RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-229ENST00000551936 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.04■■■■□ 3.36
CS-229ENST00000551936 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.22■■■□□ 2.75
CS-229ENST00000551936 ABCC9O60706 1549 aa32.04■■■□□ 2.72
CS-229ENST00000551936 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.58■■■□□ 2.49
CS-229ENST00000551936 NACADO15069 1562 aa30.43■■■□□ 2.46
CS-229ENST00000551936 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.34■■■□□ 2.45
CS-229ENST00000551936 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.09■■■□□ 2.41
CS-229ENST00000551936 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.94■■■□□ 2.38
CS-229ENST00000551936 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.91■■■□□ 2.38
CS-229ENST00000551936 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
CS-229ENST00000551936 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.89■■■□□ 2.382e-8■■■□□ 14.8
CS-229ENST00000551936 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.78■■■□□ 2.36
CS-229ENST00000551936 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.71■■■□□ 2.35
CS-229ENST00000551936 SCRIBQ14160 1630 aa29.37■■■□□ 2.29
CS-229ENST00000551936 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.29■■■□□ 2.28
CS-229ENST00000551936 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.96■■■□□ 2.23
CS-229ENST00000551936 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
CS-229ENST00000551936 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.84■■■□□ 2.21
CS-229ENST00000551936 NCAPD3P42695 1498 aa28.11■■■□□ 2.09
CS-229ENST00000551936 SMARCA4P51532 1647 aa28.05■■■□□ 2.08
CS-229ENST00000551936 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.05■■■□□ 2.08
CS-229ENST00000551936 SMARCA2P51531 1590 aa27.95■■■□□ 2.07
CS-229ENST00000551936 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
CS-229ENST00000551936 HMGXB3Q12766 1538 aa27.89■■■□□ 2.06
CS-229ENST00000551936 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.79■■■□□ 2.04
CS-229ENST00000551936 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.77■■■□□ 2.04
CS-229ENST00000551936 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
CS-229ENST00000551936 ERCC6Q03468 1493 aa27.62■■■□□ 2.01
CS-229ENST00000551936 NESP48681 1621 aa27.59■■■□□ 2.01
CS-229ENST00000551936 CUX2O14529 1486 aa27.52■■■□□ 2
CS-229ENST00000551936 WIZO95785 1651 aa27.46■■□□□ 1.99
CS-229ENST00000551936 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.42■■□□□ 1.98
CS-229ENST00000551936 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.32■■□□□ 1.96
CS-229ENST00000551936 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
CS-229ENST00000551936 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.27■■□□□ 1.96
CS-229ENST00000551936 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.26■■□□□ 1.95
CS-229ENST00000551936 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
CS-229ENST00000551936 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.24■■□□□ 1.95
CS-229ENST00000551936 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
CS-229ENST00000551936 CFTRP13569 1480 aa27■■□□□ 1.91
CS-229ENST00000551936 MRC2Q9UBG0 1479 aa27■■□□□ 1.91
CS-229ENST00000551936 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.93■■□□□ 1.9
CS-229ENST00000551936 WDR62O43379 1518 aa26.93■■□□□ 1.9
CS-229ENST00000551936 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.93■■□□□ 1.9
CS-229ENST00000551936 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.82■■□□□ 1.88
CS-229ENST00000551936 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
CS-229ENST00000551936 PRDM2Q13029 1718 aa26.71■■□□□ 1.87
CS-229ENST00000551936 TOPBP1Q92547 1522 aa26.45■■□□□ 1.83
CS-229ENST00000551936 ABCC8Q09428 1581 aa26.41■■□□□ 1.82
CS-229ENST00000551936 IFT140Q96RY7 1462 aa26.4■■□□□ 1.82
CS-229ENST00000551936 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.37■■□□□ 1.81
CS-229ENST00000551936 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
CS-229ENST00000551936 OSCARQ8IYS5 282 aa26.34■■□□□ 1.81
CS-229ENST00000551936 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
CS-229ENST00000551936 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
CS-229ENST00000551936 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
CS-229ENST00000551936 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
CS-229ENST00000551936 TRIM41Q8WV44 630 aa26.18■■□□□ 1.78
CS-229ENST00000551936 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.15■■□□□ 1.782e-12■■■■□ 24.9
CS-229ENST00000551936 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.11■■□□□ 1.77
CS-229ENST00000551936 SOGA1O94964 1423 aa26.09■■□□□ 1.77
CS-229ENST00000551936 CUX1P39880 1505 aa26.08■■□□□ 1.77
CS-229ENST00000551936 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.05■■□□□ 1.76
CS-229ENST00000551936 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
CS-229ENST00000551936 CHD1O14646 1710 aa25.96■■□□□ 1.75
CS-229ENST00000551936 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.95■■□□□ 1.74
CS-229ENST00000551936 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.95■■□□□ 1.74
CS-229ENST00000551936 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.95■■□□□ 1.74
CS-229ENST00000551936 WDR97A6NE52 1622 aa25.94■■□□□ 1.74
CS-229ENST00000551936 FBLN2P98095 1184 aa25.92■■□□□ 1.74
CS-229ENST00000551936 ARHGEF11O15085 1522 aa25.88■■□□□ 1.73
CS-229ENST00000551936 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.86■■□□□ 1.73
CS-229ENST00000551936 GRIN2BQ13224 1484 aa25.82■■□□□ 1.72
CS-229ENST00000551936 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
CS-229ENST00000551936 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.78■■□□□ 1.72
CS-229ENST00000551936 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
CS-229ENST00000551936 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.77■■□□□ 1.72
CS-229ENST00000551936 PBRM1Q86U86 1689 aa25.73■■□□□ 1.71
CS-229ENST00000551936 SYNJ2O15056 1496 aa25.72■■□□□ 1.71
CS-229ENST00000551936 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.71■■□□□ 1.71
CS-229ENST00000551936 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.71■■□□□ 1.71
CS-229ENST00000551936 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.71■■□□□ 1.71
CS-229ENST00000551936 TOP2BQ02880 1626 aa25.7■■□□□ 1.71
CS-229ENST00000551936 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.7■■□□□ 1.7
CS-229ENST00000551936 SYNJ1O43426 1573 aa25.68■■□□□ 1.7
CS-229ENST00000551936 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.68■■□□□ 1.7
CS-229ENST00000551936 ARAP1Q96P48 1450 aa25.65■■□□□ 1.7
CS-229ENST00000551936 ADAMTS12P58397 1594 aa25.48■■□□□ 1.67
CS-229ENST00000551936 GRIN2AQ12879 1464 aa25.48■■□□□ 1.67
CS-229ENST00000551936 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.46■■□□□ 1.67
CS-229ENST00000551936 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.45■■□□□ 1.66
CS-229ENST00000551936 NUP160Q12769 1436 aa25.41■■□□□ 1.66
CS-229ENST00000551936 CEP170Q5SW79 1584 aa25.39■■□□□ 1.66
CS-229ENST00000551936 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CS-229ENST00000551936 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.31■■□□□ 1.64
CS-229ENST00000551936 SHROOM2Q13796 1616 aa25.26■■□□□ 1.63
CS-229ENST00000551936 IGF1RP08069 1367 aa25.22■■□□□ 1.63
CS-229ENST00000551936 KIF27Q86VH2 1401 aa25.2■■□□□ 1.62
CS-229ENST00000551936 JPH4Q96JJ6 628 aa25.18■■□□□ 1.62
CS-229ENST00000551936 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.6 ms