RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.01■■■□□ 2.23
CS-221ENST00000550734 ABCC9O60706 1549 aa26.35■■□□□ 1.81
CS-221ENST00000550734 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.17■■□□□ 1.78
CS-221ENST00000550734 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.01■■□□□ 1.59
CS-221ENST00000550734 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.01■■□□□ 1.59
CS-221ENST00000550734 NACADO15069 1562 aa24.8■■□□□ 1.56
CS-221ENST00000550734 DCAF8L2P0C7V8 631 aa24.49■■□□□ 1.51
CS-221ENST00000550734 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.49■■□□□ 1.512e-8■■■□□ 14.8
CS-221ENST00000550734 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.47■■□□□ 1.51
CS-221ENST00000550734 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.42■■□□□ 1.5
CS-221ENST00000550734 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.33■■□□□ 1.48
CS-221ENST00000550734 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24■■□□□ 1.43
CS-221ENST00000550734 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24■■□□□ 1.43
CS-221ENST00000550734 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
CS-221ENST00000550734 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.84■■□□□ 1.41
CS-221ENST00000550734 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.8■■□□□ 1.4
CS-221ENST00000550734 SCRIBQ14160 1630 aa23.75■■□□□ 1.39
CS-221ENST00000550734 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
CS-221ENST00000550734 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.18■■□□□ 1.3
CS-221ENST00000550734 NCAPD3P42695 1498 aa22.92■■□□□ 1.26
CS-221ENST00000550734 CUX2O14529 1486 aa22.88■■□□□ 1.25
CS-221ENST00000550734 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.78■■□□□ 1.24
CS-221ENST00000550734 ERCC6Q03468 1493 aa22.76■■□□□ 1.23
CS-221ENST00000550734 HMGXB3Q12766 1538 aa22.7■■□□□ 1.22
CS-221ENST00000550734 SMARCA2P51531 1590 aa22.7■■□□□ 1.22
CS-221ENST00000550734 SMARCA4P51532 1647 aa22.68■■□□□ 1.22
CS-221ENST00000550734 NESP48681 1621 aa22.58■■□□□ 1.21
CS-221ENST00000550734 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
CS-221ENST00000550734 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.51■■□□□ 1.19
CS-221ENST00000550734 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
CS-221ENST00000550734 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CS-221ENST00000550734 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.42■■□□□ 1.18
CS-221ENST00000550734 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.33■■□□□ 1.17
CS-221ENST00000550734 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.3■■□□□ 1.16
CS-221ENST00000550734 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.29■■□□□ 1.16
CS-221ENST00000550734 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.18■■□□□ 1.14
CS-221ENST00000550734 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.09■■□□□ 1.13
CS-221ENST00000550734 WDR62O43379 1518 aa22.08■■□□□ 1.13
CS-221ENST00000550734 WIZO95785 1651 aa22.04■■□□□ 1.12
CS-221ENST00000550734 TRIM41Q8WV44 630 aa21.95■■□□□ 1.1
CS-221ENST00000550734 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.94■■□□□ 1.1
CS-221ENST00000550734 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.9■■□□□ 1.1
CS-221ENST00000550734 CFTRP13569 1480 aa21.89■■□□□ 1.09
CS-221ENST00000550734 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
CS-221ENST00000550734 OSCARQ8IYS5 282 aa21.77■■□□□ 1.08
CS-221ENST00000550734 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CS-221ENST00000550734 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
CS-221ENST00000550734 PRDM2Q13029 1718 aa21.63■■□□□ 1.05
CS-221ENST00000550734 IFT140Q96RY7 1462 aa21.54■■□□□ 1.04
CS-221ENST00000550734 CCDC88BA6NC98 1476 aa21.52■■□□□ 1.03
CS-221ENST00000550734 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.51■■□□□ 1.03
CS-221ENST00000550734 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.51■■□□□ 1.03
CS-221ENST00000550734 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.51■■□□□ 1.03
CS-221ENST00000550734 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
CS-221ENST00000550734 TOPBP1Q92547 1522 aa21.46■■□□□ 1.03
CS-221ENST00000550734 ABCC8Q09428 1581 aa21.43■■□□□ 1.02
CS-221ENST00000550734 ARHGEF11O15085 1522 aa21.42■■□□□ 1.02
CS-221ENST00000550734 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
CS-221ENST00000550734 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.37■■□□□ 1.01
CS-221ENST00000550734 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
CS-221ENST00000550734 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.28■■□□□ 12e-12■■■■□ 24.9
CS-221ENST00000550734 CHD1O14646 1710 aa21.27■■□□□ 1
CS-221ENST00000550734 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.25■□□□□ 0.99
CS-221ENST00000550734 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
CS-221ENST00000550734 ARAP1Q96P48 1450 aa21.19■□□□□ 0.98
CS-221ENST00000550734 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.14■□□□□ 0.98
CS-221ENST00000550734 FBLN2P98095 1184 aa21.14■□□□□ 0.97
CS-221ENST00000550734 SOGA1O94964 1423 aa21.12■□□□□ 0.97
CS-221ENST00000550734 WDR97A6NE52 1622 aa21.11■□□□□ 0.97
CS-221ENST00000550734 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
CS-221ENST00000550734 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
CS-221ENST00000550734 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.05■□□□□ 0.96
CS-221ENST00000550734 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.05■□□□□ 0.96
CS-221ENST00000550734 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.04■□□□□ 0.96
CS-221ENST00000550734 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
CS-221ENST00000550734 CUX1P39880 1505 aa20.99■□□□□ 0.95
CS-221ENST00000550734 SYNJ1O43426 1573 aa20.99■□□□□ 0.95
CS-221ENST00000550734 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
CS-221ENST00000550734 GRIN2BQ13224 1484 aa20.98■□□□□ 0.95
CS-221ENST00000550734 SYNJ2O15056 1496 aa20.94■□□□□ 0.94
CS-221ENST00000550734 PBRM1Q86U86 1689 aa20.87■□□□□ 0.93
CS-221ENST00000550734 GAPVD1Q14C86 1478 aa20.86■□□□□ 0.93
CS-221ENST00000550734 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.82■□□□□ 0.92
CS-221ENST00000550734 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa20.81■□□□□ 0.92
CS-221ENST00000550734 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
CS-221ENST00000550734 GRIN2AQ12879 1464 aa20.7■□□□□ 0.9
CS-221ENST00000550734 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.68■□□□□ 0.9
CS-221ENST00000550734 NUP160Q12769 1436 aa20.67■□□□□ 0.9
CS-221ENST00000550734 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.66■□□□□ 0.9
CS-221ENST00000550734 ADAMTS12P58397 1594 aa20.65■□□□□ 0.9
CS-221ENST00000550734 CEP170Q5SW79 1584 aa20.64■□□□□ 0.9
CS-221ENST00000550734 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
CS-221ENST00000550734 SHROOM2Q13796 1616 aa20.62■□□□□ 0.89
CS-221ENST00000550734 TOP2BQ02880 1626 aa20.6■□□□□ 0.89
CS-221ENST00000550734 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.6■□□□□ 0.89
CS-221ENST00000550734 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.6■□□□□ 0.89
CS-221ENST00000550734 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.56■□□□□ 0.88
CS-221ENST00000550734 KIF13AQ9H1H9 1805 aa20.48■□□□□ 0.87
CS-221ENST00000550734 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CS-221ENST00000550734 JPH4Q96JJ6 628 aa20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms