RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496694.1

RBM14-208, Transcript of RNA binding motif protein 14, human

TSL 5

Gene RBM14, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM14-208	ENST00000496694	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	20.4	■□□□□ 0.86
RBM14-208	ENST00000496694	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		19.05	■□□□□ 0.64
RBM14-208	ENST00000496694	SENP3	Q9H4L4	574 aa	Predicted RBP	17.47	■□□□□ 0.39
RBM14-208	ENST00000496694	PHF23	Q9BUL5	403 aa	Predicted RBP	17.17	■□□□□ 0.34
RBM14-208	ENST00000496694	FOXD1	Q16676	465 aa		16.35	■□□□□ 0.21
RBM14-208	ENST00000496694	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		16.25	■□□□□ 0.19
RBM14-208	ENST00000496694	POTED	Q86YR6	584 aa		15.92	■□□□□ 0.14
RBM14-208	ENST00000496694	MSH5	O43196	834 aa		15.47	■□□□□ 0.07
RBM14-208	ENST00000496694	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
RBM14-208	ENST00000496694	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RBM14-208	ENST00000496694	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		14.88	□□□□□ -0.03
RBM14-208	ENST00000496694	ADRA2B	P18089	450 aa		14.84	□□□□□ -0.03
RBM14-208	ENST00000496694	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		14.26	□□□□□ -0.13
RBM14-208	ENST00000496694	ABCC9	O60706	1549 aa		13.83	□□□□□ -0.2
RBM14-208	ENST00000496694	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
RBM14-208	ENST00000496694	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		13.78	□□□□□ -0.2
RBM14-208	ENST00000496694	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RBM14-208	ENST00000496694	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM14-208	ENST00000496694	SCAF1	Q9H7N4	1312 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RBM14-208	ENST00000496694	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RBM14-208	ENST00000496694	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM14-208	ENST00000496694	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM14-208	ENST00000496694	NACAD	O15069	1562 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RBM14-208	ENST00000496694	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		13.34	□□□□□ -0.27
RBM14-208	ENST00000496694	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		13.23	□□□□□ -0.29
RBM14-208	ENST00000496694	RNF39	Q9H2S5	420 aa		13.16	□□□□□ -0.3
RBM14-208	ENST00000496694	SCRIB	Q14160	1630 aa		13.11	□□□□□ -0.31
RBM14-208	ENST00000496694	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
RBM14-208	ENST00000496694	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		13.06	□□□□□ -0.32
RBM14-208	ENST00000496694	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		13.03	□□□□□ -0.32
RBM14-208	ENST00000496694	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	13.01	□□□□□ -0.33
RBM14-208	ENST00000496694	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		12.99	□□□□□ -0.33
RBM14-208	ENST00000496694	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		12.98	□□□□□ -0.33
RBM14-208	ENST00000496694	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
RBM14-208	ENST00000496694	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
RBM14-208	ENST00000496694	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		12.85	□□□□□ -0.35
RBM14-208	ENST00000496694	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		12.73	□□□□□ -0.37
RBM14-208	ENST00000496694	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		12.68	□□□□□ -0.38
RBM14-208	ENST00000496694	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	12.6	□□□□□ -0.39
RBM14-208	ENST00000496694	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		12.56	□□□□□ -0.4
RBM14-208	ENST00000496694	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	12.56	□□□□□ -0.4
RBM14-208	ENST00000496694	SMARCA4	P51532	1647 aa		12.54	□□□□□ -0.4
RBM14-208	ENST00000496694	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
RBM14-208	ENST00000496694	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		12.48	□□□□□ -0.41
RBM14-208	ENST00000496694	GRWD1	Q9BQ67	446 aa	Known RBP eCLIP	12.46	□□□□□ -0.41
RBM14-208	ENST00000496694	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		12.45	□□□□□ -0.42
RBM14-208	ENST00000496694	WIZ	O95785	1651 aa		12.42	□□□□□ -0.42
RBM14-208	ENST00000496694	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		12.4	□□□□□ -0.42
