Protein–RNA interactions for Protein: Q14191

WRN, Werner syndrome ATP-dependent helicase, humanhuman

Predicted RBP eCLIP

Length 1,432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WRNQ14191 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.542e-9■■■■■ 83.6
WRNQ14191 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.252e-9■■■■■ 83.6
WRNQ14191 CERCAM-207ENST00000463535 1205 ntTSL 1 (best)29.11■■■□□ 2.252e-9■■■■■ 83.6
WRNQ14191 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.242e-9■■■■■ 83.6
WRNQ14191 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC27.75■■■□□ 2.032e-9■■■■■ 83.6
WRNQ14191 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.912e-9■■■■■ 83.6
WRNQ14191 CERCAM-205ENST00000420512 887 ntTSL 324.67■■□□□ 1.542e-9■■■■■ 83.6
WRNQ14191 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.542e-9■■■■■ 83.6
WRNQ14191 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.292e-9■■■■■ 83.6
WRNQ14191 CERCAM-211ENST00000487001 553 ntTSL 519.43■□□□□ 0.72e-9■■■■■ 83.6
WRNQ14191 CERCAM-210ENST00000483893 587 ntTSL 416.02■□□□□ 0.152e-9■■■■■ 83.6
WRNQ14191 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.722e-9■■■■■ 83.6
WRNQ14191 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.493e-6■■■■■ 81.2
WRNQ14191 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.073e-6■■■■■ 81.2
WRNQ14191 SLC48A1-207ENST00000549243 577 ntTSL 334.65■■■■□ 3.144e-7■■■■■ 80.6
WRNQ14191 ZNF536-204ENST00000591488 655 ntTSL 329.58■■■□□ 2.334e-7■■■■■ 80.6
WRNQ14191 ZNF536-202ENST00000585628 3198 ntTSL 521.23■□□□□ 0.994e-7■■■■■ 80.6
WRNQ14191 SLC48A1-206ENST00000548498 618 ntTSL 317.7■□□□□ 0.424e-7■■■■■ 80.6
WRNQ14191 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.954e-7■■■■■ 80.6
WRNQ14191 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.912e-9■■■■■ 77.9
WRNQ14191 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.985e-6■■■■■ 77.6
WRNQ14191 C8orf33-204ENST00000530455 2676 ntTSL 1 (best)25.51■■□□□ 1.675e-6■■■■■ 77.6
WRNQ14191 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC44.7■■■■■ 4.752e-8■■■■■ 75.2
WRNQ14191 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.662e-8■■■■■ 75.2
WRNQ14191 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.582e-8■■■■■ 75.2
WRNQ14191 PTPRF-207ENST00000436724 2168 ntTSL 1 (best)34.72■■■■□ 3.152e-8■■■■■ 75.2
WRNQ14191 UQCR11-204ENST00000593029 533 ntTSL 234.67■■■■□ 3.142e-8■■■■■ 75.2
WRNQ14191 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.142e-8■■■■■ 75.2
WRNQ14191 UQCR11-205ENST00000593264 409 ntTSL 334.67■■■■□ 3.142e-8■■■■■ 75.2
WRNQ14191 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.862e-8■■■■■ 75.2
WRNQ14191 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.182e-8■■■■■ 75.2
WRNQ14191 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.132e-8■■■■■ 75.2
WRNQ14191 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 22e-8■■■■■ 75.2
WRNQ14191 LRRC20-202ENST00000357631 2906 ntTSL 227.56■■■□□ 22e-8■■■■■ 75.2
WRNQ14191 LRRC20-207ENST00000446961 663 ntTSL 227.24■■□□□ 1.952e-8■■■■■ 75.2
WRNQ14191 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.892e-8■■■■■ 75.2
WRNQ14191 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.812e-8■■■■■ 75.2
WRNQ14191 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.792e-8■■■■■ 75.2
WRNQ14191 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.792e-8■■■■■ 75.2
WRNQ14191 CTDP1-207ENST00000591598 3228 ntTSL 1 (best)25.8■■□□□ 1.722e-8■■■■■ 75.2
WRNQ14191 AL590705.5-201ENST00000527128 1575 ntTSL 525.14■■□□□ 1.622e-8■■■■■ 75.2
WRNQ14191 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.492e-8■■■■■ 75.2
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WRNQ14191 PTPRF-202ENST00000372405 1962 ntTSL 1 (best)22.8■■□□□ 1.242e-8■■■■■ 75.2
WRNQ14191 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.192e-8■■■■■ 75.2
WRNQ14191 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.062e-8■■■■■ 75.2
WRNQ14191 PTPRF-208ENST00000437607 788 ntTSL 1 (best)21.52■■□□□ 1.042e-8■■■■■ 75.2
WRNQ14191 CTDP1-206ENST00000590635 489 ntTSL 521.21■□□□□ 0.992e-8■■■■■ 75.2
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WRNQ14191 CTDP1-202ENST00000299543 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.842e-8■■■■■ 75.2
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WRNQ14191 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.988e-8■■■■■ 71
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WRNQ14191 SYCP2L-202ENST00000341041 3069 ntTSL 219.31■□□□□ 0.681e-323■■■■■ 70.3
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WRNQ14191 TRAPPC9-203ENST00000517667 518 ntTSL 320.88■□□□□ 0.938e-10■■■■■ 68.9
WRNQ14191 TRAPPC9-208ENST00000520857 3693 ntTSL 1 (best)18.68■□□□□ 0.588e-10■■■■■ 68.9
WRNQ14191 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.488e-10■■■■■ 68.9
WRNQ14191 TRAPPC9-202ENST00000438773 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.338e-10■■■■■ 68.9
WRNQ14191 TRAPPC9-207ENST00000520532 560 ntTSL 513.07□□□□□ -0.328e-10■■■■■ 68.9
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WRNQ14191 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.851e-7■■■■■ 66.8
WRNQ14191 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.641e-7■■■■■ 66.8
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WRNQ14191 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.441e-7■■■■■ 66.8
WRNQ14191 GGA2-203ENST00000562944 388 ntTSL 541.16■■■■■ 4.181e-7■■■■■ 66.8
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WRNQ14191 SYNGAP1-206ENST00000479510 2073 ntTSL 238.34■■■■□ 3.731e-7■■■■■ 66.8
WRNQ14191 GGA2-204ENST00000563047 366 ntTSL 538■■■■□ 3.671e-7■■■■■ 66.8
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WRNQ14191 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.541e-7■■■■■ 66.8
WRNQ14191 GGA2-212ENST00000568799 1403 ntTSL 537.09■■■■□ 3.531e-7■■■■■ 66.8
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