RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523587.5

MTSS1-215, Transcript of MTSS1, I-BAR domain containing, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MTSS1, Length 1,643 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1-215ENST00000523587 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.67■■■■□ 3.3
MTSS1-215ENST00000523587 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.65■■■□□ 2.66
MTSS1-215ENST00000523587 ABCC9O60706 1549 aa30.89■■■□□ 2.54
MTSS1-215ENST00000523587 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.78■■■□□ 2.36
MTSS1-215ENST00000523587 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
MTSS1-215ENST00000523587 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.69■■■□□ 2.34
MTSS1-215ENST00000523587 NACADO15069 1562 aa29.65■■■□□ 2.34
MTSS1-215ENST00000523587 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.43■■■□□ 2.3
MTSS1-215ENST00000523587 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.41■■■□□ 2.3
MTSS1-215ENST00000523587 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.18■■■□□ 2.26
MTSS1-215ENST00000523587 SCRIBQ14160 1630 aa29.05■■■□□ 2.24
MTSS1-215ENST00000523587 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.87■■■□□ 2.214e-8■□□□□ 9.7
MTSS1-215ENST00000523587 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.85■■■□□ 2.21
MTSS1-215ENST00000523587 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.47■■■□□ 2.15
MTSS1-215ENST00000523587 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.12■■■□□ 2.09
MTSS1-215ENST00000523587 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
MTSS1-215ENST00000523587 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.93■■■□□ 2.06
MTSS1-215ENST00000523587 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.83■■■□□ 2.05
MTSS1-215ENST00000523587 SMARCA4P51532 1647 aa27.71■■■□□ 2.03
MTSS1-215ENST00000523587 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
MTSS1-215ENST00000523587 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.56■■■□□ 2
MTSS1-215ENST00000523587 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.43■■□□□ 1.98
MTSS1-215ENST00000523587 SMARCA2P51531 1590 aa27.4■■□□□ 1.98
MTSS1-215ENST00000523587 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.33■■□□□ 1.97
MTSS1-215ENST00000523587 WIZO95785 1651 aa27.33■■□□□ 1.97
MTSS1-215ENST00000523587 NCAPD3P42695 1498 aa27.31■■□□□ 1.96
MTSS1-215ENST00000523587 HMGXB3Q12766 1538 aa27.28■■□□□ 1.96
MTSS1-215ENST00000523587 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.96
MTSS1-215ENST00000523587 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
MTSS1-215ENST00000523587 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
MTSS1-215ENST00000523587 NESP48681 1621 aa26.8■■□□□ 1.88
MTSS1-215ENST00000523587 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
MTSS1-215ENST00000523587 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.64■■□□□ 1.85
MTSS1-215ENST00000523587 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.63■■□□□ 1.85
MTSS1-215ENST00000523587 ERCC6Q03468 1493 aa26.58■■□□□ 1.85
MTSS1-215ENST00000523587 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.56■■□□□ 1.84
MTSS1-215ENST00000523587 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.54■■□□□ 1.84
MTSS1-215ENST00000523587 CFTRP13569 1480 aa26.46■■□□□ 1.83
MTSS1-215ENST00000523587 PRDM2Q13029 1718 aa26.42■■□□□ 1.82
MTSS1-215ENST00000523587 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.4■■□□□ 1.82
MTSS1-215ENST00000523587 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
MTSS1-215ENST00000523587 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.34■■□□□ 1.81
MTSS1-215ENST00000523587 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.29■■□□□ 1.8
MTSS1-215ENST00000523587 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.21■■□□□ 1.79
MTSS1-215ENST00000523587 CUX2O14529 1486 aa26.13■■□□□ 1.77
MTSS1-215ENST00000523587 WDR62O43379 1518 aa26.12■■□□□ 1.77
MTSS1-215ENST00000523587 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
