Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.12e-7■■■■■ 325.6
UTP3Q9NQZ2 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.012e-7■■■■■ 325.6
UTP3Q9NQZ2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.862e-7■■■■■ 325.6
UTP3Q9NQZ2 TPCN2-206ENST00000635811 3824 ntTSL 515.47■□□□□ 0.072e-7■■■■■ 325.6
UTP3Q9NQZ2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.871e-8■■■■■ 325.5
UTP3Q9NQZ2 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.161e-8■■■■■ 325.5
UTP3Q9NQZ2 SCFD2-202ENST00000401642 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.441e-8■■■■■ 325.5
UTP3Q9NQZ2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.993e-17■■■■■ 325.4
UTP3Q9NQZ2 RFC2-210ENST00000493156 782 ntTSL 520.77■□□□□ 0.923e-17■■■■■ 325.4
UTP3Q9NQZ2 RFC2-203ENST00000463194 853 ntTSL 320.65■□□□□ 0.93e-17■■■■■ 325.4
UTP3Q9NQZ2 RFC2-211ENST00000494019 730 ntTSL 310.85□□□□□ -0.673e-17■■■■■ 325.4
UTP3Q9NQZ2 RFC2-205ENST00000473493 304 ntTSL 310.65□□□□□ -0.73e-17■■■■■ 325.4
UTP3Q9NQZ2 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 324.2
UTP3Q9NQZ2 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.051e-6■■■■■ 324.2
UTP3Q9NQZ2 PPARGC1B-201ENST00000309241 10568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.781e-6■■■■■ 324.2
UTP3Q9NQZ2 CCDC180-209ENST00000528678 689 ntTSL 38.12□□□□□ -1.119e-24■■■■■ 324
UTP3Q9NQZ2 CCDC180-211ENST00000530011 562 ntTSL 47.83□□□□□ -1.169e-24■■■■■ 324
UTP3Q9NQZ2 BBX-215ENST00000449335 675 ntTSL 512.39□□□□□ -0.433e-6■■■■■ 324
UTP3Q9NQZ2 BBX-217ENST00000456419 871 ntTSL 59.66□□□□□ -0.863e-6■■■■■ 324
UTP3Q9NQZ2 BBX-209ENST00000427402 959 ntTSL 59.27□□□□□ -0.933e-6■■■■■ 324
UTP3Q9NQZ2 BBX-202ENST00000402163 1586 ntTSL 58.01□□□□□ -1.133e-6■■■■■ 324
UTP3Q9NQZ2 BBX-225ENST00000485939 555 ntTSL 46.74□□□□□ -1.333e-6■■■■■ 324
UTP3Q9NQZ2 SPTBN4-210ENST00000596900 1857 ntTSL 1 (best)24.76■■□□□ 1.553e-9■■■■■ 323
UTP3Q9NQZ2 AC024592.3-201ENST00000592091 2118 ntTSL 218.81■□□□□ 0.68e-7■■■■■ 323
UTP3Q9NQZ2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.548e-7■■■■■ 323
UTP3Q9NQZ2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.58e-7■■■■■ 323
UTP3Q9NQZ2 AC024592.3-203ENST00000585661 431 ntAPPRIS P1 TSL 217.55■□□□□ 0.48e-7■■■■■ 323
UTP3Q9NQZ2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.48e-7■■■■■ 323
UTP3Q9NQZ2 NDUFA11-204ENST00000591341 403 ntTSL 217.27■□□□□ 0.368e-7■■■■■ 323
UTP3Q9NQZ2 NDUFA11-206ENST00000593233 657 ntTSL 317.27■□□□□ 0.368e-7■■■■■ 323
UTP3Q9NQZ2 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.258e-7■■■■■ 323
UTP3Q9NQZ2 TOM1L1-208ENST00000570977 584 ntTSL 27.52□□□□□ -1.217e-19■■■■■ 323
UTP3Q9NQZ2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.866e-12■■■■■ 322.7
UTP3Q9NQZ2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.56e-12■■■■■ 322.7
UTP3Q9NQZ2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.066e-12■■■■■ 322.7
UTP3Q9NQZ2 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.336e-12■■■■■ 322.7
UTP3Q9NQZ2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.471e-6■■■■■ 322.5
UTP3Q9NQZ2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.326e-7■■■■■ 322.2
UTP3Q9NQZ2 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.028e-7■■■■■ 322
UTP3Q9NQZ2 TBCD-225ENST00000576996 827 ntTSL 515.38■□□□□ 0.052e-7■■■■■ 321.8
UTP3Q9NQZ2 TBCD-206ENST00000571712 850 ntTSL 511.7□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 321.8
UTP3Q9NQZ2 TBCD-219ENST00000576160 942 ntTSL 510.67□□□□□ -0.72e-7■■■■■ 321.8
UTP3Q9NQZ2 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.199e-7■■■■■ 319.2
UTP3Q9NQZ2 VPS39-203ENST00000561797 545 ntTSL 316.72■□□□□ 0.272e-10■■■■■ 319.1
UTP3Q9NQZ2 VPS39-205ENST00000562258 4160 ntTSL 210.39□□□□□ -0.752e-10■■■■■ 319.1
UTP3Q9NQZ2 VPS39-207ENST00000563692 587 ntTSL 49.56□□□□□ -0.882e-10■■■■■ 319.1
UTP3Q9NQZ2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.74e-7■■■■■ 318.5
UTP3Q9NQZ2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.758e-7■■■■■ 318
UTP3Q9NQZ2 BRF1-210ENST00000547374 3809 ntTSL 514.44□□□□□ -0.16e-7■■■■■ 317.7
UTP3Q9NQZ2 BRF1-222ENST00000635152 2876 ntTSL 214.28□□□□□ -0.126e-7■■■■■ 317.7
UTP3Q9NQZ2 TRIM41-203ENST00000503114 1904 ntTSL 1 (best)20.48■□□□□ 0.872e-20■■■■■ 317.7
