RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.69■■■■■ 4.42
CS-214ENST00000548849 ABCC9O60706 1549 aa38.57■■■■□ 3.76
CS-214ENST00000548849 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.33■■■■□ 3.73
CS-214ENST00000548849 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.61■■■■□ 3.45
CS-214ENST00000548849 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.32■■■■□ 3.4
CS-214ENST00000548849 NACADO15069 1562 aa36.31■■■■□ 3.4
CS-214ENST00000548849 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.26■■■■□ 3.4
CS-214ENST00000548849 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.93■■■■□ 3.342e-8■■□□□ 14
CS-214ENST00000548849 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.75■■■■□ 3.31
CS-214ENST00000548849 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.72■■■■□ 3.31
CS-214ENST00000548849 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.52■■■■□ 3.28
CS-214ENST00000548849 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.33■■■■□ 3.25
CS-214ENST00000548849 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.22■■■■□ 3.23
CS-214ENST00000548849 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.99■■■■□ 3.19
CS-214ENST00000548849 SCRIBQ14160 1630 aa34.98■■■■□ 3.19
CS-214ENST00000548849 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.8■■■■□ 3.16
CS-214ENST00000548849 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.75■■■■□ 3.15
CS-214ENST00000548849 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.68■■■■□ 3.14
CS-214ENST00000548849 NCAPD3P42695 1498 aa33.53■■■□□ 2.96
CS-214ENST00000548849 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.46■■■□□ 2.95
CS-214ENST00000548849 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.42■■■□□ 2.94
CS-214ENST00000548849 SMARCA4P51532 1647 aa33.33■■■□□ 2.93
CS-214ENST00000548849 ERCC6Q03468 1493 aa33.32■■■□□ 2.92
CS-214ENST00000548849 SMARCA2P51531 1590 aa33.3■■■□□ 2.92
CS-214ENST00000548849 CUX2O14529 1486 aa33.26■■■□□ 2.92
CS-214ENST00000548849 HMGXB3Q12766 1538 aa33.23■■■□□ 2.91
CS-214ENST00000548849 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.15■■■□□ 2.9
CS-214ENST00000548849 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.1■■■□□ 2.89
CS-214ENST00000548849 NESP48681 1621 aa33.08■■■□□ 2.89
CS-214ENST00000548849 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.97■■■□□ 2.87
CS-214ENST00000548849 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.91■■■□□ 2.86
CS-214ENST00000548849 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.79■■■□□ 2.84
CS-214ENST00000548849 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.72■■■□□ 2.83
CS-214ENST00000548849 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.65■■■□□ 2.82
CS-214ENST00000548849 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.62■■■□□ 2.81
CS-214ENST00000548849 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.53■■■□□ 2.8
CS-214ENST00000548849 WIZO95785 1651 aa32.52■■■□□ 2.8
CS-214ENST00000548849 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.35■■■□□ 2.77
CS-214ENST00000548849 WDR62O43379 1518 aa32.25■■■□□ 2.75
CS-214ENST00000548849 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.2■■■□□ 2.75
CS-214ENST00000548849 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.17■■■□□ 2.74
CS-214ENST00000548849 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.16■■■□□ 2.74
CS-214ENST00000548849 CFTRP13569 1480 aa32.1■■■□□ 2.73
CS-214ENST00000548849 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.07■■■□□ 2.72
CS-214ENST00000548849 TRIM41Q8WV44 630 aa32■■■□□ 2.71
CS-214ENST00000548849 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
CS-214ENST00000548849 OSCARQ8IYS5 282 aa31.79■■■□□ 2.68
CS-214ENST00000548849 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.74■■■□□ 2.67
CS-214ENST00000548849 PRDM2Q13029 1718 aa31.73■■■□□ 2.67
