RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.36■■■□□ 2.45
CS-228ENST00000551473 ABCC9O60706 1549 aa27.81■■■□□ 2.04
CS-228ENST00000551473 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.44■■□□□ 1.98
CS-228ENST00000551473 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.4■■□□□ 1.82
CS-228ENST00000551473 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.36■■□□□ 1.81
CS-228ENST00000551473 NACADO15069 1562 aa26.08■■□□□ 1.77
CS-228ENST00000551473 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.82■■□□□ 1.722e-8■■■□□ 14.8
CS-228ENST00000551473 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.81■■□□□ 1.72
CS-228ENST00000551473 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.62■■□□□ 1.69
CS-228ENST00000551473 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.59■■□□□ 1.69
CS-228ENST00000551473 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.5■■□□□ 1.67
CS-228ENST00000551473 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.3■■□□□ 1.64
CS-228ENST00000551473 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.15■■□□□ 1.62
CS-228ENST00000551473 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.11■■□□□ 1.61
CS-228ENST00000551473 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.1■■□□□ 1.61
CS-228ENST00000551473 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.6
CS-228ENST00000551473 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CS-228ENST00000551473 SCRIBQ14160 1630 aa24.91■■□□□ 1.58
CS-228ENST00000551473 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.66■■□□□ 1.54
CS-228ENST00000551473 CUX2O14529 1486 aa24.25■■□□□ 1.47
CS-228ENST00000551473 ERCC6Q03468 1493 aa24.12■■□□□ 1.45
CS-228ENST00000551473 NCAPD3P42695 1498 aa24.07■■□□□ 1.44
CS-228ENST00000551473 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.92■■□□□ 1.42
CS-228ENST00000551473 SMARCA2P51531 1590 aa23.86■■□□□ 1.41
CS-228ENST00000551473 HMGXB3Q12766 1538 aa23.85■■□□□ 1.41
CS-228ENST00000551473 SMARCA4P51532 1647 aa23.75■■□□□ 1.39
CS-228ENST00000551473 NESP48681 1621 aa23.73■■□□□ 1.39
CS-228ENST00000551473 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
CS-228ENST00000551473 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
CS-228ENST00000551473 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CS-228ENST00000551473 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.6■■□□□ 1.37
CS-228ENST00000551473 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.57■■□□□ 1.36
CS-228ENST00000551473 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.52■■□□□ 1.36
CS-228ENST00000551473 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.4■■□□□ 1.34
CS-228ENST00000551473 TRIM41Q8WV44 630 aa23.39■■□□□ 1.33
CS-228ENST00000551473 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.34■■□□□ 1.33
CS-228ENST00000551473 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.33■■□□□ 1.33
CS-228ENST00000551473 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.3■■□□□ 1.32
CS-228ENST00000551473 WDR62O43379 1518 aa23.23■■□□□ 1.31
CS-228ENST00000551473 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.13■■□□□ 1.29
CS-228ENST00000551473 OSCARQ8IYS5 282 aa23.06■■□□□ 1.28
CS-228ENST00000551473 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.05■■□□□ 1.28
CS-228ENST00000551473 WIZO95785 1651 aa23.01■■□□□ 1.27
CS-228ENST00000551473 CFTRP13569 1480 aa22.96■■□□□ 1.27
CS-228ENST00000551473 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
CS-228ENST00000551473 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
CS-228ENST00000551473 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
CS-228ENST00000551473 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.71■■□□□ 1.23
CS-228ENST00000551473 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.71■■□□□ 1.23
CS-228ENST00000551473 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.71■■□□□ 1.23
CS-228ENST00000551473 IFT140Q96RY7 1462 aa22.69■■□□□ 1.22
CS-228ENST00000551473 ARHGEF11O15085 1522 aa22.63■■□□□ 1.21
CS-228ENST00000551473 PRDM2Q13029 1718 aa22.62■■□□□ 1.21
CS-228ENST00000551473 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CS-228ENST00000551473 ABCC8Q09428 1581 aa22.56■■□□□ 1.2
CS-228ENST00000551473 TOPBP1Q92547 1522 aa22.54■■□□□ 1.2
CS-228ENST00000551473 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.5■■□□□ 1.19
CS-228ENST00000551473 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.49■■□□□ 1.19
CS-228ENST00000551473 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CS-228ENST00000551473 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.43■■□□□ 1.18
CS-228ENST00000551473 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CS-228ENST00000551473 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.172e-12■■■■□ 25.6
CS-228ENST00000551473 ARAP1Q96P48 1450 aa22.36■■□□□ 1.17
CS-228ENST00000551473 FBLN2P98095 1184 aa22.35■■□□□ 1.17
CS-228ENST00000551473 CHD1O14646 1710 aa22.34■■□□□ 1.17
CS-228ENST00000551473 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CS-228ENST00000551473 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CS-228ENST00000551473 SOGA1O94964 1423 aa22.2■■□□□ 1.14
CS-228ENST00000551473 WDR97A6NE52 1622 aa22.2■■□□□ 1.14
CS-228ENST00000551473 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CS-228ENST00000551473 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.17■■□□□ 1.14
CS-228ENST00000551473 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CS-228ENST00000551473 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.15■■□□□ 1.14
CS-228ENST00000551473 SYNJ1O43426 1573 aa22.15■■□□□ 1.14
CS-228ENST00000551473 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CS-228ENST00000551473 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.14■■□□□ 1.13
CS-228ENST00000551473 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CS-228ENST00000551473 GRIN2BQ13224 1484 aa22.08■■□□□ 1.12
CS-228ENST00000551473 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.08■■□□□ 1.12
CS-228ENST00000551473 SYNJ2O15056 1496 aa22.05■■□□□ 1.12
CS-228ENST00000551473 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.96■■□□□ 1.11
CS-228ENST00000551473 CUX1P39880 1505 aa21.96■■□□□ 1.11
CS-228ENST00000551473 PBRM1Q86U86 1689 aa21.87■■□□□ 1.09
CS-228ENST00000551473 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.83■■□□□ 1.09
CS-228ENST00000551473 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.8■■□□□ 1.08
CS-228ENST00000551473 GRIN2AQ12879 1464 aa21.77■■□□□ 1.07
CS-228ENST00000551473 NUP160Q12769 1436 aa21.72■■□□□ 1.07
CS-228ENST00000551473 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.7■■□□□ 1.06
CS-228ENST00000551473 CEP170Q5SW79 1584 aa21.69■■□□□ 1.06
CS-228ENST00000551473 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.69■■□□□ 1.06
CS-228ENST00000551473 ADAMTS12P58397 1594 aa21.67■■□□□ 1.06
CS-228ENST00000551473 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.65■■□□□ 1.06
CS-228ENST00000551473 SHROOM2Q13796 1616 aa21.62■■□□□ 1.05
CS-228ENST00000551473 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.57■■□□□ 1.04
CS-228ENST00000551473 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
CS-228ENST00000551473 TOP2BQ02880 1626 aa21.52■■□□□ 1.04
CS-228ENST00000551473 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.51■■□□□ 1.03
CS-228ENST00000551473 KIF13AQ9H1H9 1805 aa21.51■■□□□ 1.03
CS-228ENST00000551473 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.51■■□□□ 1.03
CS-228ENST00000551473 JPH4Q96JJ6 628 aa21.5■■□□□ 1.03
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