RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552351.5

CHPT1-210, Transcript of choline phosphotransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene CHPT1, Length 1,524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPT1-210ENST00000552351 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.07■■■■■ 8.01
CHPT1-210ENST00000552351 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.82■■■■■ 6.85
CHPT1-210ENST00000552351 ABCC9O60706 1549 aa56.09■■■■■ 6.57
CHPT1-210ENST00000552351 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.27■■■■■ 6.28
CHPT1-210ENST00000552351 NACADO15069 1562 aa54.26■■■■■ 6.28
CHPT1-210ENST00000552351 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.23■■■■■ 6.27
CHPT1-210ENST00000552351 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.1■■■■■ 6.25
CHPT1-210ENST00000552351 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.06■■■■■ 6.24
CHPT1-210ENST00000552351 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.95■■■■■ 6.23
CHPT1-210ENST00000552351 UNC13AQ9UPW8 1703 aa52.98■■■■■ 6.07
CHPT1-210ENST00000552351 SCRIBQ14160 1630 aa52.62■■■■■ 6.01
CHPT1-210ENST00000552351 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.52■■■■■ 6
CHPT1-210ENST00000552351 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.4■■■■■ 5.98
CHPT1-210ENST00000552351 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.16■■■■■ 5.94
CHPT1-210ENST00000552351 DNAJC5BQ9UF47 199 aa51.13■■■■■ 5.78
CHPT1-210ENST00000552351 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.13■■■■■ 5.78
CHPT1-210ENST00000552351 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.82■■■■■ 5.73
CHPT1-210ENST00000552351 CECR2Q9BXF3 1484 aa50.56■■■■■ 5.68
CHPT1-210ENST00000552351 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.45■■■■■ 5.67
CHPT1-210ENST00000552351 SMARCA4P51532 1647 aa50.43■■■■■ 5.66
CHPT1-210ENST00000552351 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.09■■■■■ 5.61
CHPT1-210ENST00000552351 SMARCA2P51531 1590 aa50.08■■■■■ 5.61
CHPT1-210ENST00000552351 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.05■■■■■ 5.6
CHPT1-210ENST00000552351 NCAPD3P42695 1498 aa50.03■■■■■ 5.6
CHPT1-210ENST00000552351 PEG3Q9GZU2 1588 aa50■■■■■ 5.6
CHPT1-210ENST00000552351 HMGXB3Q12766 1538 aa49.85■■■■■ 5.57
CHPT1-210ENST00000552351 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.67■■■■■ 5.54
CHPT1-210ENST00000552351 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.64■■■■■ 5.54
CHPT1-210ENST00000552351 WIZO95785 1651 aa49.58■■■■■ 5.53
CHPT1-210ENST00000552351 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.12■■■■■ 5.45
CHPT1-210ENST00000552351 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.7■■■■■ 5.39
CHPT1-210ENST00000552351 NESP48681 1621 aa48.61■■■■■ 5.37
CHPT1-210ENST00000552351 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.55■■■■■ 5.36
CHPT1-210ENST00000552351 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.49■■■■■ 5.35
CHPT1-210ENST00000552351 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.48■■■■■ 5.35
CHPT1-210ENST00000552351 ERCC6Q03468 1493 aa48.37■■■■■ 5.33
CHPT1-210ENST00000552351 CFTRP13569 1480 aa48.36■■■■■ 5.33
CHPT1-210ENST00000552351 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.32■■■■■ 5.33
CHPT1-210ENST00000552351 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.14■■■■■ 5.3
CHPT1-210ENST00000552351 PRDM2Q13029 1718 aa48.1■■■■■ 5.29
CHPT1-210ENST00000552351 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.98■■■■■ 5.27
CHPT1-210ENST00000552351 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.92■■■■■ 5.26
CHPT1-210ENST00000552351 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.91■■■■■ 5.26
CHPT1-210ENST00000552351 CUX2O14529 1486 aa47.83■■■■■ 5.25
CHPT1-210ENST00000552351 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.79■■■■■ 5.24
CHPT1-210ENST00000552351 WDR62O43379 1518 aa47.65■■■■■ 5.22
CHPT1-210ENST00000552351 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.46■■■■■ 5.19
CHPT1-210ENST00000552351 ABCC8Q09428 1581 aa47.36■■■■■ 5.17
