RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449692.3

C11orf68-202, Transcript of chromosome 11 open reading frame 68, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene C11orf68, Length 1,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf68-202ENST00000449692 NISCHQ9Y2I1 1504 aa72.57■■■■■ 9.21
C11orf68-202ENST00000449692 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa64.22■■■■■ 7.87
C11orf68-202ENST00000449692 ABCC9O60706 1549 aa62.38■■■■■ 7.58
C11orf68-202ENST00000449692 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP60.57■■■■■ 7.29
C11orf68-202ENST00000449692 DCAF8L2P0C7V8 631 aa60.42■■■■■ 7.26
C11orf68-202ENST00000449692 NACADO15069 1562 aa60.28■■■■■ 7.24
C11orf68-202ENST00000449692 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa60.19■■■■■ 7.23
C11orf68-202ENST00000449692 MYO15BQ96JP2 1530 aa60.1■■■■■ 7.21
C11orf68-202ENST00000449692 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa60.05■■■■■ 7.2
C11orf68-202ENST00000449692 UNC13AQ9UPW8 1703 aa58.88■■■■■ 7.02
C11orf68-202ENST00000449692 SCRIBQ14160 1630 aa58.69■■■■■ 6.99
C11orf68-202ENST00000449692 BICRAQ9NZM4 1560 aa58.42■■■■■ 6.94
C11orf68-202ENST00000449692 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP58.42■■■■■ 6.94
C11orf68-202ENST00000449692 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa57.77■■■■■ 6.84
C11orf68-202ENST00000449692 DNAJC5BQ9UF47 199 aa56.83■■■■■ 6.69
C11orf68-202ENST00000449692 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP56.8■■■■■ 6.68
C11orf68-202ENST00000449692 CECR2Q9BXF3 1484 aa56.51■■■■■ 6.64
C11orf68-202ENST00000449692 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa56.44■■■■■ 6.63
C11orf68-202ENST00000449692 SMARCA4P51532 1647 aa56.19■■■■■ 6.59
C11orf68-202ENST00000449692 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP56.18■■■■■ 6.58
C11orf68-202ENST00000449692 MROH2BQ7Z745 1585 aa55.97■■■■■ 6.55
C11orf68-202ENST00000449692 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa55.76■■■■■ 6.52
C11orf68-202ENST00000449692 SMARCA2P51531 1590 aa55.68■■■■■ 6.5
C11orf68-202ENST00000449692 NCAPD3P42695 1498 aa55.64■■■■■ 6.5
C11orf68-202ENST00000449692 PEG3Q9GZU2 1588 aa55.63■■■■■ 6.5
C11orf68-202ENST00000449692 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP55.53■■■■■ 6.48
C11orf68-202ENST00000449692 HMGXB3Q12766 1538 aa55.38■■■■■ 6.46
C11orf68-202ENST00000449692 WIZO95785 1651 aa55.38■■■■■ 6.46
C11orf68-202ENST00000449692 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP55.3■■■■■ 6.44
C11orf68-202ENST00000449692 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP54.79■■■■■ 6.36
C11orf68-202ENST00000449692 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP54.54■■■■■ 6.32
C11orf68-202ENST00000449692 CCDC88BA6NC98 1476 aa54.19■■■■■ 6.27
C11orf68-202ENST00000449692 NESP48681 1621 aa54.16■■■■■ 6.26
C11orf68-202ENST00000449692 CADPSQ9ULU8 1353 aa54.05■■■■■ 6.24
C11orf68-202ENST00000449692 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa54.05■■■■■ 6.24
C11orf68-202ENST00000449692 CFTRP13569 1480 aa53.85■■■■■ 6.21
C11orf68-202ENST00000449692 PDS5BQ9NTI5 1447 aa53.68■■■■■ 6.18
C11orf68-202ENST00000449692 ERCC6Q03468 1493 aa53.68■■■■■ 6.18
C11orf68-202ENST00000449692 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa53.5■■■■■ 6.15
C11orf68-202ENST00000449692 PRDM2Q13029 1718 aa53.43■■■■■ 6.14
C11orf68-202ENST00000449692 FANCD2Q9BXW9 1451 aa53.42■■■■■ 6.14
C11orf68-202ENST00000449692 CEP164Q9UPV0 1460 aa53.28■■■■■ 6.12
C11orf68-202ENST00000449692 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP53.19■■■■■ 6.1
C11orf68-202ENST00000449692 MRC2Q9UBG0 1479 aa53.1■■■■■ 6.09
C11orf68-202ENST00000449692 CUX2O14529 1486 aa52.91■■■■■ 6.06
C11orf68-202ENST00000449692 WDR62O43379 1518 aa52.91■■■■■ 6.06
C11orf68-202ENST00000449692 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP52.87■■■■■ 6.05
C11orf68-202ENST00000449692 TOPBP1Q92547 1522 aa52.64■■■■■ 6.02
C11orf68-202ENST00000449692 ABCC8Q09428 1581 aa52.62■■■■■ 6.01
