RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423084.1

AC004980.1-203, humanhuman

TSL 3

Gene AC004980.1, Length 748 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004980.1-203ENST00000423084 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.15■■■■■ 6.74
AC004980.1-203ENST00000423084 ABCC9O60706 1549 aa51.25■■■■■ 5.79
AC004980.1-203ENST00000423084 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.24■■■■■ 5.79
AC004980.1-203ENST00000423084 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.77■■■■■ 5.4
AC004980.1-203ENST00000423084 NACADO15069 1562 aa48.43■■■■■ 5.34
AC004980.1-203ENST00000423084 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.29■■■■■ 5.32
AC004980.1-203ENST00000423084 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.1■■■■■ 5.29
AC004980.1-203ENST00000423084 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.76■■■■■ 5.24
AC004980.1-203ENST00000423084 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.75■■■■■ 5.23
AC004980.1-203ENST00000423084 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.74■■■■■ 5.23
AC004980.1-203ENST00000423084 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.38■■■■■ 5.18
AC004980.1-203ENST00000423084 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.34■■■■■ 5.17
AC004980.1-203ENST00000423084 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.17■■■■■ 5.14
AC004980.1-203ENST00000423084 SCRIBQ14160 1630 aa46.72■■■■■ 5.07
AC004980.1-203ENST00000423084 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.64■■■■■ 5.06
AC004980.1-203ENST00000423084 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.3■■■■■ 5
AC004980.1-203ENST00000423084 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.2■■■■■ 4.99
AC004980.1-203ENST00000423084 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.14■■■■■ 4.98
AC004980.1-203ENST00000423084 NCAPD3P42695 1498 aa44.72■■■■■ 4.75
AC004980.1-203ENST00000423084 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.6■■■■■ 4.73
AC004980.1-203ENST00000423084 SMARCA4P51532 1647 aa44.57■■■■■ 4.72
AC004980.1-203ENST00000423084 SMARCA2P51531 1590 aa44.45■■■■■ 4.71
AC004980.1-203ENST00000423084 HMGXB3Q12766 1538 aa44.37■■■■■ 4.69
AC004980.1-203ENST00000423084 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.33■■■■■ 4.69
AC004980.1-203ENST00000423084 ERCC6Q03468 1493 aa44.22■■■■■ 4.67
AC004980.1-203ENST00000423084 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.16■■■■■ 4.66
AC004980.1-203ENST00000423084 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.12■■■■■ 4.65
AC004980.1-203ENST00000423084 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.11■■■■■ 4.65
AC004980.1-203ENST00000423084 CUX2O14529 1486 aa44.1■■■■■ 4.65
AC004980.1-203ENST00000423084 NESP48681 1621 aa44.06■■■■■ 4.64
AC004980.1-203ENST00000423084 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.05■■■■■ 4.64
AC004980.1-203ENST00000423084 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.71■■■■■ 4.59
AC004980.1-203ENST00000423084 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.56■■■■■ 4.56
AC004980.1-203ENST00000423084 WIZO95785 1651 aa43.55■■■■■ 4.56
AC004980.1-203ENST00000423084 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.49■■■■■ 4.55
AC004980.1-203ENST00000423084 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.45■■■■■ 4.55
AC004980.1-203ENST00000423084 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.38■■■■■ 4.53
AC004980.1-203ENST00000423084 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.14■■■■■ 4.5
AC004980.1-203ENST00000423084 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.07■■■■■ 4.49
AC004980.1-203ENST00000423084 WDR62O43379 1518 aa42.97■■■■■ 4.47
AC004980.1-203ENST00000423084 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.94■■■■■ 4.46
AC004980.1-203ENST00000423084 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.91■■■■■ 4.46
AC004980.1-203ENST00000423084 CFTRP13569 1480 aa42.88■■■■■ 4.46
AC004980.1-203ENST00000423084 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.88■■■■■ 4.46
AC004980.1-203ENST00000423084 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.54■■■■■ 4.4
AC004980.1-203ENST00000423084 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.49■■■■■ 4.39
AC004980.1-203ENST00000423084 PRDM2Q13029 1718 aa42.48■■■■■ 4.39
AC004980.1-203ENST00000423084 TRIM41Q8WV44 630 aa42.21■■■■■ 4.35
