Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 ROCK2-206ENST00000462366 563 ntTSL 36.15□□□□□ -1.426e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 CDK5RAP3-221ENST00000581662 557 ntTSL 26.01□□□□□ -1.456e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 TYMS-205ENST00000581920 886 ntTSL 55.95□□□□□ -1.466e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 EIF4G2-206ENST00000525972 584 ntTSL 25.76□□□□□ -1.496e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 CEP95-215ENST00000582698 442 ntTSL 24.3□□□□□ -1.726e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 TIMM21-205ENST00000581467 579 ntTSL 24.26□□□□□ -1.736e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 CCDC93-204ENST00000460781 842 ntTSL 33.76□□□□□ -1.816e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 CHRD-215ENST00000485883 568 ntTSL 417.6■□□□□ 0.417e-9■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 CHRD-207ENST00000459711 503 ntTSL 215.91■□□□□ 0.147e-9■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 CHRD-214ENST00000482805 608 ntTSL 415.43■□□□□ 0.067e-9■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 CHRD-216ENST00000486066 546 ntTSL 415.42■□□□□ 0.067e-9■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 CHRD-210ENST00000461684 677 ntTSL 414.5□□□□□ -0.097e-9■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.011e-13■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.021e-13■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 RAB30-AS1-204ENST00000528156 658 ntTSL 211.32□□□□□ -0.61e-13■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 RAB30-AS1-201ENST00000501011 607 ntTSL 1 (best)10.99□□□□□ -0.651e-13■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 RAB30-AS1-203ENST00000527627 504 ntTSL 310.86□□□□□ -0.671e-13■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.851e-13■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 RAB30-AS1-206ENST00000533528 340 ntTSL 57.96□□□□□ -1.141e-13■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.927e-7■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.67e-7■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.032e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 STARD3-229ENST00000585269 1346 ntTSL 520.92■□□□□ 0.942e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 STARD3-214ENST00000578577 1511 ntTSL 220.5■□□□□ 0.872e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.842e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.732e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.622e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 STARD3-223ENST00000583582 1350 ntTSL 217.8■□□□□ 0.442e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 STARD3-203ENST00000443521 673 ntTSL 515.51■□□□□ 0.072e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 STARD3-208ENST00000488876 2404 ntTSL 215.41■□□□□ 0.062e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 STARD3-207ENST00000484773 916 ntTSL 315.07■□□□□ 02e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 STARD3-221ENST00000582874 591 ntTSL 315.01□□□□□ -0.012e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 STARD3-211ENST00000578232 851 ntTSL 212.51□□□□□ -0.412e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 STARD3-206ENST00000481171 3451 ntTSL 211.47□□□□□ -0.572e-6■□□□□ 10.9
SF3A3Q12874 LAMA5-209ENST00000481120 386 ntTSL 219.99■□□□□ 0.793e-16■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 AGFG2-202ENST00000429987 928 ntTSL 315.86■□□□□ 0.132e-7■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.412e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 GGCX-207ENST00000473665 869 ntTSL 29.95□□□□□ -0.822e-7■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 LINC01089-203ENST00000535614 480 ntTSL 413.49□□□□□ -0.259e-12■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.034e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 PRKAA1-206ENST00000506652 1082 ntTSL 57.69□□□□□ -1.184e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 PRKAA1-201ENST00000296800 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.194e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.554e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 PRKAA1-207ENST00000509874 692 ntTSL 45.12□□□□□ -1.594e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 ACTN4-206ENST00000489451 654 ntTSL 310.07□□□□□ -0.87e-14■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 ACTN4-209ENST00000586538 546 ntTSL 59.62□□□□□ -0.877e-14■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.34e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 CSNK2A1-202ENST00000349736 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.724e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 CSNK2A1-201ENST00000217244 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.894e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.294e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 RBM14-208ENST00000496694 562 ntTSL 56.55□□□□□ -1.363e-7■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.643e-7■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.023e-7■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 RRM2-206ENST00000474701 