RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449692.3

C11orf68-202, Transcript of chromosome 11 open reading frame 68, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene C11orf68, Length 1,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf68-202ENST00000449692 NISCHQ9Y2I1 1504 aa72,57■■■■■ 9,21
C11orf68-202ENST00000449692 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa64,22■■■■■ 7,87
C11orf68-202ENST00000449692 ABCC9O60706 1549 aa62,38■■■■■ 7,58
C11orf68-202ENST00000449692 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP60,57■■■■■ 7,29
C11orf68-202ENST00000449692 DCAF8L2P0C7V8 631 aa60,42■■■■■ 7,26
C11orf68-202ENST00000449692 NACADO15069 1562 aa60,28■■■■■ 7,24
C11orf68-202ENST00000449692 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa60,19■■■■■ 7,23
C11orf68-202ENST00000449692 MYO15BQ96JP2 1530 aa60,1■■■■■ 7,21
C11orf68-202ENST00000449692 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa60,05■■■■■ 7,2
C11orf68-202ENST00000449692 UNC13AQ9UPW8 1703 aa58,88■■■■■ 7,02
C11orf68-202ENST00000449692 SCRIBQ14160 1630 aa58,69■■■■■ 6,99
C11orf68-202ENST00000449692 BICRAQ9NZM4 1560 aa58,42■■■■■ 6,94
C11orf68-202ENST00000449692 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP58,42■■■■■ 6,94
C11orf68-202ENST00000449692 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa57,77■■■■■ 6,84
C11orf68-202ENST00000449692 DNAJC5BQ9UF47 199 aa56,83■■■■■ 6,69
C11orf68-202ENST00000449692 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP56,8■■■■■ 6,68
C11orf68-202ENST00000449692 CECR2Q9BXF3 1484 aa56,51■■■■■ 6,64
C11orf68-202ENST00000449692 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa56,44■■■■■ 6,63
C11orf68-202ENST00000449692 SMARCA4P51532 1647 aa56,19■■■■■ 6,59
C11orf68-202ENST00000449692 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP56,18■■■■■ 6,58
C11orf68-202ENST00000449692 MROH2BQ7Z745 1585 aa55,97■■■■■ 6,55
C11orf68-202ENST00000449692 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa55,76■■■■■ 6,52
C11orf68-202ENST00000449692 SMARCA2P51531 1590 aa55,68■■■■■ 6,5
C11orf68-202ENST00000449692 NCAPD3P42695 1498 aa55,64■■■■■ 6,5
C11orf68-202ENST00000449692 PEG3Q9GZU2 1588 aa55,63■■■■■ 6,5
C11orf68-202ENST00000449692 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP55,53■■■■■ 6,48
C11orf68-202ENST00000449692 HMGXB3Q12766 1538 aa55,38■■■■■ 6,46
C11orf68-202ENST00000449692 WIZO95785 1651 aa55,38■■■■■ 6,46
C11orf68-202ENST00000449692 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP55,3■■■■■ 6,44
C11orf68-202ENST00000449692 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP54,79■■■■■ 6,36
C11orf68-202ENST00000449692 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP54,54■■■■■ 6,32
C11orf68-202ENST00000449692 CCDC88BA6NC98 1476 aa54,19■■■■■ 6,27
C11orf68-202ENST00000449692 NESP48681 1621 aa54,16■■■■■ 6,26
C11orf68-202ENST00000449692 CADPSQ9ULU8 1353 aa54,05■■■■■ 6,24
C11orf68-202ENST00000449692 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa54,05■■■■■ 6,24
C11orf68-202ENST00000449692 CFTRP13569 1480 aa53,85■■■■■ 6,21
C11orf68-202ENST00000449692 PDS5BQ9NTI5 1447 aa53,68■■■■■ 6,18
C11orf68-202ENST00000449692 ERCC6Q03468 1493 aa53,68■■■■■ 6,18
C11orf68-202ENST00000449692 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa53,5■■■■■ 6,15
C11orf68-202ENST00000449692 PRDM2Q13029 1718 aa53,43■■■■■ 6,14
C11orf68-202ENST00000449692 FANCD2Q9BXW9 1451 aa53,42■■■■■ 6,14
C11orf68-202ENST00000449692 CEP164Q9UPV0 1460 aa53,28■■■■■ 6,12
C11orf68-202ENST00000449692 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP53,19■■■■■ 6,1
C11orf68-202ENST00000449692 MRC2Q9UBG0 1479 aa53,1■■■■■ 6,09
C11orf68-202ENST00000449692 CUX2O14529 1486 aa52,91■■■■■ 6,06
C11orf68-202ENST00000449692 WDR62O43379 1518 aa52,91■■■■■ 6,06
C11orf68-202ENST00000449692 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP52,87■■■■■ 6,05
C11orf68-202ENST00000449692 TOPBP1Q92547 1522 aa52,64■■■■■ 6,02
C11orf68-202ENST00000449692 ABCC8Q09428 1581 aa52,62■■■■■ 6,01
