Protein–RNA interactions for Protein: P26196

DDX6, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX6P26196 PRMT5-205ENST00000421938 565 ntTSL 323.94■■□□□ 1.423e-10■■■■■ 43.3
DDX6P26196 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.33e-10■■■■■ 43.3
DDX6P26196 PRMT5-210ENST00000553550 580 ntTSL 323.16■■□□□ 1.33e-10■■■■■ 43.3
DDX6P26196 PRMT5-215ENST00000554716 561 ntTSL 422.62■■□□□ 1.213e-10■■■■■ 43.3
DDX6P26196 CS-226ENST00000551430 751 ntTSL 322.19■■□□□ 1.145e-8■■■■■ 43.3
DDX6P26196 PRMT5-222ENST00000556426 563 ntTSL 321.52■■□□□ 1.043e-10■■■■■ 43.3
DDX6P26196 PRMT5-224ENST00000557015 628 ntTSL 220.85■□□□□ 0.933e-10■■■■■ 43.3
DDX6P26196 PRMT5-216ENST00000554867 555 ntTSL 220.44■□□□□ 0.863e-10■■■■■ 43.3
DDX6P26196 PRMT5-212ENST00000553787 579 ntTSL 420.38■□□□□ 0.853e-10■■■■■ 43.3
DDX6P26196 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.853e-10■■■■■ 43.3
DDX6P26196 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.793e-10■■■■■ 43.3
DDX6P26196 CENPA-204ENST00000460030 745 ntTSL 1 (best)19.81■□□□□ 0.763e-10■■■■■ 43.3
DDX6P26196 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.713e-10■■■■■ 43.3
DDX6P26196 CS-219ENST00000550655 589 ntTSL 218.88■□□□□ 0.615e-8■■■■■ 43.3
DDX6P26196 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.593e-10■■■■■ 43.3
DDX6P26196 CS-214ENST00000548849 1028 ntTSL 318.32■□□□□ 0.525e-8■■■■■ 43.3
DDX6P26196 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.493e-10■■■■■ 43.3
DDX6P26196 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.473e-10■■■■■ 43.3
DDX6P26196 CENPA-203ENST00000419525 950 ntTSL 517.85■□□□□ 0.453e-10■■■■■ 43.3
DDX6P26196 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.413e-10■■■■■ 43.3
DDX6P26196 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.253e-10■■■■■ 43.3
DDX6P26196 CENPA-206ENST00000475662 1208 ntTSL 216.33■□□□□ 0.23e-10■■■■■ 43.3
DDX6P26196 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.23e-10■■■■■ 43.3
DDX6P26196 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.133e-10■■■■■ 43.3
DDX6P26196 CS-229ENST00000551936 744 ntTSL 315.52■□□□□ 0.085e-8■■■■■ 43.3
DDX6P26196 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.053e-10■■■■■ 43.3
DDX6P26196 CS-230ENST00000551968 542 ntTSL 414.8□□□□□ -0.045e-8■■■■■ 43.3
DDX6P26196 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.063e-10■■■■■ 43.3
DDX6P26196 PRMT5-214ENST00000553915 1931 ntTSL 214.62□□□□□ -0.073e-10■■■■■ 43.3
DDX6P26196 CENPA-205ENST00000472719 689 ntTSL 314.31□□□□□ -0.123e-10■■■■■ 43.3
DDX6P26196 PLD3-212ENST00000486134 327 ntTSL 214.23□□□□□ -0.133e-10■■■■■ 43.3
DDX6P26196 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.183e-10■■■■■ 43.3
DDX6P26196 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.283e-10■■■■■ 43.3
DDX6P26196 CS-228ENST00000551473 797 ntTSL 312.97□□□□□ -0.335e-8■■■■■ 43.3
DDX6P26196 CS-221ENST00000550734 747 ntTSL 512.3□□□□□ -0.445e-8■■■■■ 43.3
DDX6P26196 CS-223ENST00000551137 903 ntTSL 312.29□□□□□ -0.445e-8■■■■■ 43.3
DDX6P26196 CS-208ENST00000547298 656 ntTSL 312.25□□□□□ -0.455e-8■■■■■ 43.3
DDX6P26196 PRMT5-211ENST00000553641 800 ntTSL 311.84□□□□□ -0.513e-10■■■■■ 43.3
DDX6P26196 CDC25B-201ENST00000245960 3597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.573e-10■■■■■ 43.3
DDX6P26196 CS-218ENST00000550159 646 ntTSL 510.12□□□□□ -0.795e-8■■■■■ 43.3
DDX6P26196 CS-209ENST00000547449 434 ntTSL 29.93□□□□□ -0.825e-8■■■■■ 43.3
DDX6P26196 CS-202ENST00000542324 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.845e-8■■■■■ 43.3
DDX6P26196 CS-205ENST00000546891 911 ntTSL 29.61□□□□□ -0.875e-8■■■■■ 43.3
DDX6P26196 CS-211ENST00000548041 561 ntTSL 49.09□□□□□ -0.955e-8■■■■■ 43.3
DDX6P26196 CS-206ENST00000546930 568 ntTSL 48.65□□□□□ -1.025e-8■■■■■ 43.3
DDX6P26196 CS-216ENST00000549221 553 ntTSL 48.44□□□□□ -1.065e-8■■■■■ 43.3
DDX6P26196 CS-215ENST00000549143 2811 ntTSL 28.44□□□□□ -1.065e-8■■■■■ 43.3
DDX6P26196 CS-204ENST00000546621 1513 ntTSL 27.73□□□□□ -1.175e-8■■■■■ 43.3
DDX6P26196 CS-212ENST00000548567 3057 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.175e-8■■■■■ 43.3
DDX6P26196 PRMT5-220ENST00000556032 643 ntTSL 57.68□□□□□ -1.183e-10■■■■■ 43.3
