RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546930.5

CS-206, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-206ENST00000546930 NISCHQ9Y2I1 1504 aa20.27■□□□□ 0.84
CS-206ENST00000546930 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa18.01■□□□□ 0.47
CS-206ENST00000546930 ABCC9O60706 1549 aa17.3■□□□□ 0.36
CS-206ENST00000546930 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
CS-206ENST00000546930 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa16.77■□□□□ 0.28
CS-206ENST00000546930 NACADO15069 1562 aa16.75■□□□□ 0.27
CS-206ENST00000546930 MYO15BQ96JP2 1530 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-206ENST00000546930 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa16.72■□□□□ 0.27
CS-206ENST00000546930 UNC13AQ9UPW8 1703 aa16.67■□□□□ 0.26
CS-206ENST00000546930 DCAF8L2P0C7V8 631 aa16.54■□□□□ 0.24
CS-206ENST00000546930 SCRIBQ14160 1630 aa16.46■□□□□ 0.23
CS-206ENST00000546930 BICRAQ9NZM4 1560 aa16.39■□□□□ 0.21
CS-206ENST00000546930 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa16.1■□□□□ 0.17
CS-206ENST00000546930 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.172e-8■■■□□ 14.8
CS-206ENST00000546930 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.13
CS-206ENST00000546930 CECR2Q9BXF3 1484 aa15.82■□□□□ 0.12
CS-206ENST00000546930 SMARCA4P51532 1647 aa15.76■□□□□ 0.11
CS-206ENST00000546930 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa15.73■□□□□ 0.11
CS-206ENST00000546930 MROH2BQ7Z745 1585 aa15.69■□□□□ 0.1
CS-206ENST00000546930 DNAJC5BQ9UF47 199 aa15.67■□□□□ 0.1
CS-206ENST00000546930 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
CS-206ENST00000546930 WIZO95785 1651 aa15.6■□□□□ 0.09
CS-206ENST00000546930 PEG3Q9GZU2 1588 aa15.58■□□□□ 0.09
CS-206ENST00000546930 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa15.52■□□□□ 0.07
CS-206ENST00000546930 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
CS-206ENST00000546930 SMARCA2P51531 1590 aa15.47■□□□□ 0.07
CS-206ENST00000546930 HMGXB3Q12766 1538 aa15.45■□□□□ 0.06
CS-206ENST00000546930 NCAPD3P42695 1498 aa15.42■□□□□ 0.06
CS-206ENST00000546930 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
CS-206ENST00000546930 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
CS-206ENST00000546930 PRDM2Q13029 1718 aa15.13■□□□□ 0.01
CS-206ENST00000546930 CCDC88BA6NC98 1476 aa15.13■□□□□ 0.01
CS-206ENST00000546930 NESP48681 1621 aa15.11■□□□□ 0.01
CS-206ENST00000546930 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
CS-206ENST00000546930 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa15.06■□□□□ 0
CS-206ENST00000546930 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa15.03■□□□□ -0
CS-206ENST00000546930 CFTRP13569 1480 aa14.97□□□□□ -0.01
CS-206ENST00000546930 CADPSQ9ULU8 1353 aa14.93□□□□□ -0.02
CS-206ENST00000546930 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CS-206ENST00000546930 FANCD2Q9BXW9 1451 aa14.83□□□□□ -0.03
CS-206ENST00000546930 CEP164Q9UPV0 1460 aa14.78□□□□□ -0.04
CS-206ENST00000546930 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
CS-206ENST00000546930 ERCC6Q03468 1493 aa14.76□□□□□ -0.05
CS-206ENST00000546930 PDS5BQ9NTI5 1447 aa14.76□□□□□ -0.05
CS-206ENST00000546930 ABCC8Q09428 1581 aa14.75□□□□□ -0.05
CS-206ENST00000546930 WDR62O43379 1518 aa14.75□□□□□ -0.05
CS-206ENST00000546930 MRC2Q9UBG0 1479 aa14.73□□□□□ -0.05
CS-206ENST00000546930 CUX1P39880 1505 aa14.71□□□□□ -0.05
CS-206ENST00000546930 SYNJ1O43426 1573 aa14.71□□□□□ -0.05
CS-206ENST00000546930 DNMBPQ6XZF7 1577 aa14.69□□□□□ -0.06