MTSS1-215ENST00000523587 TOPBP1Q92547 1522 aa25.94■■□□□ 1.74
MTSS1-215ENST00000523587 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.93■■□□□ 1.74
MTSS1-215ENST00000523587 CUX1P39880 1505 aa25.85■■□□□ 1.73
MTSS1-215ENST00000523587 ABCC8Q09428 1581 aa25.85■■□□□ 1.73
MTSS1-215ENST00000523587 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
MTSS1-215ENST00000523587 SYNJ1O43426 1573 aa25.73■■□□□ 1.71
MTSS1-215ENST00000523587 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.73■■□□□ 1.71
MTSS1-215ENST00000523587 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.69■■□□□ 1.7
MTSS1-215ENST00000523587 IFT140Q96RY7 1462 aa25.67■■□□□ 1.7
MTSS1-215ENST00000523587 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.67■■□□□ 1.7
MTSS1-215ENST00000523587 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
MTSS1-215ENST00000523587 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.66■■□□□ 1.7
MTSS1-215ENST00000523587 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
MTSS1-215ENST00000523587 TOP2BQ02880 1626 aa25.64■■□□□ 1.7
MTSS1-215ENST00000523587 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
MTSS1-215ENST00000523587 SOGA1O94964 1423 aa25.58■■□□□ 1.69
MTSS1-215ENST00000523587 WDR97A6NE52 1622 aa25.55■■□□□ 1.68
MTSS1-215ENST00000523587 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.49■■□□□ 1.672e-6■■■■□ 22.7
MTSS1-215ENST00000523587 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.48■■□□□ 1.67
MTSS1-215ENST00000523587 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
MTSS1-215ENST00000523587 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.41■■□□□ 1.66
MTSS1-215ENST00000523587 PBRM1Q86U86 1689 aa25.38■■□□□ 1.65
MTSS1-215ENST00000523587 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.38■■□□□ 1.65
MTSS1-215ENST00000523587 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.31■■□□□ 1.64
MTSS1-215ENST00000523587 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.3■■□□□ 1.64
MTSS1-215ENST00000523587 CHD1O14646 1710 aa25.28■■□□□ 1.64
MTSS1-215ENST00000523587 TRIM41Q8WV44 630 aa25.26■■□□□ 1.63
MTSS1-215ENST00000523587 GRIN2BQ13224 1484 aa25.26■■□□□ 1.63
MTSS1-215ENST00000523587 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
MTSS1-215ENST00000523587 FBLN2P98095 1184 aa25.16■■□□□ 1.62
MTSS1-215ENST00000523587 ADAMTS12P58397 1594 aa25.15■■□□□ 1.62
MTSS1-215ENST00000523587 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.1■■□□□ 1.61
MTSS1-215ENST00000523587 KIF27Q86VH2 1401 aa25.1■■□□□ 1.61
MTSS1-215ENST00000523587 SYNJ2O15056 1496 aa25.09■■□□□ 1.61
MTSS1-215ENST00000523587 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.07■■□□□ 1.6
MTSS1-215ENST00000523587 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.06■■□□□ 1.6
MTSS1-215ENST00000523587 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
MTSS1-215ENST00000523587 OSCARQ8IYS5 282 aa25.02■■□□□ 1.6
MTSS1-215ENST00000523587 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.99■■□□□ 1.59
MTSS1-215ENST00000523587 GRIN2AQ12879 1464 aa24.98■■□□□ 1.59
MTSS1-215ENST00000523587 CUL7Q14999 1698 aa24.97■■□□□ 1.59
MTSS1-215ENST00000523587 IGF1RP08069 1367 aa24.96■■□□□ 1.59
MTSS1-215ENST00000523587 CEP170Q5SW79 1584 aa24.92■■□□□ 1.58
MTSS1-215ENST00000523587 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.9■■□□□ 1.58
MTSS1-215ENST00000523587 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.82■■□□□ 1.56
MTSS1-215ENST00000523587 NUP160Q12769 1436 aa24.82■■□□□ 1.56
MTSS1-215ENST00000523587 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.8■■□□□ 1.56
MTSS1-215ENST00000523587 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.8■■□□□ 1.56
MTSS1-215ENST00000523587 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.8■■□□□ 1.56
MTSS1-215ENST00000523587 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
MTSS1-215ENST00000523587 ARHGEF11O15085 1522 aa24.77■■□□□ 1.56
MTSS1-215ENST00000523587 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.72■■□□□ 1.55
MTSS1-215ENST00000523587 EEA1Q15075 1411 aa24.7■■□□□ 1.55
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