RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541015.5

KLF16-202, Transcript of Kruppel like factor 16, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene KLF16, Length 1,134 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF16-202ENST00000541015 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.26■■■■■ 6.44
KLF16-202ENST00000541015 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.62■■■■■ 5.53
KLF16-202ENST00000541015 ABCC9O60706 1549 aa49.52■■■■■ 5.52
KLF16-202ENST00000541015 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.2■■■■■ 5.15
KLF16-202ENST00000541015 NACADO15069 1562 aa46.9■■■■■ 5.1
KLF16-202ENST00000541015 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.57■■■■■ 5.05
KLF16-202ENST00000541015 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.36■■■■■ 5.01
KLF16-202ENST00000541015 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.29■■■■■ 5
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KLF16-202ENST00000541015 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.08■■■■■ 4.97
KLF16-202ENST00000541015 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.83■■■■■ 4.93
KLF16-202ENST00000541015 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.79■■■■■ 4.92
KLF16-202ENST00000541015 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.7■■■■■ 4.91
KLF16-202ENST00000541015 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.27■■■■■ 4.84
KLF16-202ENST00000541015 SCRIBQ14160 1630 aa45.16■■■■■ 4.82
KLF16-202ENST00000541015 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.75■■■■■ 4.75
KLF16-202ENST00000541015 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.69■■■■■ 4.74
KLF16-202ENST00000541015 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.64■■■■■ 4.74
KLF16-202ENST00000541015 NCAPD3P42695 1498 aa43.28■■■■■ 4.52
KLF16-202ENST00000541015 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.14■■■■■ 4.5
KLF16-202ENST00000541015 SMARCA4P51532 1647 aa43.11■■■■■ 4.49
KLF16-202ENST00000541015 SMARCA2P51531 1590 aa43.05■■■■■ 4.48
KLF16-202ENST00000541015 HMGXB3Q12766 1538 aa42.98■■■■■ 4.47
KLF16-202ENST00000541015 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.92■■■■■ 4.46
KLF16-202ENST00000541015 ERCC6Q03468 1493 aa42.8■■■■■ 4.44
KLF16-202ENST00000541015 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.74■■■■■ 4.43
KLF16-202ENST00000541015 CUX2O14529 1486 aa42.73■■■■■ 4.43
KLF16-202ENST00000541015 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.73■■■■■ 4.43
KLF16-202ENST00000541015 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.61■■■■■ 4.41
KLF16-202ENST00000541015 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.56■■■■■ 4.4
KLF16-202ENST00000541015 NESP48681 1621 aa42.53■■■■■ 4.4
KLF16-202ENST00000541015 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.31■■■■■ 4.36
KLF16-202ENST00000541015 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
KLF16-202ENST00000541015 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.06■■■■■ 4.32
KLF16-202ENST00000541015 WIZO95785 1651 aa42.05■■■■■ 4.32
KLF16-202ENST00000541015 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.02■■■■■ 4.32
KLF16-202ENST00000541015 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.95■■■■■ 4.31
KLF16-202ENST00000541015 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.69■■■■■ 4.27
KLF16-202ENST00000541015 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.69■■■■■ 4.26
KLF16-202ENST00000541015 WDR62O43379 1518 aa41.59■■■■■ 4.25
KLF16-202ENST00000541015 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
KLF16-202ENST00000541015 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.53■■■■■ 4.24
KLF16-202ENST00000541015 CFTRP13569 1480 aa41.5■■■■■ 4.23
KLF16-202ENST00000541015 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.48■■■■■ 4.23
KLF16-202ENST00000541015 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
KLF16-202ENST00000541015 PRDM2Q13029 1718 aa41.1■■■■■ 4.17
KLF16-202ENST00000541015 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.06■■■■■ 4.16
KLF16-202ENST00000541015 OSCARQ8IYS5 282 aa40.74■■■■■ 4.11