AC004980.1-203ENST00000423084 OSCARQ8IYS5 282 aa42.15■■■■■ 4.34
AC004980.1-203ENST00000423084 TOPBP1Q92547 1522 aa42.08■■■■■ 4.33
AC004980.1-203ENST00000423084 IFT140Q96RY7 1462 aa42.04■■■■■ 4.32
AC004980.1-203ENST00000423084 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.02■■■■■ 4.32
AC004980.1-203ENST00000423084 ABCC8Q09428 1581 aa41.97■■■■■ 4.31
AC004980.1-203ENST00000423084 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.91■■■■■ 4.3
AC004980.1-203ENST00000423084 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.28
AC004980.1-203ENST00000423084 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.72■■■■■ 4.27
AC004980.1-203ENST00000423084 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.66■■■■■ 4.265e-7■■■■□ 19.7
AC004980.1-203ENST00000423084 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.65■■■■■ 4.26
AC004980.1-203ENST00000423084 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.59■■■■■ 4.25
AC004980.1-203ENST00000423084 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.59■■■■■ 4.25
AC004980.1-203ENST00000423084 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.59■■■■■ 4.25
AC004980.1-203ENST00000423084 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.53■■■■■ 4.24
AC004980.1-203ENST00000423084 CHD1O14646 1710 aa41.49■■■■■ 4.23
AC004980.1-203ENST00000423084 SOGA1O94964 1423 aa41.47■■■■■ 4.23
AC004980.1-203ENST00000423084 ARHGEF11O15085 1522 aa41.46■■■■■ 4.23
AC004980.1-203ENST00000423084 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.4■■■■■ 4.22
AC004980.1-203ENST00000423084 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.4■■■■■ 4.22
AC004980.1-203ENST00000423084 FBLN2P98095 1184 aa41.39■■■■■ 4.22
AC004980.1-203ENST00000423084 CUX1P39880 1505 aa41.37■■■■■ 4.21
AC004980.1-203ENST00000423084 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.31■■■■■ 4.2
AC004980.1-203ENST00000423084 WDR97A6NE52 1622 aa41.23■■■■■ 4.19
AC004980.1-203ENST00000423084 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.2■■■■■ 4.19
AC004980.1-203ENST00000423084 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.2■■■■■ 4.19
AC004980.1-203ENST00000423084 GRIN2BQ13224 1484 aa41.09■■■■■ 4.17
AC004980.1-203ENST00000423084 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.17
AC004980.1-203ENST00000423084 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.16
AC004980.1-203ENST00000423084 ARAP1Q96P48 1450 aa41.05■■■■■ 4.16
AC004980.1-203ENST00000423084 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.97■■■■■ 4.15
AC004980.1-203ENST00000423084 PBRM1Q86U86 1689 aa40.96■■■■■ 4.15
AC004980.1-203ENST00000423084 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.96■■■■■ 4.15
AC004980.1-203ENST00000423084 SYNJ2O15056 1496 aa40.95■■■■■ 4.15
AC004980.1-203ENST00000423084 SYNJ1O43426 1573 aa40.94■■■■■ 4.14
AC004980.1-203ENST00000423084 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.91■■■■■ 4.14
AC004980.1-203ENST00000423084 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.85■■■■■ 4.13
AC004980.1-203ENST00000423084 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.76■■■■■ 4.11
AC004980.1-203ENST00000423084 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.72■■■■■ 4.11
AC004980.1-203ENST00000423084 TOP2BQ02880 1626 aa40.71■■■■■ 4.11
AC004980.1-203ENST00000423084 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.71■■■■■ 4.11
AC004980.1-203ENST00000423084 GRIN2AQ12879 1464 aa40.57■■■■■ 4.08
AC004980.1-203ENST00000423084 ADAMTS12P58397 1594 aa40.53■■■■■ 4.08
AC004980.1-203ENST00000423084 CEP170Q5SW79 1584 aa40.44■■■■■ 4.06
AC004980.1-203ENST00000423084 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.42■■■■■ 4.06
AC004980.1-203ENST00000423084 NUP160Q12769 1436 aa40.42■■■■■ 4.06
AC004980.1-203ENST00000423084 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.39■■■■■ 4.06
AC004980.1-203ENST00000423084 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.38■■■■■ 4.05
AC004980.1-203ENST00000423084 SHROOM2Q13796 1616 aa40.25■■■■■ 4.03
AC004980.1-203ENST00000423084 JPH4Q96JJ6 628 aa40.05■■■■■ 4
AC004980.1-203ENST00000423084 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.05■■■■■ 4
AC004980.1-203ENST00000423084 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.97■■■■□ 3.99
AC004980.1-203ENST00000423084 IGF1RP08069 1367 aa39.93■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms