RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 NISCHQ9Y2I1 1504 aa21.04■□□□□ 0.96
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CS-211ENST00000548041 PEG3Q9GZU2 1588 aa16.17■□□□□ 0.18
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CS-211ENST00000548041 FANCD2Q9BXW9 1451 aa15.52■□□□□ 0.08
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CS-211ENST00000548041 CUX2O14529 1486 aa15.48■□□□□ 0.07
CS-211ENST00000548041 MRC2Q9UBG0 1479 aa15.47■□□□□ 0.07
CS-211ENST00000548041 WDR62O43379 1518 aa15.46■□□□□ 0.07
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CS-211ENST00000548041 TOPBP1Q92547 1522 aa15.31■□□□□ 0.04
CS-211ENST00000548041 CUX1P39880 1505 aa15.24■□□□□ 0.03
CS-211ENST00000548041 ABCC8Q09428 1581 aa15.24■□□□□ 0.03
CS-211ENST00000548041 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
CS-211ENST00000548041 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa15.18■□□□□ 0.02
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CS-211ENST00000548041 SYNJ1O43426 1573 aa15.17■□□□□ 0.02
CS-211ENST00000548041 WDR97A6NE52 1622 aa15.17■□□□□ 0.02
CS-211ENST00000548041 FGD5Q6ZNL6 1462 aa15.16■□□□□ 0.02
CS-211ENST00000548041 IFT140Q96RY7 1462 aa15.15■□□□□ 0.02
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CS-211ENST00000548041 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa15.11■□□□□ 0.01
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CS-211ENST00000548041 SOGA1O94964 1423 aa15.05■□□□□ -0
CS-211ENST00000548041 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa15.02□□□□□ -0.01
CS-211ENST00000548041 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP15.01□□□□□ -0.012e-12■■■■□ 24.9
CS-211ENST00000548041 CHD1O14646 1710 aa15□□□□□ -0.01
CS-211ENST00000548041 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa14.99□□□□□ -0.01
CS-211ENST00000548041 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
CS-211ENST00000548041 GAPVD1Q14C86 1478 aa14.92□□□□□ -0.02
CS-211ENST00000548041 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa14.91□□□□□ -0.02
CS-211ENST00000548041 GRIN2BQ13224 1484 aa14.89□□□□□ -0.03
CS-211ENST00000548041 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CS-211ENST00000548041 ADAMTS12P58397 1594 aa14.85□□□□□ -0.03
CS-211ENST00000548041 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa14.84□□□□□ -0.03
CS-211ENST00000548041 ERICH3Q5RHP9 1530 aa14.82□□□□□ -0.04
CS-211ENST00000548041 SYNJ2O15056 1496 aa14.8□□□□□ -0.04
CS-211ENST00000548041 FBLN2P98095 1184 aa14.76□□□□□ -0.05
CS-211ENST00000548041 CUL7Q14999 1698 aa14.76□□□□□ -0.05
CS-211ENST00000548041 OSCARQ8IYS5 282 aa14.75□□□□□ -0.05
CS-211ENST00000548041 KIF27Q86VH2 1401 aa14.75□□□□□ -0.05
CS-211ENST00000548041 CLASP1Q7Z460 1538 aa14.74□□□□□ -0.05
CS-211ENST00000548041 GRIN2AQ12879 1464 aa14.74□□□□□ -0.05
CS-211ENST00000548041 CEP170Q5SW79 1584 aa14.73□□□□□ -0.05
CS-211ENST00000548041 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa14.72□□□□□ -0.05
CS-211ENST00000548041 FHAD1B1AJZ9 1412 aa14.72□□□□□ -0.05
CS-211ENST00000548041 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa14.71□□□□□ -0.05
CS-211ENST00000548041 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa14.71□□□□□ -0.05
CS-211ENST00000548041 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa14.71□□□□□ -0.05
CS-211ENST00000548041 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CS-211ENST00000548041 TRIM41Q8WV44 630 aa14.71□□□□□ -0.05
CS-211ENST00000548041 IGF1RP08069 1367 aa14.66□□□□□ -0.06
CS-211ENST00000548041 ARHGEF11O15085 1522 aa14.66□□□□□ -0.06
CS-211ENST00000548041 NUP160Q12769 1436 aa14.65□□□□□ -0.06
CS-211ENST00000548041 SHROOM2Q13796 1616 aa14.61□□□□□ -0.07
CS-211ENST00000548041 CHIC1Q5VXU3 224 aa14.6□□□□□ -0.07
CS-211ENST00000548041 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-211ENST00000548041 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa14.59□□□□□ -0.07
CS-211ENST00000548041 ERCC6L2Q5T890 1561 aa14.57□□□□□ -0.08
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