RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553550.5

PRMT5-210, Transcript of protein arginine methyltransferase 5, humanhuman

TSL 3

Gene PRMT5, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRMT5-210ENST00000553550 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.77■■■■■ 6.2
PRMT5-210ENST00000553550 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.16■■■■■ 5.3
PRMT5-210ENST00000553550 ABCC9O60706 1549 aa47.75■■■■■ 5.23
PRMT5-210ENST00000553550 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.65■■■■■ 4.9
PRMT5-210ENST00000553550 NACADO15069 1562 aa45.41■■■■■ 4.86
PRMT5-210ENST00000553550 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.11■■■■■ 4.81
PRMT5-210ENST00000553550 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.93■■■■■ 4.78
PRMT5-210ENST00000553550 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.66■■■■■ 4.74
PRMT5-210ENST00000553550 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.61■■■■■ 4.73
PRMT5-210ENST00000553550 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.47■■■■■ 4.71
PRMT5-210ENST00000553550 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.45■■■■■ 4.71
PRMT5-210ENST00000553550 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.42■■■■■ 4.7
PRMT5-210ENST00000553550 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.3■■■■■ 4.68
PRMT5-210ENST00000553550 SCRIBQ14160 1630 aa43.87■■■■■ 4.61
PRMT5-210ENST00000553550 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.8■■■■■ 4.6
PRMT5-210ENST00000553550 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.19■■■■■ 4.5
PRMT5-210ENST00000553550 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.18■■■■■ 4.5
PRMT5-210ENST00000553550 CECR2Q9BXF3 1484 aa43■■■■■ 4.47
PRMT5-210ENST00000553550 NCAPD3P42695 1498 aa41.9■■■■■ 4.3
PRMT5-210ENST00000553550 SMARCA4P51532 1647 aa41.89■■■■■ 4.3
PRMT5-210ENST00000553550 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.82■■■■■ 4.29
PRMT5-210ENST00000553550 SMARCA2P51531 1590 aa41.76■■■■■ 4.27
PRMT5-210ENST00000553550 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.74■■■■■ 4.27
PRMT5-210ENST00000553550 HMGXB3Q12766 1538 aa41.67■■■■■ 4.26
PRMT5-210ENST00000553550 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.5■■■■■ 4.23
PRMT5-210ENST00000553550 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
PRMT5-210ENST00000553550 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.42■■■■■ 4.22
PRMT5-210ENST00000553550 ERCC6Q03468 1493 aa41.22■■■■■ 4.19
PRMT5-210ENST00000553550 NESP48681 1621 aa41.11■■■■■ 4.17
PRMT5-210ENST00000553550 CUX2O14529 1486 aa41.06■■■■■ 4.16
PRMT5-210ENST00000553550 WIZO95785 1651 aa40.94■■■■■ 4.15
PRMT5-210ENST00000553550 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.93■■■■■ 4.14
PRMT5-210ENST00000553550 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.69■■■■■ 4.11
PRMT5-210ENST00000553550 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.68■■■■■ 4.1
PRMT5-210ENST00000553550 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.66■■■■■ 4.1
PRMT5-210ENST00000553550 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.63■■■■■ 4.1
PRMT5-210ENST00000553550 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.62■■■■■ 4.09
PRMT5-210ENST00000553550 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.56■■■■■ 4.08
PRMT5-210ENST00000553550 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.49■■■■■ 4.07
PRMT5-210ENST00000553550 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.31■■■■■ 4.04
PRMT5-210ENST00000553550 CFTRP13569 1480 aa40.26■■■■■ 4.03
PRMT5-210ENST00000553550 WDR62O43379 1518 aa40.21■■■■■ 4.03
PRMT5-210ENST00000553550 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.21■■■■■ 4.03
PRMT5-210ENST00000553550 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.19■■■■■ 4.02
PRMT5-210ENST00000553550 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.98■■■■□ 3.99
PRMT5-210ENST00000553550 PRDM2Q13029 1718 aa39.93■■■■□ 3.98
PRMT5-210ENST00000553550 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.84■■■■□ 3.97
PRMT5-210ENST00000553550 TOPBP1Q92547 1522 aa39.47■■■■□ 3.91