1060 ntTSL 212.78□□□□□ -0.363e-7■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 RRM2-212ENST00000615152 3434 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.453e-7■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 RRM2-201ENST00000304567 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.933e-7■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 RRM2-213ENST00000641198 3431 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.213e-7■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 RRM2-207ENST00000485717 573 ntTSL 1 (best)5.17□□□□□ -1.583e-7■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 PTTG1IP-206ENST00000480234 398 ntTSL 317.33■□□□□ 0.362e-13■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 CENPT-227ENST00000568495 1098 ntTSL 512.08□□□□□ -0.482e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 AKT2-224ENST00000492463 737 ntTSL 510.35□□□□□ -0.752e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 SMG1-208ENST00000563448 2016 ntTSL 29.9□□□□□ -0.823e-7■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 AKT2-242ENST00000601166 554 ntTSL 59.35□□□□□ -0.912e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 RPL17-201ENST00000578528 481 ntTSL 321.91■■□□□ 1.12e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.642e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 RPL17-202ENST00000578532 684 ntTSL 217.37■□□□□ 0.372e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 RPL17-218ENST00000583637 758 ntTSL 317.37■□□□□ 0.372e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 RPL17-206ENST00000579495 914 ntTSL 216.67■□□□□ 0.262e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 RPL17-221ENST00000615760 650 ntTSL 314.92□□□□□ -0.022e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 RPL17-209ENST00000580387 827 ntTSL 514.89□□□□□ -0.032e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 RPL17-223ENST00000618613 856 ntAPPRIS P1 TSL 314.49□□□□□ -0.092e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 RPL17-C18orf32-201ENST00000332968 948 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.562e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 RPL17-220ENST00000615479 586 ntTSL 511.18□□□□□ -0.622e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 RPL17-211ENST00000581305 593 ntTSL 59.29□□□□□ -0.922e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 RPL17-207ENST00000580210 705 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.932e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 RPL17-205ENST00000579408 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.6□□□□□ -1.032e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 RPL17-222ENST00000617346 795 ntTSL 58.47□□□□□ -1.052e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 RPL17-224ENST00000618619 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.12e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 RPL17-212ENST00000581373 584 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.162e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 RPL17-208ENST00000580261 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.22e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 RPL17-217ENST00000583036 576 ntTSL 36.6□□□□□ -1.352e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 RPL17-215ENST00000582782 562 ntTSL 35.23□□□□□ -1.572e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 RPL17-203ENST00000578966 563 ntTSL 1 (best)4.34□□□□□ -1.712e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 RXRB-204ENST00000483281 1977 ntTSL 519.8■□□□□ 0.763e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.693e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.563e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 WDR73-204ENST00000558487 564 ntTSL 27.96□□□□□ -1.146e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 WDR73-212ENST00000559877 551 ntTSL 37.63□□□□□ -1.196e-6■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 TIAL1-207ENST00000463089 907 ntTSL 57.45□□□□□ -1.227e-28■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 EHBP1-210ENST00000444311 460 ntTSL 54.82□□□□□ -1.649e-11■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 EHBP1-212ENST00000454124 329 ntTSL 33.89□□□□□ -1.799e-11■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.57■□□□□ 0.082e-23■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.322e-23■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.693e-12■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 ZCCHC2-202ENST00000585873 5652 ntTSL 1 (best)20.91■□□□□ 0.943e-12■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 ZCCHC2-210ENST00000591632 608 ntTSL 316.69■□□□□ 0.263e-12■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.23e-12■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 ZCCHC2-211ENST00000621048 704 ntTSL 316.05■□□□□ 0.163e-12■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 SERPINA3-204ENST00000482740 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.43e-12■□□□□ 10.8
SF3A3Q12874 SERPINA3-201ENST00000393078 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.463e-12■□□□□ 10.8
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