RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524090.5

MTSS1-216, Transcript of MTSS1, I-BAR domain containing, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MTSS1, Length 2,166 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1-216ENST00000524090 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.33■■■□□ 2.61
MTSS1-216ENST00000524090 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.21■■□□□ 1.95
MTSS1-216ENST00000524090 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
MTSS1-216ENST00000524090 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.91■■□□□ 1.74
MTSS1-216ENST00000524090 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.78■■□□□ 1.72
MTSS1-216ENST00000524090 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.73■■□□□ 1.71
MTSS1-216ENST00000524090 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.48■■□□□ 1.67
MTSS1-216ENST00000524090 ABCC9O60706 1549 aa25.36■■□□□ 1.65
MTSS1-216ENST00000524090 NACADO15069 1562 aa25.23■■□□□ 1.63
MTSS1-216ENST00000524090 SCRIBQ14160 1630 aa25.06■■□□□ 1.6
MTSS1-216ENST00000524090 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
MTSS1-216ENST00000524090 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.94■■□□□ 1.58
MTSS1-216ENST00000524090 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.53■■□□□ 1.52
MTSS1-216ENST00000524090 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
MTSS1-216ENST00000524090 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.3■■□□□ 1.48
MTSS1-216ENST00000524090 MROH2BQ7Z745 1585 aa24.22■■□□□ 1.47
MTSS1-216ENST00000524090 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
MTSS1-216ENST00000524090 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.17■■□□□ 1.46
MTSS1-216ENST00000524090 WIZO95785 1651 aa24.07■■□□□ 1.44
MTSS1-216ENST00000524090 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.07■■□□□ 1.44
MTSS1-216ENST00000524090 SMARCA4P51532 1647 aa24.04■■□□□ 1.44
MTSS1-216ENST00000524090 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.96■■□□□ 1.434e-8■□□□□ 9.7
MTSS1-216ENST00000524090 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
MTSS1-216ENST00000524090 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.73■■□□□ 1.39
MTSS1-216ENST00000524090 SMARCA2P51531 1590 aa23.6■■□□□ 1.37
MTSS1-216ENST00000524090 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
MTSS1-216ENST00000524090 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.55■■□□□ 1.36
MTSS1-216ENST00000524090 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.52■■□□□ 1.36
MTSS1-216ENST00000524090 TRIM41Q8WV44 630 aa23.45■■□□□ 1.35
MTSS1-216ENST00000524090 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
MTSS1-216ENST00000524090 HMGXB3Q12766 1538 aa23.29■■□□□ 1.32
MTSS1-216ENST00000524090 NCAPD3P42695 1498 aa23.25■■□□□ 1.31
MTSS1-216ENST00000524090 ABCC8Q09428 1581 aa23.2■■□□□ 1.3
MTSS1-216ENST00000524090 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa23.16■■□□□ 1.3
MTSS1-216ENST00000524090 HRCP23327 699 aa23.07■■□□□ 1.28
MTSS1-216ENST00000524090 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
MTSS1-216ENST00000524090 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23■■□□□ 1.27
MTSS1-216ENST00000524090 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
MTSS1-216ENST00000524090 SYNJ1O43426 1573 aa22.91■■□□□ 1.26
MTSS1-216ENST00000524090 PRDM2Q13029 1718 aa22.87■■□□□ 1.25
MTSS1-216ENST00000524090 EEA1Q15075 1411 aa22.85■■□□□ 1.25
MTSS1-216ENST00000524090 CFTRP13569 1480 aa22.84■■□□□ 1.25
MTSS1-216ENST00000524090 SOGA1O94964 1423 aa22.8■■□□□ 1.24
MTSS1-216ENST00000524090 TOP2BQ02880 1626 aa22.8■■□□□ 1.24
MTSS1-216ENST00000524090 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.78■■□□□ 1.24
MTSS1-216ENST00000524090 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.76■■□□□ 1.23
MTSS1-216ENST00000524090 EHMT2Q96KQ7 1210 aa22.69■■□□□ 1.22
MTSS1-216ENST00000524090 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.69■■□□□ 1.22
MTSS1-216ENST00000524090 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.68■■□□□ 1.22