CS-214ENST00000548849 IFT140Q96RY7 1462 aa31.56■■■□□ 2.64
CS-214ENST00000548849 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.54■■■□□ 2.64
CS-214ENST00000548849 TOPBP1Q92547 1522 aa31.52■■■□□ 2.64
CS-214ENST00000548849 ABCC8Q09428 1581 aa31.45■■■□□ 2.63
CS-214ENST00000548849 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.38■■■□□ 2.61
CS-214ENST00000548849 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.33■■■□□ 2.61
CS-214ENST00000548849 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.33■■■□□ 2.61
CS-214ENST00000548849 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.33■■■□□ 2.61
CS-214ENST00000548849 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.32■■■□□ 2.6
CS-214ENST00000548849 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.26■■■□□ 2.593e-8■■■■■ 26.8
CS-214ENST00000548849 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.23■■■□□ 2.59
CS-214ENST00000548849 ARHGEF11O15085 1522 aa31.22■■■□□ 2.59
CS-214ENST00000548849 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.19■■■□□ 2.58
CS-214ENST00000548849 FBLN2P98095 1184 aa31.15■■■□□ 2.58
CS-214ENST00000548849 CHD1O14646 1710 aa31.12■■■□□ 2.57
CS-214ENST00000548849 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.11■■■□□ 2.57
CS-214ENST00000548849 CYB5RLQ6IPT4 315 aa31.09■■■□□ 2.57
CS-214ENST00000548849 SOGA1O94964 1423 aa31.08■■■□□ 2.57
CS-214ENST00000548849 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
CS-214ENST00000548849 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.98■■■□□ 2.55
CS-214ENST00000548849 CUX1P39880 1505 aa30.92■■■□□ 2.54
CS-214ENST00000548849 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.91■■■□□ 2.54
CS-214ENST00000548849 ARAP1Q96P48 1450 aa30.89■■■□□ 2.54
CS-214ENST00000548849 WDR97A6NE52 1622 aa30.88■■■□□ 2.53
CS-214ENST00000548849 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
CS-214ENST00000548849 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.82■■■□□ 2.52
CS-214ENST00000548849 GRIN2BQ13224 1484 aa30.81■■■□□ 2.52
CS-214ENST00000548849 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
CS-214ENST00000548849 SYNJ1O43426 1573 aa30.75■■■□□ 2.51
CS-214ENST00000548849 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.75■■■□□ 2.51
CS-214ENST00000548849 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.74■■■□□ 2.51
CS-214ENST00000548849 SYNJ2O15056 1496 aa30.71■■■□□ 2.51
CS-214ENST00000548849 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.69■■■□□ 2.5
CS-214ENST00000548849 PBRM1Q86U86 1689 aa30.65■■■□□ 2.5
CS-214ENST00000548849 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.6■■■□□ 2.49
CS-214ENST00000548849 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.55■■■□□ 2.48
CS-214ENST00000548849 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.48■■■□□ 2.47
CS-214ENST00000548849 GRIN2AQ12879 1464 aa30.4■■■□□ 2.46
CS-214ENST00000548849 TOP2BQ02880 1626 aa30.37■■■□□ 2.45
CS-214ENST00000548849 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.36■■■□□ 2.45
CS-214ENST00000548849 ADAMTS12P58397 1594 aa30.34■■■□□ 2.45
CS-214ENST00000548849 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.29■■■□□ 2.44
CS-214ENST00000548849 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.29■■■□□ 2.44
CS-214ENST00000548849 NUP160Q12769 1436 aa30.29■■■□□ 2.44
CS-214ENST00000548849 CEP170Q5SW79 1584 aa30.28■■■□□ 2.44
CS-214ENST00000548849 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.22■■■□□ 2.43
CS-214ENST00000548849 SHROOM2Q13796 1616 aa30.14■■■□□ 2.42
CS-214ENST00000548849 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
CS-214ENST00000548849 JPH4Q96JJ6 628 aa30.05■■■□□ 2.4
CS-214ENST00000548849 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
CS-214ENST00000548849 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.91■■■□□ 2.38
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