C11orf68-202ENST00000449692 DNMBPQ6XZF7 1577 aa52.6■■■■■ 6.01
C11orf68-202ENST00000449692 CUX1P39880 1505 aa52.46■■■■■ 5.99
C11orf68-202ENST00000449692 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP52.31■■■■■ 5.96
C11orf68-202ENST00000449692 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP52.24■■■■■ 5.95
C11orf68-202ENST00000449692 FGD5Q6ZNL6 1462 aa52.18■■■■■ 5.94
C11orf68-202ENST00000449692 SYNJ1O43426 1573 aa52.16■■■■■ 5.94
C11orf68-202ENST00000449692 IFT140Q96RY7 1462 aa52.15■■■■■ 5.94
C11orf68-202ENST00000449692 TOP2BQ02880 1626 aa52.13■■■■■ 5.94
C11orf68-202ENST00000449692 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa52.12■■■■■ 5.93
C11orf68-202ENST00000449692 SOGA1O94964 1423 aa52.03■■■■■ 5.92
C11orf68-202ENST00000449692 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP52.03■■■■■ 5.92
C11orf68-202ENST00000449692 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa52.02■■■■■ 5.92
C11orf68-202ENST00000449692 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP51.91■■■■■ 5.9
C11orf68-202ENST00000449692 WDR97A6NE52 1622 aa51.71■■■■■ 5.87
C11orf68-202ENST00000449692 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa51.7■■■■■ 5.87
C11orf68-202ENST00000449692 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP51.69■■■■■ 5.87
C11orf68-202ENST00000449692 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP51.69■■■■■ 5.87
C11orf68-202ENST00000449692 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP51.68■■■■■ 5.86
C11orf68-202ENST00000449692 TRIM41Q8WV44 630 aa51.46■■■■■ 5.83
C11orf68-202ENST00000449692 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa51.44■■■■■ 5.83
C11orf68-202ENST00000449692 GAPVD1Q14C86 1478 aa51.43■■■■■ 5.82
C11orf68-202ENST00000449692 GRIN2BQ13224 1484 aa51.33■■■■■ 5.81
C11orf68-202ENST00000449692 PBRM1Q86U86 1689 aa51.26■■■■■ 5.8
C11orf68-202ENST00000449692 CHIC1Q5VXU3 224 aa51.23■■■■■ 5.79
C11orf68-202ENST00000449692 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa51.19■■■■■ 5.79
C11orf68-202ENST00000449692 KIF27Q86VH2 1401 aa51.17■■■■■ 5.78
C11orf68-202ENST00000449692 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP51.14■■■■■ 5.78
C11orf68-202ENST00000449692 ERICH3Q5RHP9 1530 aa51.08■■■■■ 5.77
C11orf68-202ENST00000449692 FBLN2P98095 1184 aa50.94■■■■■ 5.75
C11orf68-202ENST00000449692 IGF1RP08069 1367 aa50.94■■■■■ 5.75
C11orf68-202ENST00000449692 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa50.94■■■■■ 5.74
C11orf68-202ENST00000449692 CHD1O14646 1710 aa50.94■■■■■ 5.74
C11orf68-202ENST00000449692 SYNJ2O15056 1496 aa50.94■■■■■ 5.74
C11orf68-202ENST00000449692 ADAMTS12P58397 1594 aa50.9■■■■■ 5.74
C11orf68-202ENST00000449692 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP50.89■■■■■ 5.74
C11orf68-202ENST00000449692 OSCARQ8IYS5 282 aa50.86■■■■■ 5.73
C11orf68-202ENST00000449692 FHAD1B1AJZ9 1412 aa50.85■■■■■ 5.73
C11orf68-202ENST00000449692 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.84■■■■■ 5.73
C11orf68-202ENST00000449692 CUL7Q14999 1698 aa50.7■■■■■ 5.71
C11orf68-202ENST00000449692 GRIN2AQ12879 1464 aa50.68■■■■■ 5.7
C11orf68-202ENST00000449692 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa50.62■■■■■ 5.69
C11orf68-202ENST00000449692 EEA1Q15075 1411 aa50.53■■■■■ 5.68
C11orf68-202ENST00000449692 NUP160Q12769 1436 aa50.45■■■■■ 5.67
C11orf68-202ENST00000449692 CSRNP3Q8WYN3 585 aa50.44■■■■■ 5.67
C11orf68-202ENST00000449692 CEP170Q5SW79 1584 aa50.42■■■■■ 5.66
C11orf68-202ENST00000449692 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP50.41■■■■■ 5.66
C11orf68-202ENST00000449692 CLASP1Q7Z460 1538 aa50.4■■■■■ 5.66
C11orf68-202ENST00000449692 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa50.37■■■■■ 5.65
C11orf68-202ENST00000449692 PRXQ9BXM0 1461 aa50.35■■■■■ 5.65
C11orf68-202ENST00000449692 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa50.09■■■■■ 5.61
C11orf68-202ENST00000449692 ARHGEF11O15085 1522 aa50.02■■■■■ 5.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms