Protein–RNA interactions for Protein: Q15061

WDR43, WD repeat-containing protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR43Q15061 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.819e-6■■■□□ 15.6
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WDR43Q15061 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.923e-9■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.923e-9■■■□□ 15.6
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WDR43Q15061 ARID4B-209ENST00000471257 4195 ntTSL 58.66□□□□□ -1.029e-6■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.093e-9■■■□□ 15.6
WDR43Q15061 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.093e-9■■■□□ 15.6
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WDR43Q15061 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.924e-9■■■□□ 15.5
WDR43Q15061 SLC6A8-209ENST00000476466 470 ntTSL 318.61■□□□□ 0.575e-10■■■□□ 15.5
WDR43Q15061 AC004980.1-202ENST00000450661 962 ntTSL 1 (best)31.35■■■□□ 2.612e-7■■■□□ 15.4
WDR43Q15061 AC004980.1-203ENST00000423084 748 ntTSL 329.81■■■□□ 2.362e-7■■■□□ 15.4
WDR43Q15061 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.212e-7■■■□□ 15.4
WDR43Q15061 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.111e-7■■■□□ 15.4
WDR43Q15061 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.661e-7■■■□□ 15.4
WDR43Q15061 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.461e-7■■■□□ 15.4
WDR43Q15061 CLIC1-207ENST00000375780 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.131e-7■■■□□ 15.4
WDR43Q15061 CLIC1-210ENST00000616760 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.371e-7■■■□□ 15.4
WDR43Q15061 HFM1-204ENST00000448819 540 ntTSL 512.17□□□□□ -0.461e-9■■■□□ 15.4
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