MTSS1-216ENST00000524090 CSRNP3Q8WYN3 585 aa22.65■■□□□ 1.22
MTSS1-216ENST00000524090 CUX1P39880 1505 aa22.62■■□□□ 1.21
MTSS1-216ENST00000524090 KIF21BO75037 1637 aa22.57■■□□□ 1.2
MTSS1-216ENST00000524090 GOLGA3Q08378 1498 aa22.56■■□□□ 1.2
MTSS1-216ENST00000524090 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.53■■□□□ 1.2
MTSS1-216ENST00000524090 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.53■■□□□ 1.2
MTSS1-216ENST00000524090 CEP162Q5TB80 1403 aa22.45■■□□□ 1.19
MTSS1-216ENST00000524090 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
MTSS1-216ENST00000524090 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.45■■□□□ 1.18
MTSS1-216ENST00000524090 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.45■■□□□ 1.18
MTSS1-216ENST00000524090 UBTFP17480 764 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
MTSS1-216ENST00000524090 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
MTSS1-216ENST00000524090 NESP48681 1621 aa22.38■■□□□ 1.17
MTSS1-216ENST00000524090 KIF27Q86VH2 1401 aa22.38■■□□□ 1.17
MTSS1-216ENST00000524090 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.34■■□□□ 1.17
MTSS1-216ENST00000524090 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.34■■□□□ 1.17
MTSS1-216ENST00000524090 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.33■■□□□ 1.17
MTSS1-216ENST00000524090 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.33■■□□□ 1.16
MTSS1-216ENST00000524090 PRXQ9BXM0 1461 aa22.31■■□□□ 1.16
MTSS1-216ENST00000524090 TOPBP1Q92547 1522 aa22.25■■□□□ 1.15
MTSS1-216ENST00000524090 CUX2O14529 1486 aa22.24■■□□□ 1.15
MTSS1-216ENST00000524090 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.23■■□□□ 1.15
MTSS1-216ENST00000524090 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.22■■□□□ 1.15
MTSS1-216ENST00000524090 CLIP1P30622 1438 aa22.19■■□□□ 1.14
MTSS1-216ENST00000524090 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.18■■□□□ 1.14
MTSS1-216ENST00000524090 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
MTSS1-216ENST00000524090 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
MTSS1-216ENST00000524090 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.14■■□□□ 1.13
MTSS1-216ENST00000524090 IGF1RP08069 1367 aa22.11■■□□□ 1.13
MTSS1-216ENST00000524090 WDR97A6NE52 1622 aa22.09■■□□□ 1.13
MTSS1-216ENST00000524090 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.08■■□□□ 1.12
MTSS1-216ENST00000524090 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.06■■□□□ 1.12
MTSS1-216ENST00000524090 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.03■■□□□ 1.12
MTSS1-216ENST00000524090 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
MTSS1-216ENST00000524090 CUL7Q14999 1698 aa22■■□□□ 1.11
MTSS1-216ENST00000524090 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.96■■□□□ 1.11
MTSS1-216ENST00000524090 ARAP1Q96P48 1450 aa21.94■■□□□ 1.1
MTSS1-216ENST00000524090 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
MTSS1-216ENST00000524090 MRC2Q9UBG0 1479 aa21.93■■□□□ 1.1
MTSS1-216ENST00000524090 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
MTSS1-216ENST00000524090 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.87■■□□□ 1.09
MTSS1-216ENST00000524090 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.87■■□□□ 1.09
MTSS1-216ENST00000524090 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa21.84■■□□□ 1.09
MTSS1-216ENST00000524090 APLP2Q06481 763 aa21.84■■□□□ 1.09
MTSS1-216ENST00000524090 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
MTSS1-216ENST00000524090 WDR62O43379 1518 aa21.82■■□□□ 1.08
MTSS1-216ENST00000524090 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
MTSS1-216ENST00000524090 PBRM1Q86U86 1689 aa21.79■■□□□ 1.08
MTSS1-216ENST00000524090 ERCC6Q03468 1493 aa21.73■■□□□ 1.07
MTSS1-216ENST00000524090 IFT140Q96RY7 1462 aa21.72■■□□□ 1.07
MTSS1-216ENST00000524090 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.72■■□□□ 1.07
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