Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.786e-10■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.774e-8■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.64e-8■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 SLC19A1-208ENST00000468508 1435 ntTSL 221.33■■□□□ 1.014e-8■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 SLC19A1-206ENST00000460174 600 ntTSL 316.16■□□□□ 0.184e-8■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 SLC19A1-203ENST00000417954 3572 ntTSL 1 (best)15.92■□□□□ 0.144e-8■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.124e-8■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 URM1-206ENST00000483206 731 ntTSL 218.45■□□□□ 0.543e-9■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.053e-13■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.113e-13■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 MSH2-202ENST00000406134 3628 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.683e-13■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 MSH2-204ENST00000461394 416 ntTSL 37.57□□□□□ -1.23e-13■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 26e-12■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.136e-12■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.86e-12■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 SUV39H1-203ENST00000462786 746 ntTSL 219.99■□□□□ 0.796e-12■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.536e-12■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 IRAK1-206ENST00000437278 862 ntTSL 517.02■□□□□ 0.326e-12■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 SUV39H1-204ENST00000482260 778 ntTSL 313.23□□□□□ -0.296e-12■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 BYSL-202ENST00000372996 1299 ntTSL 511.46□□□□□ -0.576e-12■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.683e-9■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 NDFIP1-202ENST00000503388 4164 ntTSL 25.27□□□□□ -1.573e-9■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 RACK1-231ENST00000514183 1439 ntTSL 28.03□□□□□ -1.121e-60■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 SEM1-201ENST00000248566 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.033e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 SEM1-205ENST00000444799 1590 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.533e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 SEM1-206ENST00000449279 699 ntTSL 311.46□□□□□ -0.573e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 SEM1-204ENST00000417009 350 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.613e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 SEM1-214ENST00000613919 610 ntTSL 211.05□□□□□ -0.643e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 SEM1-210ENST00000488005 775 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.683e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 SEM1-203ENST00000413065 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.693e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 SEM1-223ENST00000623498 582 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.773e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 SEM1-224ENST00000623693 729 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.853e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 SEM1-207ENST00000466986 507 ntTSL 29.07□□□□□ -0.963e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 SEM1-219ENST00000618105 544 ntTSL 26.99□□□□□ -1.293e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 SEM1-217ENST00000617133 591 ntTSL 26.8□□□□□ -1.323e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 SEM1-220ENST00000619259 462 ntTSL 25.92□□□□□ -1.463e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 SEM1-209ENST00000482389 2773 ntTSL 22.98□□□□□ -1.933e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 NUCB1-209ENST00000465524 839 ntTSL 519.07■□□□□ 0.641e-9■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 NUCB1-210ENST00000469291 582 ntTSL 216.58■□□□□ 0.241e-9■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 CYBA-202ENST00000561972 464 ntTSL 318.87■□□□□ 0.615e-9■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.031e-6■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 NAP1L1-213ENST00000548044 1339 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.451e-6■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.171e-32■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 RPL10-209ENST00000451365 713 ntTSL 1 (best)12.64□□□□□ -0.391e-32■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 TCF3-215ENST00000590684 1313 ntTSL 319.58■□□□□ 0.738e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 TCF3-205ENST00000585731 1222 ntTSL 217.3■□□□□ 0.368e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 AKT1-204ENST00000544168 1564 ntTSL 219.97■□□□□ 0.793e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 AKT1-207ENST00000554192 922 ntTSL 217.22■□□□□ 0.353e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.427e-15■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.932e-6■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 PRSS21-204ENST00000570629 626 ntTSL 214.83□□□□□ -0.041e-19■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.21e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 AAGAB-201ENST00000261880 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.361e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 TNPO3-205ENST00000627585 4514 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.773e-9■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 TNPO3-203ENST00000471234 3283 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.793e-9■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 OGDH-210ENST00000631326 4116 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.924e-6■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 TNPO3-201ENST00000265388 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.933e-9■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 CACYBP-209ENST00000613570 2835 ntTSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.967e-15■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 TNPO3-204ENST00000482320 3585 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.983e-9■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 AAGAB-202ENST00000538028 1777 ntTSL 28.89□□□□□ -0.991e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 PTPN7-217ENST00000495688 2689 ntTSL 1 (best)14.3□□□□□ -0.122e-9■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 PTPN7-202ENST00000367279 3265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.242e-9■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 PTPN7-201ENST00000309017 3765 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.472e-9■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.133e-8■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 MARCH6-214ENST00000606497 1334 ntTSL 47.93□□□□□ -1.142e-26■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.272e-26■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 ACADVL-232ENST00000583074 410 ntTSL 521.87■■□□□ 1.097e-9■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 ACADVL-218ENST00000579391 341 ntTSL 218.89■□□□□ 0.617e-9■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 ACADVL-239ENST00000585203 947 ntTSL 518.1■□□□□ 0.497e-9■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 ACADVL-222ENST00000579894 429 ntTSL 216.87■□□□□ 0.297e-9■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.583e-9■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.713e-9■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 CHPT1-202ENST00000546490 476 ntTSL 222.87■■□□□ 1.255e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.691e-8■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 PPDPF-203ENST00000464438 373 ntTSL 222.23■■□□□ 1.158e-9■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 TRAP1-213ENST00000575707 785 ntTSL 520.14■□□□□ 0.815e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 TRAP1-210ENST00000574494 547 ntTSL 215.87■□□□□ 0.135e-7■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.272e-28■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 DBNL-212ENST00000452661 897 ntTSL 216.14■□□□□ 0.172e-6■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 CIZ1-209ENST00000420484 684 ntTSL 335.91■■■■□ 3.348e-9■□□□□ 10.3
PABPC4Q13310 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.361e-30■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 TUBB-207ENST00000396384 2823 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.591e-30■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 TUBB-208ENST00000396389 2903 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.611e-30■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 PSD4-207ENST00000464559 2424 ntTSL 226.32■■□□□ 1.89e-9■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 PKN3-202ENST00000483521 597 ntTSL 521.9■■□□□ 1.11e-16■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.919e-9■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 NMRAL1-214ENST00000575002 562 ntTSL 419.73■□□□□ 0.759e-9■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.639e-9■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.61e-16■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.439e-9■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.359e-9■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.321e-6■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.239e-9■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 PSD4-206ENST00000460725 2763 ntTSL 216.41■□□□□ 0.229e-9■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.179e-9■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 PSD4-204ENST00000418251 5600 ntTSL 515.49■□□□□ 0.079e-9■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.399e-9■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 CAPN2-202ENST00000433674 3264 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.581e-6■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 BIN3-208ENST00000520489 3589 ntTSL 211.35□□□□□ -0.599e-9■□□□□ 10.2
PABPC4Q13310 PSD4-205ENST00000441564 11234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.649e-9■□□□□ 10.2
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