Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 STAU1-210ENST00000614381 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.043e-7■■■■□ 20
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PCBP2Q15366 ERF-205ENST00000595941 227 ntTSL 48.01□□□□□ -1.132e-7■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 EIF4A1-235ENST00000584860 1109 ntTSL 312.96□□□□□ -0.333e-9■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.314e-7■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.34e-7■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 PFDN6-207ENST00000491382 989 ntTSL 215.13■□□□□ 0.014e-7■■■■□ 19.9
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PCBP2Q15366 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.074e-7■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.334e-7■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 PFDN6-205ENST00000395134 805 ntTSL 210.26□□□□□ -0.774e-7■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.199e-8■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.269e-8■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 SLC5A9-204ENST00000441260 1046 ntTSL 215.06■□□□□ 02e-12■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.23e-9■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.253e-9■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 ZFP91-CNTF-202ENST00000422974 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.26□□□□□ -0.619e-8■■■■□ 19.9
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PCBP2Q15366 RTN2-210ENST00000591286 2111 ntTSL 1 (best)25.78■■□□□ 1.724e-15■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.544e-15■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 RTN2-204ENST00000587597 2212 ntTSL 524.17■■□□□ 1.464e-15■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.464e-15■■■■□ 19.9
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PCBP2Q15366 MRPL48-201ENST00000310614 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.424e-15■■■■□ 19.9
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PCBP2Q15366 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.64e-15■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 ADIPOR2-201ENST00000357103 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.619e-24■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 RTN2-203ENST00000430715 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.614e-15■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 MRPL48-206ENST00000508278 1560 ntTSL 210.84□□□□□ -0.674e-15■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 MRPL48-209ENST00000540162 1004 ntTSL 510.62□□□□□ -0.714e-15■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 RTN2-205ENST00000588036 546 ntTSL 49.92□□□□□ -0.824e-15■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 MRPL48-202ENST00000314282 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.874e-15■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 MRPL48-204ENST00000411840 1197 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.084e-15■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 RTN2-214ENST00000593187 299 ntTSL 28.28□□□□□ -1.084e-15■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 ADIPOR2-204ENST00000537545 484 ntTSL 37.67□□□□□ -1.189e-24■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 MRPL48-211ENST00000543058 699 ntTSL 34.53□□□□□ -1.684e-15■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.157e-26■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 CALU-201ENST00000249364 3357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.527e-26■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 CALU-206ENST00000542996 4225 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.757e-26■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 CALU-204ENST00000493278 589 ntTSL 35□□□□□ -1.617e-26■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 TVP23C-CDRT4-204ENST00000557349 1005 ntTSL 215.85■□□□□ 0.131e-6■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.431e-6■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 TVP23C-CDRT4-201ENST00000481756 556 ntTSL 46.25□□□□□ -1.411e-6■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 TVP23C-CDRT4-202ENST00000518506 520 ntTSL 52.56□□□□□ -21e-6■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.231e-6■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.021e-6■■■■□ 19.9
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PCBP2Q15366 HIPK2-203ENST00000428878 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.696e-8■■■■□ 19.9
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PCBP2Q15366 ACSL3-204ENST00000413316 650 ntTSL 49.98□□□□□ -0.812e-7■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 SCAF8-204ENST00000461219 677 ntTSL 519.33■□□□□ 0.689e-10■■■■□ 19.9
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PCBP2Q15366 SCAF8-205ENST00000464628 468 ntTSL 510.81□□□□□ -0.689e-10■■■■□ 19.9
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PCBP2Q15366 TSC2-211ENST00000467949 590 ntTSL 412.63□□□□□ -0.395e-7■■■■□ 19.9
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PCBP2Q15366 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.422e-9■■■■□ 19.9
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PCBP2Q15366 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.532e-9■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 CCDC92-205ENST00000542348 554 ntTSL 49.67□□□□□ -0.862e-9■■■■□ 19.9
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PCBP2Q15366 PTBP1-208ENST00000585956 767 ntTSL 317.78■□□□□ 0.443e-19■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 PTBP1-205ENST00000585535 314 ntTSL 310.72□□□□□ -0.693e-19■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 SMAD3-211ENST00000559460 568 ntTSL 49.25□□□□□ -0.933e-6■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 PLD2-214ENST00000576864 726 ntTSL 314.44□□□□□ -0.13e-7■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.23e-7■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 PLD2-205ENST00000572940 3391 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.843e-7■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.511e-9■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 SETD5-209ENST00000431285 1824 ntTSL 523.54■■□□□ 1.363e-9■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 SETD5-214ENST00000463180 685 ntTSL 218.3■□□□□ 0.523e-9■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 SETD5-212ENST00000450326 921 ntTSL 314.54□□□□□ -0.083e-9■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 SETD5-207ENST00000415650 579 ntTSL 413.52□□□□□ -0.253e-9■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 SETD5-221ENST00000478475 477 ntTSL 47.08□□□□□ -1.283e-9■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 SDCBP2-AS1-205ENST00000609745 855 ntTSL 413.55□□□□□ -0.241e-6■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.259e-8■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.239e-8■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.119e-8■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 MYH14-207ENST00000597072 2225 nt15.5■□□□□ 0.079e-8■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.39e-8■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 MYH14-205ENST00000595016 4039 ntTSL 211.81□□□□□ -0.529e-8■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 FAM222B-209ENST00000581407 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.564e-7■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 USP24-207ENST00000634589 370 ntTSL 511.83□□□□□ -0.522e-6■■■■□ 19.9
PCBP2Q15366 TMEM198-203ENST00000421791 1057 ntTSL 220■□□□□ 0.794e-8■■■■□ 19.8
PCBP2Q15366 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.584e-8■■■■□ 19.8
PCBP2Q15366 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.414e-8■■■■□ 19.8
PCBP2Q15366 TMEM198-204ENST00000451952 505 ntTSL 517.24■□□□□ 0.354e-8■■■■□ 19.8
PCBP2Q15366 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.174e-11■■■■□ 19.8
PCBP2Q15366 SLC9B2-201ENST00000362026 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.114e-11■■■■□ 19.8
PCBP2Q15366 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.552e-6■■■■□ 19.8
PCBP2Q15366 MTSS1-206ENST00000519168 1822 ntTSL 216.96■□□□□ 0.32e-6■■■■□ 19.8
PCBP2Q15366 MTSS1-215ENST00000523587 1643 ntTSL 1 (best)14.67□□□□□ -0.062e-6■■■■□ 19.8
PCBP2Q15366 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.172e-6■■■■□ 19.8
PCBP2Q15366 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.284e-7■■■■□ 19.8
PCBP2Q15366 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.124e-7■■■■□ 19.8
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