UTP3Q9NQZ2 TRIM41-207ENST00000515223 5707 ntTSL 219.26■□□□□ 0.672e-20■■■■■ 317.7
UTP3Q9NQZ2 JUP-204ENST00000420370 915 ntTSL 320.63■□□□□ 0.892e-8■■■■■ 317.6
UTP3Q9NQZ2 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.191e-9■■■■■ 317.5
UTP3Q9NQZ2 SS18-211ENST00000578954 756 ntTSL 317.31■□□□□ 0.363e-16■■■■■ 317.3
UTP3Q9NQZ2 SS18-226ENST00000585241 774 ntTSL 517.31■□□□□ 0.363e-16■■■■■ 317.3
UTP3Q9NQZ2 SS18-216ENST00000580751 547 ntTSL 416.57■□□□□ 0.243e-16■■■■■ 317.3
UTP3Q9NQZ2 SS18-206ENST00000577572 510 ntTSL 416.31■□□□□ 0.23e-16■■■■■ 317.3
UTP3Q9NQZ2 SS18-215ENST00000580642 545 ntTSL 416.31■□□□□ 0.23e-16■■■■■ 317.3
UTP3Q9NQZ2 SS18-212ENST00000579061 646 ntTSL 315.74■□□□□ 0.113e-16■■■■■ 317.3
UTP3Q9NQZ2 SS18-222ENST00000582792 531 ntTSL 514.31□□□□□ -0.123e-16■■■■■ 317.3
UTP3Q9NQZ2 SS18-219ENST00000581570 571 ntTSL 513.48□□□□□ -0.253e-16■■■■■ 317.3
UTP3Q9NQZ2 SS18-221ENST00000582448 585 ntTSL 512.09□□□□□ -0.473e-16■■■■■ 317.3
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UTP3Q9NQZ2 SS18-210ENST00000578700 575 ntTSL 510.77□□□□□ -0.693e-16■■■■■ 317.3
UTP3Q9NQZ2 FAM207A-204ENST00000479127 759 ntTSL 320.58■□□□□ 0.892e-7■■■■■ 317.3
UTP3Q9NQZ2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.912e-25■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 CERS4-203ENST00000558268 713 ntTSL 326.9■■□□□ 1.92e-25■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 MAP4K2-207ENST00000444560 469 ntTSL 524.74■■□□□ 1.554e-8■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 SPTBN4-211ENST00000597389 5957 ntTSL 524.14■■□□□ 1.462e-9■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.412e-9■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.371e-49■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.372e-25■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.332e-9■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.312e-9■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 CERS4-210ENST00000559490 420 ntTSL 522.85■■□□□ 1.252e-25■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.192e-25■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.172e-25■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.161e-12■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 AL807752.6-201ENST00000625047 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 322.2■■□□□ 1.142e-25■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.112e-25■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.052e-9■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 MAP4K2-206ENST00000439069 947 ntTSL 321.54■■□□□ 1.044e-8■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.032e-9■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 CERS4-214ENST00000595722 1826 ntTSL 1 (best)21.19■□□□□ 0.982e-25■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 CERS4-213ENST00000561053 768 ntTSL 521.07■□□□□ 0.962e-25■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.962e-9■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.872e-25■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.682e-25■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 NPDC1-206ENST00000496498 383 ntTSL 219.16■□□□□ 0.662e-25■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 CERS4-206ENST00000558501 873 ntTSL 518.76■□□□□ 0.592e-25■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 CERS4-211ENST00000560412 568 ntTSL 418.51■□□□□ 0.552e-25■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 PPP1R16A-207ENST00000529009 657 ntTSL 318.23■□□□□ 0.514e-8■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 MAP4K2-209ENST00000468062 818 ntTSL 518.18■□□□□ 0.54e-8■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.412e-25■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.45e-15■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.215e-12■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.192e-25■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 CERS4-212ENST00000561008 531 ntTSL 416.2■□□□□ 0.182e-25■■■■■ 316.7
UTP3Q9NQZ2 NPDC1-203ENST00000472668 358 ntTSL 315.85■□□□□ 0.132e-25■■■■■ 316.7
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