CHPT1-210ENST00000552351 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.27■■■■■ 5.16
CHPT1-210ENST00000552351 TOPBP1Q92547 1522 aa47.25■■■■■ 5.15
CHPT1-210ENST00000552351 CUX1P39880 1505 aa46.99■■■■■ 5.11
CHPT1-210ENST00000552351 IFT140Q96RY7 1462 aa46.92■■■■■ 5.1
CHPT1-210ENST00000552351 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.87■■■■■ 5.09
CHPT1-210ENST00000552351 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.82■■■■■ 5.091e-7■■■■■ 66.8
CHPT1-210ENST00000552351 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.79■■■■■ 5.08
CHPT1-210ENST00000552351 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.75■■■■■ 5.07
CHPT1-210ENST00000552351 TOP2BQ02880 1626 aa46.73■■■■■ 5.07
CHPT1-210ENST00000552351 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.73■■■■■ 5.07
CHPT1-210ENST00000552351 SYNJ1O43426 1573 aa46.67■■■■■ 5.06
CHPT1-210ENST00000552351 SOGA1O94964 1423 aa46.66■■■■■ 5.06
CHPT1-210ENST00000552351 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.59■■■■■ 5.05
CHPT1-210ENST00000552351 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.59■■■■■ 5.05
CHPT1-210ENST00000552351 WDR97A6NE52 1622 aa46.5■■■■■ 5.03
CHPT1-210ENST00000552351 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.5■■■■■ 5.03
CHPT1-210ENST00000552351 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.4■■■■■ 5.02
CHPT1-210ENST00000552351 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.36■■■■■ 5.013e-7■■■■□ 24
CHPT1-210ENST00000552351 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.31■■■■■ 5
CHPT1-210ENST00000552351 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.19■■■■■ 4.99
CHPT1-210ENST00000552351 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.16■■■■■ 4.98
CHPT1-210ENST00000552351 GRIN2BQ13224 1484 aa46.12■■■■■ 4.97
CHPT1-210ENST00000552351 PBRM1Q86U86 1689 aa46.07■■■■■ 4.97
CHPT1-210ENST00000552351 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.01■■■■■ 4.96
CHPT1-210ENST00000552351 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa45.97■■■■■ 4.95
CHPT1-210ENST00000552351 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.93■■■■■ 4.94
CHPT1-210ENST00000552351 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.88■■■■■ 4.93
CHPT1-210ENST00000552351 TRIM41Q8WV44 630 aa45.87■■■■■ 4.93
CHPT1-210ENST00000552351 CHD1O14646 1710 aa45.85■■■■■ 4.93
CHPT1-210ENST00000552351 OSCARQ8IYS5 282 aa45.84■■■■■ 4.93
CHPT1-210ENST00000552351 KIF27Q86VH2 1401 aa45.84■■■■■ 4.93
CHPT1-210ENST00000552351 SYNJ2O15056 1496 aa45.8■■■■■ 4.92
CHPT1-210ENST00000552351 ADAMTS12P58397 1594 aa45.71■■■■■ 4.91
CHPT1-210ENST00000552351 FBLN2P98095 1184 aa45.71■■■■■ 4.91
CHPT1-210ENST00000552351 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.7■■■■■ 4.91
CHPT1-210ENST00000552351 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.65■■■■■ 4.9
CHPT1-210ENST00000552351 IGF1RP08069 1367 aa45.57■■■■■ 4.89
CHPT1-210ENST00000552351 CUL7Q14999 1698 aa45.54■■■■■ 4.88
CHPT1-210ENST00000552351 GRIN2AQ12879 1464 aa45.53■■■■■ 4.88
CHPT1-210ENST00000552351 CHIC1Q5VXU3 224 aa45.47■■■■■ 4.87
CHPT1-210ENST00000552351 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.39■■■■■ 4.86
CHPT1-210ENST00000552351 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.37■■■■■ 4.85
CHPT1-210ENST00000552351 NUP160Q12769 1436 aa45.32■■■■■ 4.85
CHPT1-210ENST00000552351 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa45.31■■■■■ 4.84
CHPT1-210ENST00000552351 CEP170Q5SW79 1584 aa45.27■■■■■ 4.84
CHPT1-210ENST00000552351 EEA1Q15075 1411 aa45.21■■■■■ 4.83
CHPT1-210ENST00000552351 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa45.11■■■■■ 4.81
CHPT1-210ENST00000552351 ARHGEF11O15085 1522 aa45.1■■■■■ 4.81
CHPT1-210ENST00000552351 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.07■■■■■ 4.81
CHPT1-210ENST00000552351 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa45.07■■■■■ 4.81
CHPT1-210ENST00000552351 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.07■■■■■ 4.81
CHPT1-210ENST00000552351 PRXQ9BXM0 1461 aa45.02■■■■■ 4.8
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