CS-206ENST00000546930 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa14.69□□□□□ -0.06
CS-206ENST00000546930 TOPBP1Q92547 1522 aa14.67□□□□□ -0.06
CS-206ENST00000546930 WDR97A6NE52 1622 aa14.63□□□□□ -0.07
CS-206ENST00000546930 TOP2BQ02880 1626 aa14.63□□□□□ -0.07
CS-206ENST00000546930 CUX2O14529 1486 aa14.6□□□□□ -0.07
CS-206ENST00000546930 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CS-206ENST00000546930 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CS-206ENST00000546930 FGD5Q6ZNL6 1462 aa14.56□□□□□ -0.08
CS-206ENST00000546930 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
CS-206ENST00000546930 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa14.5□□□□□ -0.09
CS-206ENST00000546930 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CS-206ENST00000546930 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CS-206ENST00000546930 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa14.46□□□□□ -0.09
CS-206ENST00000546930 PBRM1Q86U86 1689 aa14.46□□□□□ -0.1
CS-206ENST00000546930 IFT140Q96RY7 1462 aa14.44□□□□□ -0.1
CS-206ENST00000546930 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.41□□□□□ -0.1
CS-206ENST00000546930 SOGA1O94964 1423 aa14.38□□□□□ -0.11
CS-206ENST00000546930 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP14.33□□□□□ -0.122e-12■■■■□ 24.9
CS-206ENST00000546930 CHD1O14646 1710 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-206ENST00000546930 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa14.32□□□□□ -0.12
CS-206ENST00000546930 CHIC1Q5VXU3 224 aa14.31□□□□□ -0.12
CS-206ENST00000546930 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
CS-206ENST00000546930 ADAMTS12P58397 1594 aa14.29□□□□□ -0.12
CS-206ENST00000546930 GAPVD1Q14C86 1478 aa14.27□□□□□ -0.12
CS-206ENST00000546930 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa14.25□□□□□ -0.13
CS-206ENST00000546930 ERICH3Q5RHP9 1530 aa14.23□□□□□ -0.13
CS-206ENST00000546930 GRIN2BQ13224 1484 aa14.22□□□□□ -0.13
CS-206ENST00000546930 CUL7Q14999 1698 aa14.2□□□□□ -0.14
CS-206ENST00000546930 TRIM41Q8WV44 630 aa14.19□□□□□ -0.14
CS-206ENST00000546930 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
CS-206ENST00000546930 KIF27Q86VH2 1401 aa14.16□□□□□ -0.14
CS-206ENST00000546930 CEP170Q5SW79 1584 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-206ENST00000546930 IGF1RP08069 1367 aa14.13□□□□□ -0.15
CS-206ENST00000546930 SYNJ2O15056 1496 aa14.12□□□□□ -0.15
CS-206ENST00000546930 GRIN2AQ12879 1464 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-206ENST00000546930 CLASP1Q7Z460 1538 aa14.1□□□□□ -0.15
CS-206ENST00000546930 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.08□□□□□ -0.15
CS-206ENST00000546930 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-206ENST00000546930 KIF21BO75037 1637 aa14.08□□□□□ -0.16
CS-206ENST00000546930 PRXQ9BXM0 1461 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-206ENST00000546930 NUP160Q12769 1436 aa14.03□□□□□ -0.16
CS-206ENST00000546930 EEA1Q15075 1411 aa14.03□□□□□ -0.16
CS-206ENST00000546930 SHROOM2Q13796 1616 aa14.02□□□□□ -0.16
CS-206ENST00000546930 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa14.02□□□□□ -0.16
CS-206ENST00000546930 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa14.01□□□□□ -0.17
CS-206ENST00000546930 ERCC6L2Q5T890 1561 aa13.98□□□□□ -0.17
CS-206ENST00000546930 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
CS-206ENST00000546930 IQGAP2Q13576 1575 aa13.93□□□□□ -0.18
CS-206ENST00000546930 CSRNP3Q8WYN3 585 aa13.93□□□□□ -0.18
CS-206ENST00000546930 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 124.9 ms