 56.8
FMR1Q06787 KIF13A-211ENST00000507576 529 ntTSL 329.37■■■□□ 2.298e-8■■■■■ 56.6
FMR1Q06787 TFRC-205ENST00000426789 354 ntTSL 35.19□□□□□ -1.581e-7■■■■■ 56.3
FMR1Q06787 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.191e-11■■■■■ 56.2
FMR1Q06787 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.572e-19■■■■■ 56
FMR1Q06787 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.452e-19■■■■■ 56
FMR1Q06787 REEP5-204ENST00000497856 1779 ntTSL 1 (best)15.98■□□□□ 0.152e-19■■■■■ 56
FMR1Q06787 ZCCHC7-203ENST00000461038 2793 ntTSL 1 (best)17.63■□□□□ 0.418e-16■■■■■ 55.6
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 324.8 ms