RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547912.1

CS-210, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 674 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-210ENST00000547912 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
CS-210ENST00000547912 CHIC1Q5VXU3 224 aa15.51■□□□□ 0.07
CS-210ENST00000547912 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
CS-210ENST00000547912 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP13.79□□□□□ -0.2
CS-210ENST00000547912 FOXD1Q16676 465 aa13□□□□□ -0.33
CS-210ENST00000547912 NISCHQ9Y2I1 1504 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-210ENST00000547912 PLPPR3Q6T4P5 718 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-210ENST00000547912 MSH5O43196 834 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-210ENST00000547912 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
CS-210ENST00000547912 PPP6R1Q9UPN7 881 aa12.07□□□□□ -0.48
CS-210ENST00000547912 ADRA2BP18089 450 aa12.03□□□□□ -0.48
CS-210ENST00000547912 POTEDQ86YR6 584 aa11.98□□□□□ -0.49
CS-210ENST00000547912 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa11.45□□□□□ -0.58
CS-210ENST00000547912 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
CS-210ENST00000547912 DMRT2Q9Y5R5 561 aa11.1□□□□□ -0.63
CS-210ENST00000547912 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
CS-210ENST00000547912 ABCC9O60706 1549 aa11.04□□□□□ -0.64
CS-210ENST00000547912 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-210ENST00000547912 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
CS-210ENST00000547912 DCAF8L2P0C7V8 631 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-210ENST00000547912 NACADO15069 1562 aa10.73□□□□□ -0.69
CS-210ENST00000547912 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa10.73□□□□□ -0.69
CS-210ENST00000547912 MYO15BQ96JP2 1530 aa10.7□□□□□ -0.7
CS-210ENST00000547912 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
CS-210ENST00000547912 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa10.69□□□□□ -0.7
CS-210ENST00000547912 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa10.68□□□□□ -0.7
CS-210ENST00000547912 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
CS-210ENST00000547912 DCAF8L1A6NGE4 600 aa10.57□□□□□ -0.72
CS-210ENST00000547912 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
CS-210ENST00000547912 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
CS-210ENST00000547912 DNAJC5BQ9UF47 199 aa10.45□□□□□ -0.74
CS-210ENST00000547912 UNC13AQ9UPW8 1703 aa10.44□□□□□ -0.74
CS-210ENST00000547912 RNF39Q9H2S5 420 aa10.43□□□□□ -0.74
CS-210ENST00000547912 SCRIBQ14160 1630 aa10.41□□□□□ -0.74
CS-210ENST00000547912 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
CS-210ENST00000547912 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP10.32□□□□□ -0.762e-8■■■□□ 14.8
CS-210ENST00000547912 BICRAQ9NZM4 1560 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-210ENST00000547912 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa10.31□□□□□ -0.76
CS-210ENST00000547912 NPM3O75607 178 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
CS-210ENST00000547912 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP10.15□□□□□ -0.78
CS-210ENST00000547912 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CS-210ENST00000547912 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
CS-210ENST00000547912 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa10□□□□□ -0.81
CS-210ENST00000547912 SMARCA4P51532 1647 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-210ENST00000547912 CECR2Q9BXF3 1484 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-210ENST00000547912 KCNA4P22459 653 aa9.94□□□□□ -0.82
CS-210ENST00000547912 SMARCA2P51531 1590 aa9.92□□□□□ -0.82
CS-210ENST00000547912 MROH2BQ7Z745 1585 aa9.89□□□□□ -0.83
CS-210ENST00000547912 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
CS-210ENST00000547912 PEG3Q9GZU2 1588 aa9.88□□□□□ -0.83
CS-210ENST00000547912 NCAPD3P42695 1498 aa9.87□□□□□ -0.83
CS-210ENST00000547912 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa9.87□□□□□ -0.83
CS-210ENST00000547912 HMGXB3Q12766 1538 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-210ENST00000547912 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
CS-210ENST00000547912 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
CS-210ENST00000547912 WIZO95785 1651 aa9.81□□□□□ -0.84
CS-210ENST00000547912 APLP2Q06481 763 aa9.79□□□□□ -0.84
CS-210ENST00000547912 CAPN15O75808 1086 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-210ENST00000547912 SLC4A2P04920 1241 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-210ENST00000547912 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
CS-210ENST00000547912 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
CS-210ENST00000547912 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
CS-210ENST00000547912 DSG3P32926 999 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-210ENST00000547912 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CS-210ENST00000547912 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
CS-210ENST00000547912 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
CS-210ENST00000547912 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CS-210ENST00000547912 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa9.63□□□□□ -0.87
CS-210ENST00000547912 CCDC88BA6NC98 1476 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-210ENST00000547912 CADPSQ9ULU8 1353 aa9.59□□□□□ -0.87
CS-210ENST00000547912 TRHP20396 242 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CS-210ENST00000547912 ERCC6Q03468 1493 aa9.57□□□□□ -0.88
CS-210ENST00000547912 PDS5BQ9NTI5 1447 aa9.56□□□□□ -0.88
CS-210ENST00000547912 NESP48681 1621 aa9.56□□□□□ -0.88
CS-210ENST00000547912 CFTRP13569 1480 aa9.55□□□□□ -0.88
CS-210ENST00000547912 PRDM2Q13029 1718 aa9.54□□□□□ -0.88
CS-210ENST00000547912 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
CS-210ENST00000547912 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-210ENST00000547912 CEP164Q9UPV0 1460 aa9.49□□□□□ -0.89
CS-210ENST00000547912 FANCD2Q9BXW9 1451 aa9.48□□□□□ -0.89
CS-210ENST00000547912 ABCB7O75027 752 aa9.47□□□□□ -0.89
CS-210ENST00000547912 MRC2Q9UBG0 1479 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-210ENST00000547912 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-210ENST00000547912 CUX2O14529 1486 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-210ENST00000547912 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
CS-210ENST00000547912 POTEHQ6S545 545 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-210ENST00000547912 ABCC8Q09428 1581 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-210ENST00000547912 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
CS-210ENST00000547912 WDR62O43379 1518 aa9.39□□□□□ -0.91
CS-210ENST00000547912 FOXD4L1Q9NU39 408 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-210ENST00000547912 DNMBPQ6XZF7 1577 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-210ENST00000547912 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
CS-210ENST00000547912 POLA2Q14181 598 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-210ENST00000547912 TOPBP1Q92547 1522 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-210ENST00000547912 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP9.31□□□□□ -0.92
CS-210ENST00000547912 IFT140Q96RY7 1462 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-210ENST00000547912 CUX1P39880 1505 aa9.28□□□□□ -0.92
CS-210ENST00000547912 TOP2BQ02880 1626 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-210ENST00000547912 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa9.27□□□□□ -0.93
CS-210ENST00000547912 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.6 ms