DDX6P26196 CS-225ENST00000551253 676 ntTSL 37.59□□□□□ -1.195e-8■■■■■ 43.3
DDX6P26196 PRMT5-223ENST00000556616 571 ntTSL 47.44□□□□□ -1.223e-10■■■■■ 43.3
DDX6P26196 CS-233ENST00000552688 580 ntTSL 47.42□□□□□ -1.225e-8■■■■■ 43.3
DDX6P26196 CS-201ENST00000351328 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.285e-8■■■■■ 43.3
DDX6P26196 CS-210ENST00000547912 674 ntTSL 25.75□□□□□ -1.495e-8■■■■■ 43.3
DDX6P26196 PUM1-201ENST00000257075 5360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.694e-8■■■■■ 43
DDX6P26196 PUM1-204ENST00000373747 5375 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.094e-8■■■■■ 43
DDX6P26196 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.164e-8■■■■■ 43
DDX6P26196 AHNAK-203ENST00000525875 793 ntTSL 311.34□□□□□ -0.591e-10■■■■■ 42.8
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DDX6P26196 NINJ2-204ENST00000537416 323 ntTSL 314.75□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 42.7
DDX6P26196 NINJ2-203ENST00000433832 945 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.762e-6■■■■■ 42.7
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DDX6P26196 NINJ2-202ENST00000397265 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.882e-6■■■■■ 42.7
DDX6P26196 HFM1-204ENST00000448819 540 ntTSL 510.05□□□□□ -0.83e-7■■■■■ 42.7
DDX6P26196 HFM1-202ENST00000427444 672 ntTSL 57.41□□□□□ -1.223e-7■■■■■ 42.7
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DDX6P26196 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.173e-7■■■■■ 42.7
DDX6P26196 MFSD10-203ENST00000503596 1589 ntTSL 521.31■■□□□ 11e-8■■■■■ 42.7
DDX6P26196 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.931e-8■■■■■ 42.7
DDX6P26196 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.861e-8■■■■■ 42.7
DDX6P26196 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.791e-8■■■■■ 42.7
DDX6P26196 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.671e-8■■■■■ 42.7
DDX6P26196 MFSD10-208ENST00000509676 1178 ntTSL 516.21■□□□□ 0.191e-8■■■■■ 42.7
DDX6P26196 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.243e-7■■■■■ 42.6
DDX6P26196 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.13e-7■■■■■ 42.6
DDX6P26196 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.053e-7■■■■■ 42.6
DDX6P26196 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.043e-7■■■■■ 42.6
DDX6P26196 RPP40-205ENST00000479782 500 ntTSL 514.73□□□□□ -0.053e-7■■■■■ 42.6
DDX6P26196 RPP40-204ENST00000468105 632 ntTSL 214.55□□□□□ -0.083e-7■■■■■ 42.6
DDX6P26196 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.431e-6■■■■■ 42.6
DDX6P26196 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.693e-7■■■■■ 42.5
DDX6P26196 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.463e-7■■■■■ 42.5
DDX6P26196 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.973e-7■■■■■ 42.5
DDX6P26196 THOP1-204ENST00000585673 784 ntTSL 325.53■■□□□ 1.683e-7■■■■■ 42.5
DDX6P26196 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.653e-7■■■■■ 42.5
DDX6P26196 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.583e-7■■■■■ 42.5
DDX6P26196 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.453e-7■■■■■ 42.5
DDX6P26196 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.372e-9■■■■■ 42.5
DDX6P26196 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.283e-7■■■■■ 42.5
DDX6P26196 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.263e-7■■■■■ 42.5
DDX6P26196 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.212e-9■■■■■ 42.5
DDX6P26196 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.183e-7■■■■■ 42.5
DDX6P26196 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.132e-9■■■■■ 42.5
DDX6P26196 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.093e-7■■■■■ 42.5
DDX6P26196 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.033e-7■■■■■ 42.5
DDX6P26196 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.913e-7■■■■■ 42.5
DDX6P26196 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.33■□□□□ 0.843e-7■■■■■ 42.5
DDX6P26196 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.823e-7■■■■■ 42.5
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