RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617223.1

KLF16-204, Transcript of Kruppel like factor 16, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KLF16, Length 1,133 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF16-204ENST00000617223 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.84■■■■■ 7.17
KLF16-204ENST00000617223 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.52■■■■■ 6.16
KLF16-204ENST00000617223 ABCC9O60706 1549 aa53.23■■■■■ 6.11
KLF16-204ENST00000617223 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.82■■■■■ 5.73
KLF16-204ENST00000617223 NACADO15069 1562 aa50.55■■■■■ 5.68
KLF16-204ENST00000617223 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.48■■■■■ 5.67
KLF16-204ENST00000617223 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.96■■■■■ 5.59
KLF16-204ENST00000617223 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.65■■■■■ 5.54
KLF16-204ENST00000617223 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.64■■■■■ 5.54
KLF16-204ENST00000617223 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.64■■■■■ 5.54
KLF16-204ENST00000617223 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.61■■■■■ 5.53
KLF16-204ENST00000617223 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.44■■■■■ 5.51
KLF16-204ENST00000617223 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.28■■■■■ 5.48
KLF16-204ENST00000617223 SCRIBQ14160 1630 aa48.8■■■■■ 5.4
KLF16-204ENST00000617223 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.68■■■■■ 5.38
KLF16-204ENST00000617223 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.09■■■■■ 5.29
KLF16-204ENST00000617223 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.07■■■■■ 5.29
KLF16-204ENST00000617223 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.92■■■■■ 5.26
KLF16-204ENST00000617223 NCAPD3P42695 1498 aa46.68■■■■■ 5.06
KLF16-204ENST00000617223 SMARCA4P51532 1647 aa46.59■■■■■ 5.05
KLF16-204ENST00000617223 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.57■■■■■ 5.05
KLF16-204ENST00000617223 SMARCA2P51531 1590 aa46.47■■■■■ 5.03
KLF16-204ENST00000617223 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.43■■■■■ 5.02
KLF16-204ENST00000617223 HMGXB3Q12766 1538 aa46.33■■■■■ 5.01
KLF16-204ENST00000617223 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.16■■■■■ 4.98
KLF16-204ENST00000617223 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.13■■■■■ 4.98
KLF16-204ENST00000617223 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.1■■■■■ 4.97
KLF16-204ENST00000617223 ERCC6Q03468 1493 aa45.97■■■■■ 4.95
KLF16-204ENST00000617223 NESP48681 1621 aa45.81■■■■■ 4.92
KLF16-204ENST00000617223 CUX2O14529 1486 aa45.74■■■■■ 4.91
KLF16-204ENST00000617223 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.56■■■■■ 4.88
KLF16-204ENST00000617223 WIZO95785 1651 aa45.56■■■■■ 4.88
KLF16-204ENST00000617223 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.38■■■■■ 4.86
KLF16-204ENST00000617223 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.33■■■■■ 4.85
KLF16-204ENST00000617223 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.29■■■■■ 4.84
KLF16-204ENST00000617223 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.29■■■■■ 4.84
KLF16-204ENST00000617223 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.24■■■■■ 4.83
KLF16-204ENST00000617223 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.21■■■■■ 4.83
KLF16-204ENST00000617223 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.01■■■■■ 4.8
KLF16-204ENST00000617223 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.87■■■■■ 4.77
KLF16-204ENST00000617223 CFTRP13569 1480 aa44.83■■■■■ 4.77
KLF16-204ENST00000617223 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.78■■■■■ 4.76
KLF16-204ENST00000617223 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.76■■■■■ 4.76
KLF16-204ENST00000617223 WDR62O43379 1518 aa44.73■■■■■ 4.75
KLF16-204ENST00000617223 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.53■■■■■ 4.72
KLF16-204ENST00000617223 PRDM2Q13029 1718 aa44.36■■■■■ 4.69
KLF16-204ENST00000617223 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.34■■■■■ 4.69
KLF16-204ENST00000617223 TOPBP1Q92547 1522 aa43.94■■■■■ 4.63
KLF16-204ENST00000617223 ABCC8Q09428 1581 aa43.92■■■■■ 4.62
KLF16-204ENST00000617223 IFT140Q96RY7 1462 aa43.87■■■■■ 4.61
KLF16-204ENST00000617223 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.8■■■■■ 4.6
KLF16-204ENST00000617223 OSCARQ8IYS5 282 aa43.79■■■■■ 4.6
KLF16-204ENST00000617223 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.74■■■■■ 4.59
KLF16-204ENST00000617223 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.62■■■■■ 4.57
KLF16-204ENST00000617223 TRIM41Q8WV44 630 aa43.54■■■■■ 4.56
KLF16-204ENST00000617223 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.51■■■■■ 4.56
KLF16-204ENST00000617223 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.5■■■■■ 4.55
KLF16-204ENST00000617223 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.5■■■■■ 4.55
KLF16-204ENST00000617223 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.43■■■■■ 4.54
KLF16-204ENST00000617223 SOGA1O94964 1423 aa43.37■■■■■ 4.53
KLF16-204ENST00000617223 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.35■■■■■ 4.53
KLF16-204ENST00000617223 CUX1P39880 1505 aa43.29■■■■■ 4.52
KLF16-204ENST00000617223 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.29■■■■■ 4.52
KLF16-204ENST00000617223 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.23■■■■■ 4.51
KLF16-204ENST00000617223 FBLN2P98095 1184 aa43.14■■■■■ 4.5
KLF16-204ENST00000617223 CHD1O14646 1710 aa43.11■■■■■ 4.49
KLF16-204ENST00000617223 WDR97A6NE52 1622 aa43.09■■■■■ 4.49
KLF16-204ENST00000617223 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.08■■■■■ 4.49
KLF16-204ENST00000617223 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.08■■■■■ 4.49
KLF16-204ENST00000617223 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.08■■■■■ 4.49
KLF16-204ENST00000617223 ARHGEF11O15085 1522 aa43■■■■■ 4.47
KLF16-204ENST00000617223 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.97■■■■■ 4.47
KLF16-204ENST00000617223 GRIN2BQ13224 1484 aa42.93■■■■■ 4.46
KLF16-204ENST00000617223 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.89■■■■■ 4.46
KLF16-204ENST00000617223 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.88■■■■■ 4.45
KLF16-204ENST00000617223 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.82■■■■■ 4.45
KLF16-204ENST00000617223 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.82■■■■■ 4.45
KLF16-204ENST00000617223 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.76■■■■■ 4.441e-7■■■■■ 66.8
KLF16-204ENST00000617223 SYNJ2O15056 1496 aa42.74■■■■■ 4.43
KLF16-204ENST00000617223 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.74■■■■■ 4.43
KLF16-204ENST00000617223 PBRM1Q86U86 1689 aa42.73■■■■■ 4.43
KLF16-204ENST00000617223 TOP2BQ02880 1626 aa42.7■■■■■ 4.43
KLF16-204ENST00000617223 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.69■■■■■ 4.42
KLF16-204ENST00000617223 SYNJ1O43426 1573 aa42.68■■■■■ 4.42
KLF16-204ENST00000617223 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.68■■■■■ 4.42
KLF16-204ENST00000617223 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.63■■■■■ 4.42
KLF16-204ENST00000617223 ARAP1Q96P48 1450 aa42.58■■■■■ 4.41
KLF16-204ENST00000617223 GRIN2AQ12879 1464 aa42.36■■■■■ 4.37
KLF16-204ENST00000617223 ADAMTS12P58397 1594 aa42.35■■■■■ 4.37
KLF16-204ENST00000617223 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.3■■■■■ 4.36
KLF16-204ENST00000617223 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.29■■■■■ 4.36
KLF16-204ENST00000617223 NUP160Q12769 1436 aa42.2■■■■■ 4.35
KLF16-204ENST00000617223 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.17■■■■■ 4.34
KLF16-204ENST00000617223 CEP170Q5SW79 1584 aa42.17■■■■■ 4.34
KLF16-204ENST00000617223 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.99■■■■■ 4.31
KLF16-204ENST00000617223 SHROOM2Q13796 1616 aa41.95■■■■■ 4.31
KLF16-204ENST00000617223 KIF27Q86VH2 1401 aa41.93■■■■■ 4.3
KLF16-204ENST00000617223 IGF1RP08069 1367 aa41.87■■■■■ 4.29
KLF16-204ENST00000617223 JPH4Q96JJ6 628 aa41.84■■■■■ 4.29
KLF16-204ENST00000617223 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms