RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528156.1

RAB30-AS1-204, Transcript of RAB30 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2

Gene RAB30-AS1, Length 658 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30-AS1-204ENST00000528156 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.88■■■□□ 2.69
RAB30-AS1-204ENST00000528156 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa28.67■■■□□ 2.18
RAB30-AS1-204ENST00000528156 ABCC9O60706 1549 aa28.07■■■□□ 2.08
RAB30-AS1-204ENST00000528156 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.02■■□□□ 1.92
RAB30-AS1-204ENST00000528156 NACADO15069 1562 aa26.91■■□□□ 1.9
RAB30-AS1-204ENST00000528156 MYO15BQ96JP2 1530 aa26.64■■□□□ 1.85
RAB30-AS1-204ENST00000528156 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.63■■□□□ 1.85
RAB30-AS1-204ENST00000528156 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
RAB30-AS1-204ENST00000528156 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.52■■□□□ 1.84
RAB30-AS1-204ENST00000528156 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa26.42■■□□□ 1.82
RAB30-AS1-204ENST00000528156 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.12■■□□□ 1.77
RAB30-AS1-204ENST00000528156 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.06■■□□□ 1.76
RAB30-AS1-204ENST00000528156 SCRIBQ14160 1630 aa26.02■■□□□ 1.76
RAB30-AS1-204ENST00000528156 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.93■■□□□ 1.74
RAB30-AS1-204ENST00000528156 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.79■■□□□ 1.72
RAB30-AS1-204ENST00000528156 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
RAB30-AS1-204ENST00000528156 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.46■■□□□ 1.67
RAB30-AS1-204ENST00000528156 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.27■■□□□ 1.64
RAB30-AS1-204ENST00000528156 SMARCA4P51532 1647 aa24.87■■□□□ 1.57
RAB30-AS1-204ENST00000528156 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
RAB30-AS1-204ENST00000528156 SMARCA2P51531 1590 aa24.77■■□□□ 1.56
RAB30-AS1-204ENST00000528156 NCAPD3P42695 1498 aa24.71■■□□□ 1.55
RAB30-AS1-204ENST00000528156 HMGXB3Q12766 1538 aa24.69■■□□□ 1.54
RAB30-AS1-204ENST00000528156 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.69■■□□□ 1.54
RAB30-AS1-204ENST00000528156 PEG3Q9GZU2 1588 aa24.62■■□□□ 1.53
RAB30-AS1-204ENST00000528156 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
RAB30-AS1-204ENST00000528156 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.53■■□□□ 1.52
RAB30-AS1-204ENST00000528156 WIZO95785 1651 aa24.34■■□□□ 1.49
RAB30-AS1-204ENST00000528156 ERCC6Q03468 1493 aa24.29■■□□□ 1.48
RAB30-AS1-204ENST00000528156 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.24■■□□□ 1.47
RAB30-AS1-204ENST00000528156 NESP48681 1621 aa24.18■■□□□ 1.46
RAB30-AS1-204ENST00000528156 CUX2O14529 1486 aa24.13■■□□□ 1.45
RAB30-AS1-204ENST00000528156 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
RAB30-AS1-204ENST00000528156 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.09■■□□□ 1.45
RAB30-AS1-204ENST00000528156 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
RAB30-AS1-204ENST00000528156 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
RAB30-AS1-204ENST00000528156 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24■■□□□ 1.43
RAB30-AS1-204ENST00000528156 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.96■■□□□ 1.43
RAB30-AS1-204ENST00000528156 PRDM2Q13029 1718 aa23.93■■□□□ 1.42
RAB30-AS1-204ENST00000528156 CFTRP13569 1480 aa23.8■■□□□ 1.4
RAB30-AS1-204ENST00000528156 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.8■■□□□ 1.4
RAB30-AS1-204ENST00000528156 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.79■■□□□ 1.4
RAB30-AS1-204ENST00000528156 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.75■■□□□ 1.39
RAB30-AS1-204ENST00000528156 WDR62O43379 1518 aa23.74■■□□□ 1.39
RAB30-AS1-204ENST00000528156 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.68■■□□□ 1.38
RAB30-AS1-204ENST00000528156 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.53■■□□□ 1.36
RAB30-AS1-204ENST00000528156 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