KLF16-202ENST00000541015 TRIM41Q8WV44 630 aa40.73■■■■■ 4.11
KLF16-202ENST00000541015 IFT140Q96RY7 1462 aa40.71■■■■■ 4.11
KLF16-202ENST00000541015 TOPBP1Q92547 1522 aa40.7■■■■■ 4.11
KLF16-202ENST00000541015 ABCC8Q09428 1581 aa40.65■■■■■ 4.1
KLF16-202ENST00000541015 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.59■■■■■ 4.09
KLF16-202ENST00000541015 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.57■■■■■ 4.08
KLF16-202ENST00000541015 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.41■■■■■ 4.06
KLF16-202ENST00000541015 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
KLF16-202ENST00000541015 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.29■■■■■ 4.04
KLF16-202ENST00000541015 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.23■■■■■ 4.03
KLF16-202ENST00000541015 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.2■■■■■ 4.03
KLF16-202ENST00000541015 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.2■■■■■ 4.03
KLF16-202ENST00000541015 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.2■■■■■ 4.03
KLF16-202ENST00000541015 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.11■■■■■ 4.01
KLF16-202ENST00000541015 ARHGEF11O15085 1522 aa40.1■■■■■ 4.01
KLF16-202ENST00000541015 SOGA1O94964 1423 aa40.09■■■■■ 4.01
KLF16-202ENST00000541015 CHD1O14646 1710 aa40.08■■■■■ 4.01
KLF16-202ENST00000541015 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.04■■■■■ 4
KLF16-202ENST00000541015 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.99■■■■□ 3.99
KLF16-202ENST00000541015 WDR97A6NE52 1622 aa39.99■■■■□ 3.99
KLF16-202ENST00000541015 CUX1P39880 1505 aa39.99■■■■□ 3.99
KLF16-202ENST00000541015 FBLN2P98095 1184 aa39.95■■■■□ 3.99
KLF16-202ENST00000541015 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.84■■■■□ 3.97
KLF16-202ENST00000541015 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.84■■■■□ 3.97
KLF16-202ENST00000541015 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.78■■■■□ 3.96
KLF16-202ENST00000541015 GRIN2BQ13224 1484 aa39.76■■■■□ 3.96
KLF16-202ENST00000541015 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.76■■■■□ 3.96
KLF16-202ENST00000541015 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.7■■■■□ 3.95
KLF16-202ENST00000541015 ARAP1Q96P48 1450 aa39.69■■■■□ 3.94
KLF16-202ENST00000541015 SYNJ1O43426 1573 aa39.65■■■■□ 3.94
KLF16-202ENST00000541015 SYNJ2O15056 1496 aa39.64■■■■□ 3.94
KLF16-202ENST00000541015 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.64■■■■□ 3.94
KLF16-202ENST00000541015 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.62■■■■□ 3.93
KLF16-202ENST00000541015 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.6■■■■□ 3.93
KLF16-202ENST00000541015 PBRM1Q86U86 1689 aa39.6■■■■□ 3.93
KLF16-202ENST00000541015 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.54■■■■□ 3.92
KLF16-202ENST00000541015 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.45■■■■□ 3.911e-7■■■■■ 66.8
KLF16-202ENST00000541015 TOP2BQ02880 1626 aa39.39■■■■□ 3.9
KLF16-202ENST00000541015 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.39■■■■□ 3.9
KLF16-202ENST00000541015 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.32■■■■□ 3.89
KLF16-202ENST00000541015 GRIN2AQ12879 1464 aa39.25■■■■□ 3.87
KLF16-202ENST00000541015 ADAMTS12P58397 1594 aa39.23■■■■□ 3.87
KLF16-202ENST00000541015 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.13■■■■□ 3.85
KLF16-202ENST00000541015 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.12■■■■□ 3.85
KLF16-202ENST00000541015 NUP160Q12769 1436 aa39.12■■■■□ 3.85
KLF16-202ENST00000541015 CEP170Q5SW79 1584 aa39.09■■■■□ 3.85
KLF16-202ENST00000541015 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.98■■■■□ 3.83
KLF16-202ENST00000541015 SHROOM2Q13796 1616 aa38.94■■■■□ 3.82
KLF16-202ENST00000541015 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.72■■■■□ 3.79
KLF16-202ENST00000541015 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.68■■■■□ 3.78
KLF16-202ENST00000541015 JPH4Q96JJ6 628 aa38.68■■■■□ 3.78
KLF16-202ENST00000541015 KIF27Q86VH2 1401 aa38.63■■■■□ 3.77
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