RBM14-208	ENST00000496694	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	12.4	□□□□□ -0.42
RBM14-208	ENST00000496694	NCAPD3	P42695	1498 aa		12.39	□□□□□ -0.43
RBM14-208	ENST00000496694	SMARCA2	P51531	1590 aa		12.39	□□□□□ -0.43
RBM14-208	ENST00000496694	POTEH	Q6S545	545 aa		12.38	□□□□□ -0.43
RBM14-208	ENST00000496694	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
RBM14-208	ENST00000496694	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
RBM14-208	ENST00000496694	HMGXB3	Q12766	1538 aa		12.32	□□□□□ -0.44
RBM14-208	ENST00000496694	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	12.28	□□□□□ -0.44
RBM14-208	ENST00000496694	DSG3	P32926	999 aa		12.18	□□□□□ -0.46
RBM14-208	ENST00000496694	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		12.17	□□□□□ -0.46
RBM14-208	ENST00000496694	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	12.16	□□□□□ -0.46
RBM14-208	ENST00000496694		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	12.16	□□□□□ -0.46
RBM14-208	ENST00000496694	CAPN15	O75808	1086 aa		12.12	□□□□□ -0.47
RBM14-208	ENST00000496694	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	12.12	□□□□□ -0.47
RBM14-208	ENST00000496694	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM14-208	ENST00000496694	NES	P48681	1621 aa		12.05	□□□□□ -0.48
RBM14-208	ENST00000496694	CFTR	P13569	1480 aa		12.02	□□□□□ -0.48
RBM14-208	ENST00000496694	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		11.98	□□□□□ -0.49
RBM14-208	ENST00000496694	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		11.91	□□□□□ -0.5
RBM14-208	ENST00000496694	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		11.9	□□□□□ -0.5
RBM14-208	ENST00000496694	ERCC6	Q03468	1493 aa		11.86	□□□□□ -0.51
RBM14-208	ENST00000496694	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM14-208	ENST00000496694	PRDM2	Q13029	1718 aa		11.85	□□□□□ -0.51
RBM14-208	ENST00000496694	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		11.84	□□□□□ -0.51
RBM14-208	ENST00000496694	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	11.81	□□□□□ -0.52
RBM14-208	ENST00000496694	ABCC8	Q09428	1581 aa		11.8	□□□□□ -0.52
RBM14-208	ENST00000496694	ABCB7	O75027	752 aa		11.79	□□□□□ -0.52
RBM14-208	ENST00000496694	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	11.79	□□□□□ -0.52
RBM14-208	ENST00000496694	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		11.78	□□□□□ -0.52
RBM14-208	ENST00000496694	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
RBM14-208	ENST00000496694	CUX1	P39880	1505 aa		11.76	□□□□□ -0.53
RBM14-208	ENST00000496694	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
RBM14-208	ENST00000496694	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	11.76	□□□□□ -0.53
RBM14-208	ENST00000496694	SLC4A2	P04920	1241 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM14-208	ENST00000496694	APLP2	Q06481	763 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM14-208	ENST00000496694	TOPBP1	Q92547	1522 aa		11.75	□□□□□ -0.53
RBM14-208	ENST00000496694	WDR62	O43379	1518 aa		11.73	□□□□□ -0.53
RBM14-208	ENST00000496694	SYNJ1	O43426	1573 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM14-208	ENST00000496694	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		11.72	□□□□□ -0.53
RBM14-208	ENST00000496694	TOP2B	Q02880	1626 aa		11.68	□□□□□ -0.54
RBM14-208	ENST00000496694	TRIM41	Q8WV44	630 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RBM14-208	ENST00000496694	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RBM14-208	ENST00000496694	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		11.67	□□□□□ -0.54
RBM14-208	ENST00000496694	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
RBM14-208	ENST00000496694	CUX2	O14529	1486 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM14-208	ENST00000496694	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM14-208	ENST00000496694	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RBM14-208	ENST00000496694	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RBM14-208	ENST00000496694	SOGA1	O94964	1423 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM14-208	ENST00000496694	RBM42	Q9BTD8	480 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
RBM14-208	ENST00000496694	IFT140	Q96RY7	1462 aa		11.59	□□□□□ -0.55
RBM14-208	ENST00000496694	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	11.58	□□□□□ -0.56

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