RAB30-AS1-204ENST00000528156 ABCC8Q09428 1581 aa23.4■■□□□ 1.34
RAB30-AS1-204ENST00000528156 DNMBPQ6XZF7 1577 aa23.36■■□□□ 1.33
RAB30-AS1-204ENST00000528156 TOPBP1Q92547 1522 aa23.34■■□□□ 1.33
RAB30-AS1-204ENST00000528156 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
RAB30-AS1-204ENST00000528156 IFT140Q96RY7 1462 aa23.28■■□□□ 1.32
RAB30-AS1-204ENST00000528156 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
RAB30-AS1-204ENST00000528156 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
RAB30-AS1-204ENST00000528156 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
RAB30-AS1-204ENST00000528156 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
RAB30-AS1-204ENST00000528156 WDR97A6NE52 1622 aa23.07■■□□□ 1.28
RAB30-AS1-204ENST00000528156 CUX1P39880 1505 aa23.05■■□□□ 1.28
RAB30-AS1-204ENST00000528156 FGD5Q6ZNL6 1462 aa23.04■■□□□ 1.28
RAB30-AS1-204ENST00000528156 CHD1O14646 1710 aa23■■□□□ 1.27
RAB30-AS1-204ENST00000528156 SOGA1O94964 1423 aa22.98■■□□□ 1.27
RAB30-AS1-204ENST00000528156 OSCARQ8IYS5 282 aa22.97■■□□□ 1.27
RAB30-AS1-204ENST00000528156 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.97■■□□□ 1.27
RAB30-AS1-204ENST00000528156 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.263e-11■■■■□ 23.2
RAB30-AS1-204ENST00000528156 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.92■■□□□ 1.26
RAB30-AS1-204ENST00000528156 PBRM1Q86U86 1689 aa22.91■■□□□ 1.26
RAB30-AS1-204ENST00000528156 TOP2BQ02880 1626 aa22.86■■□□□ 1.25
RAB30-AS1-204ENST00000528156 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
RAB30-AS1-204ENST00000528156 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
RAB30-AS1-204ENST00000528156 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.81■■□□□ 1.24
RAB30-AS1-204ENST00000528156 SYNJ1O43426 1573 aa22.8■■□□□ 1.24
RAB30-AS1-204ENST00000528156 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
RAB30-AS1-204ENST00000528156 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.8■■□□□ 1.24
RAB30-AS1-204ENST00000528156 GRIN2BQ13224 1484 aa22.79■■□□□ 1.24
RAB30-AS1-204ENST00000528156 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.79■■□□□ 1.24
RAB30-AS1-204ENST00000528156 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.77■■□□□ 1.24
RAB30-AS1-204ENST00000528156 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.77■■□□□ 1.24
RAB30-AS1-204ENST00000528156 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.77■■□□□ 1.24
RAB30-AS1-204ENST00000528156 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.76■■□□□ 1.23
RAB30-AS1-204ENST00000528156 FBLN2P98095 1184 aa22.72■■□□□ 1.23
RAB30-AS1-204ENST00000528156 SYNJ2O15056 1496 aa22.69■■□□□ 1.22
RAB30-AS1-204ENST00000528156 ARHGEF11O15085 1522 aa22.68■■□□□ 1.22
RAB30-AS1-204ENST00000528156 TRIM41Q8WV44 630 aa22.68■■□□□ 1.22
RAB30-AS1-204ENST00000528156 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
RAB30-AS1-204ENST00000528156 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.62■■□□□ 1.21
RAB30-AS1-204ENST00000528156 ADAMTS12P58397 1594 aa22.61■■□□□ 1.21
RAB30-AS1-204ENST00000528156 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.57■■□□□ 1.2
RAB30-AS1-204ENST00000528156 GRIN2AQ12879 1464 aa22.51■■□□□ 1.19
RAB30-AS1-204ENST00000528156 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.48■■□□□ 1.19
RAB30-AS1-204ENST00000528156 ARAP1Q96P48 1450 aa22.45■■□□□ 1.18
RAB30-AS1-204ENST00000528156 CEP170Q5SW79 1584 aa22.42■■□□□ 1.18
RAB30-AS1-204ENST00000528156 CUL7Q14999 1698 aa22.42■■□□□ 1.18
RAB30-AS1-204ENST00000528156 NUP160Q12769 1436 aa22.39■■□□□ 1.17
RAB30-AS1-204ENST00000528156 KIF27Q86VH2 1401 aa22.38■■□□□ 1.17
RAB30-AS1-204ENST00000528156 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.37■■□□□ 1.17
RAB30-AS1-204ENST00000528156 SHROOM2Q13796 1616 aa22.35■■□□□ 1.17
RAB30-AS1-204ENST00000528156 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.29■■□□□ 1.16
RAB30-AS1-204ENST00000528156 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.21■■□□□ 1.15
RAB30-AS1-204ENST00000528156 IGF1RP08069 1367 aa22.19■■□□□ 1.14
RAB30-AS1-204ENST00000528156 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 157.6 ms