PRMT5-210ENST00000553550 ABCC8Q09428 1581 aa39.41■■■■□ 3.9
PRMT5-210ENST00000553550 IFT140Q96RY7 1462 aa39.39■■■■□ 3.9
PRMT5-210ENST00000553550 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.38■■■■□ 3.89
PRMT5-210ENST00000553550 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.28■■■■□ 3.88
PRMT5-210ENST00000553550 OSCARQ8IYS5 282 aa39.15■■■■□ 3.86
PRMT5-210ENST00000553550 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.12■■■■□ 3.85
PRMT5-210ENST00000553550 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.11■■■■□ 3.85
PRMT5-210ENST00000553550 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.09■■■■□ 3.85
PRMT5-210ENST00000553550 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.06■■■■□ 3.84
PRMT5-210ENST00000553550 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.94■■■■□ 3.824e-7■■■■■ 27.4
PRMT5-210ENST00000553550 CUX1P39880 1505 aa38.92■■■■□ 3.82
PRMT5-210ENST00000553550 TRIM41Q8WV44 630 aa38.91■■■■□ 3.82
PRMT5-210ENST00000553550 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.91■■■■□ 3.82
PRMT5-210ENST00000553550 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.89■■■■□ 3.82
PRMT5-210ENST00000553550 SOGA1O94964 1423 aa38.88■■■■□ 3.81
PRMT5-210ENST00000553550 WDR97A6NE52 1622 aa38.77■■■■□ 3.8
PRMT5-210ENST00000553550 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.75■■■■□ 3.79
PRMT5-210ENST00000553550 CHD1O14646 1710 aa38.75■■■■□ 3.79
PRMT5-210ENST00000553550 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.68■■■■□ 3.78
PRMT5-210ENST00000553550 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.68■■■■□ 3.78
PRMT5-210ENST00000553550 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.68■■■■□ 3.78
PRMT5-210ENST00000553550 ARHGEF11O15085 1522 aa38.6■■■■□ 3.77
PRMT5-210ENST00000553550 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.6■■■■□ 3.77
PRMT5-210ENST00000553550 FBLN2P98095 1184 aa38.58■■■■□ 3.77
PRMT5-210ENST00000553550 GRIN2BQ13224 1484 aa38.54■■■■□ 3.76
PRMT5-210ENST00000553550 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.53■■■■□ 3.76
PRMT5-210ENST00000553550 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.48■■■■□ 3.75
PRMT5-210ENST00000553550 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.44■■■■□ 3.74
PRMT5-210ENST00000553550 PBRM1Q86U86 1689 aa38.43■■■■□ 3.74
PRMT5-210ENST00000553550 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.41■■■■□ 3.74
PRMT5-210ENST00000553550 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.41■■■■□ 3.74
PRMT5-210ENST00000553550 TOP2BQ02880 1626 aa38.4■■■■□ 3.74
PRMT5-210ENST00000553550 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.38■■■■□ 3.74
PRMT5-210ENST00000553550 SYNJ2O15056 1496 aa38.38■■■■□ 3.73
PRMT5-210ENST00000553550 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.37■■■■□ 3.73
PRMT5-210ENST00000553550 SYNJ1O43426 1573 aa38.36■■■■□ 3.73
PRMT5-210ENST00000553550 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.33■■■■□ 3.73
PRMT5-210ENST00000553550 ARAP1Q96P48 1450 aa38.24■■■■□ 3.71
PRMT5-210ENST00000553550 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.2■■■■□ 3.71
PRMT5-210ENST00000553550 ADAMTS12P58397 1594 aa38.1■■■■□ 3.69
PRMT5-210ENST00000553550 GRIN2AQ12879 1464 aa38.05■■■■□ 3.68
PRMT5-210ENST00000553550 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.02■■■■□ 3.68
PRMT5-210ENST00000553550 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.97■■■■□ 3.67
PRMT5-210ENST00000553550 NUP160Q12769 1436 aa37.91■■■■□ 3.66
PRMT5-210ENST00000553550 CEP170Q5SW79 1584 aa37.9■■■■□ 3.66
PRMT5-210ENST00000553550 SHROOM2Q13796 1616 aa37.72■■■■□ 3.63
PRMT5-210ENST00000553550 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.72■■■■□ 3.63
PRMT5-210ENST00000553550 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.66■■■■□ 3.62
PRMT5-210ENST00000553550 KIF27Q86VH2 1401 aa37.63■■■■□ 3.61
PRMT5-210ENST00000553550 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.57■■■■□ 3.61
PRMT5-210ENST00000553550 CUL7Q14999 1698 aa37.55■■■■□ 3.6
PRMT5-210ENST00000553550 IGF1RP08069 1367 aa37.55■■■■□ 3.6
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