C11orf68-202ENST00000449692 DNMBPQ6XZF7 1577 aa52,6■■■■■ 6,01
C11orf68-202ENST00000449692 CUX1P39880 1505 aa52,46■■■■■ 5,99
C11orf68-202ENST00000449692 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP52,31■■■■■ 5,96
C11orf68-202ENST00000449692 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP52,24■■■■■ 5,95
C11orf68-202ENST00000449692 FGD5Q6ZNL6 1462 aa52,18■■■■■ 5,94
C11orf68-202ENST00000449692 SYNJ1O43426 1573 aa52,16■■■■■ 5,94
C11orf68-202ENST00000449692 IFT140Q96RY7 1462 aa52,15■■■■■ 5,94
C11orf68-202ENST00000449692 TOP2BQ02880 1626 aa52,13■■■■■ 5,94
C11orf68-202ENST00000449692 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa52,12■■■■■ 5,93
C11orf68-202ENST00000449692 SOGA1O94964 1423 aa52,03■■■■■ 5,92
C11orf68-202ENST00000449692 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP52,03■■■■■ 5,92
C11orf68-202ENST00000449692 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa52,02■■■■■ 5,92
C11orf68-202ENST00000449692 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP51,91■■■■■ 5,9
C11orf68-202ENST00000449692 WDR97A6NE52 1622 aa51,71■■■■■ 5,87
C11orf68-202ENST00000449692 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa51,7■■■■■ 5,87
C11orf68-202ENST00000449692 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP51,69■■■■■ 5,87
C11orf68-202ENST00000449692 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP51,69■■■■■ 5,87
C11orf68-202ENST00000449692 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP51,68■■■■■ 5,86
C11orf68-202ENST00000449692 TRIM41Q8WV44 630 aa51,46■■■■■ 5,83
C11orf68-202ENST00000449692 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa51,44■■■■■ 5,83
C11orf68-202ENST00000449692 GAPVD1Q14C86 1478 aa51,43■■■■■ 5,82
C11orf68-202ENST00000449692 GRIN2BQ13224 1484 aa51,33■■■■■ 5,81
C11orf68-202ENST00000449692 PBRM1Q86U86 1689 aa51,26■■■■■ 5,8
C11orf68-202ENST00000449692 CHIC1Q5VXU3 224 aa51,23■■■■■ 5,79
C11orf68-202ENST00000449692 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa51,19■■■■■ 5,79
C11orf68-202ENST00000449692 KIF27Q86VH2 1401 aa51,17■■■■■ 5,78
C11orf68-202ENST00000449692 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP51,14■■■■■ 5,78
C11orf68-202ENST00000449692 ERICH3Q5RHP9 1530 aa51,08■■■■■ 5,77
C11orf68-202ENST00000449692 FBLN2P98095 1184 aa50,94■■■■■ 5,75
C11orf68-202ENST00000449692 IGF1RP08069 1367 aa50,94■■■■■ 5,75
C11orf68-202ENST00000449692 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa50,94■■■■■ 5,74
C11orf68-202ENST00000449692 CHD1O14646 1710 aa50,94■■■■■ 5,74
C11orf68-202ENST00000449692 SYNJ2O15056 1496 aa50,94■■■■■ 5,74
C11orf68-202ENST00000449692 ADAMTS12P58397 1594 aa50,9■■■■■ 5,74
C11orf68-202ENST00000449692 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP50,89■■■■■ 5,74
C11orf68-202ENST00000449692 OSCARQ8IYS5 282 aa50,86■■■■■ 5,73
C11orf68-202ENST00000449692 FHAD1B1AJZ9 1412 aa50,85■■■■■ 5,73
C11orf68-202ENST00000449692 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50,84■■■■■ 5,73
C11orf68-202ENST00000449692 CUL7Q14999 1698 aa50,7■■■■■ 5,71
C11orf68-202ENST00000449692 GRIN2AQ12879 1464 aa50,68■■■■■ 5,7
C11orf68-202ENST00000449692 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa50,62■■■■■ 5,69
C11orf68-202ENST00000449692 EEA1Q15075 1411 aa50,53■■■■■ 5,68
C11orf68-202ENST00000449692 NUP160Q12769 1436 aa50,45■■■■■ 5,67
C11orf68-202ENST00000449692 CSRNP3Q8WYN3 585 aa50,44■■■■■ 5,67
C11orf68-202ENST00000449692 CEP170Q5SW79 1584 aa50,42■■■■■ 5,66
C11orf68-202ENST00000449692 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP50,41■■■■■ 5,66
C11orf68-202ENST00000449692 CLASP1Q7Z460 1538 aa50,4■■■■■ 5,66
C11orf68-202ENST00000449692 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa50,37■■■■■ 5,65
C11orf68-202ENST00000449692 PRXQ9BXM0 1461 aa50,35■■■■■ 5,65
C11orf68-202ENST00000449692 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa50,09■■■■■ 5,61
C11orf68-202ENST00000449692 ARHGEF11O15085 1522 aa50,02■■■■■ 5,6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6,5 ms