RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.54■■■■□ 3.28
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CS-230ENST00000551968 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.18■■■□□ 2.74
CS-230ENST00000551968 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.69■■■□□ 2.66
CS-230ENST00000551968 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.96■■■□□ 2.55
CS-230ENST00000551968 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.6■■■□□ 2.492e-8■■■□□ 14.8
CS-230ENST00000551968 NACADO15069 1562 aa30.56■■■□□ 2.48
CS-230ENST00000551968 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.43■■■□□ 2.46
CS-230ENST00000551968 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.3■■■□□ 2.44
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CS-230ENST00000551968 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.86■■■□□ 2.37
CS-230ENST00000551968 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.74■■■□□ 2.35
CS-230ENST00000551968 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.74■■■□□ 2.35
CS-230ENST00000551968 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.52■■■□□ 2.32
CS-230ENST00000551968 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.49■■■□□ 2.31
CS-230ENST00000551968 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
CS-230ENST00000551968 SCRIBQ14160 1630 aa29.36■■■□□ 2.29
CS-230ENST00000551968 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
CS-230ENST00000551968 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.24■■■□□ 2.27
CS-230ENST00000551968 CUX2O14529 1486 aa28.61■■■□□ 2.17
CS-230ENST00000551968 ERCC6Q03468 1493 aa28.43■■■□□ 2.14
CS-230ENST00000551968 NCAPD3P42695 1498 aa28.25■■■□□ 2.11
CS-230ENST00000551968 NESP48681 1621 aa28.17■■■□□ 2.1
CS-230ENST00000551968 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.1■■■□□ 2.09
CS-230ENST00000551968 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
CS-230ENST00000551968 HMGXB3Q12766 1538 aa27.97■■■□□ 2.07
CS-230ENST00000551968 TRIM41Q8WV44 630 aa27.92■■■□□ 2.06
CS-230ENST00000551968 SMARCA2P51531 1590 aa27.9■■■□□ 2.06
CS-230ENST00000551968 SMARCA4P51532 1647 aa27.9■■■□□ 2.06
CS-230ENST00000551968 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.76■■■□□ 2.03
CS-230ENST00000551968 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
CS-230ENST00000551968 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.71■■■□□ 2.03
CS-230ENST00000551968 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.6■■■□□ 2.01
CS-230ENST00000551968 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.58■■■□□ 2.01
CS-230ENST00000551968 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.54■■■□□ 2
CS-230ENST00000551968 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.44■■□□□ 1.98
CS-230ENST00000551968 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.41■■□□□ 1.98
CS-230ENST00000551968 WDR62O43379 1518 aa27.39■■□□□ 1.98
CS-230ENST00000551968 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.35■■□□□ 1.97
CS-230ENST00000551968 OSCARQ8IYS5 282 aa27.17■■□□□ 1.94
CS-230ENST00000551968 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.13■■□□□ 1.93
CS-230ENST00000551968 WIZO95785 1651 aa27.09■■□□□ 1.93
CS-230ENST00000551968 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.06■■□□□ 1.92
CS-230ENST00000551968 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.03■■□□□ 1.92
CS-230ENST00000551968 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.03■■□□□ 1.92
CS-230ENST00000551968 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.03■■□□□ 1.92
CS-230ENST00000551968 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
CS-230ENST00000551968 CFTRP13569 1480 aa26.9■■□□□ 1.9
CS-230ENST00000551968 ARHGEF11O15085 1522 aa26.83■■□□□ 1.89
CS-230ENST00000551968 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
CS-230ENST00000551968 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.66■■□□□ 1.86
CS-230ENST00000551968 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
CS-230ENST00000551968 IFT140Q96RY7 1462 aa26.61■■□□□ 1.85
CS-230ENST00000551968 PRDM2Q13029 1718 aa26.59■■□□□ 1.85
CS-230ENST00000551968 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
CS-230ENST00000551968 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
CS-230ENST00000551968 ARAP1Q96P48 1450 aa26.55■■□□□ 1.84
CS-230ENST00000551968 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
CS-230ENST00000551968 CHD1O14646 1710 aa26.51■■□□□ 1.83
CS-230ENST00000551968 TOPBP1Q92547 1522 aa26.49■■□□□ 1.83
CS-230ENST00000551968 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.4■■□□□ 1.822e-12■■■■□ 25.6
CS-230ENST00000551968 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.36■■□□□ 1.81
CS-230ENST00000551968 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
CS-230ENST00000551968 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.31■■□□□ 1.8
CS-230ENST00000551968 FBLN2P98095 1184 aa26.3■■□□□ 1.8
CS-230ENST00000551968 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
CS-230ENST00000551968 ABCC8Q09428 1581 aa26.25■■□□□ 1.79
CS-230ENST00000551968 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
CS-230ENST00000551968 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.16■■□□□ 1.78
CS-230ENST00000551968 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.15■■□□□ 1.78
CS-230ENST00000551968 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
CS-230ENST00000551968 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.09■■□□□ 1.77
CS-230ENST00000551968 SOGA1O94964 1423 aa26.01■■□□□ 1.75
CS-230ENST00000551968 SYNJ1O43426 1573 aa25.99■■□□□ 1.75
CS-230ENST00000551968 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
CS-230ENST00000551968 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.91■■□□□ 1.74
CS-230ENST00000551968 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
CS-230ENST00000551968 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.9■■□□□ 1.74
CS-230ENST00000551968 WDR97A6NE52 1622 aa25.88■■□□□ 1.73
CS-230ENST00000551968 SYNJ2O15056 1496 aa25.85■■□□□ 1.73
CS-230ENST00000551968 GRIN2BQ13224 1484 aa25.85■■□□□ 1.73
CS-230ENST00000551968 CUX1P39880 1505 aa25.81■■□□□ 1.72
CS-230ENST00000551968 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.8■■□□□ 1.72
CS-230ENST00000551968 PBRM1Q86U86 1689 aa25.78■■□□□ 1.72
CS-230ENST00000551968 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.63■■□□□ 1.69
CS-230ENST00000551968 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.62■■□□□ 1.69
CS-230ENST00000551968 CEP170Q5SW79 1584 aa25.59■■□□□ 1.69
CS-230ENST00000551968 GRIN2AQ12879 1464 aa25.55■■□□□ 1.68
CS-230ENST00000551968 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.54■■□□□ 1.68
CS-230ENST00000551968 SHROOM2Q13796 1616 aa25.5■■□□□ 1.67
CS-230ENST00000551968 NUP160Q12769 1436 aa25.49■■□□□ 1.67
CS-230ENST00000551968 ADAMTS12P58397 1594 aa25.48■■□□□ 1.67
CS-230ENST00000551968 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.35■■□□□ 1.65
CS-230ENST00000551968 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CS-230ENST00000551968 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.3■■□□□ 1.64
CS-230ENST00000551968 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
CS-230ENST00000551968 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.3■■□□□ 1.64
CS-230ENST00000551968 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.3■■□□□ 1.64
CS-230ENST00000551968 DIP2BQ9P265 1576 aa25.26■■□□□ 1.63
CS-230ENST00000551968 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.24■■□□□ 1.63
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