RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CS-204ENST00000546621 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
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CS-204ENST00000546621 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP13.17□□□□□ -0.33e-7■■□□□ 13.9
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CS-204ENST00000546621 CADPSQ9ULU8 1353 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-204ENST00000546621 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa12.42□□□□□ -0.42
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CS-204ENST00000546621 HRCP23327 699 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-204ENST00000546621 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa12.38□□□□□ -0.43
CS-204ENST00000546621 CUX1P39880 1505 aa12.37□□□□□ -0.43
CS-204ENST00000546621 EHMT2Q96KQ7 1210 aa12.36□□□□□ -0.43
CS-204ENST00000546621 CSRNP3Q8WYN3 585 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-204ENST00000546621 FANCD2Q9BXW9 1451 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-204ENST00000546621 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-204ENST00000546621 KIF21BO75037 1637 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-204ENST00000546621 GOLGA3Q08378 1498 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-204ENST00000546621 NESP48681 1621 aa12.28□□□□□ -0.44
CS-204ENST00000546621 CEP164Q9UPV0 1460 aa12.27□□□□□ -0.44
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CS-204ENST00000546621 CEP162Q5TB80 1403 aa12.22□□□□□ -0.45
CS-204ENST00000546621 RNF39Q9H2S5 420 aa12.21□□□□□ -0.45
CS-204ENST00000546621 FGD5Q6ZNL6 1462 aa12.21□□□□□ -0.45
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CS-204ENST00000546621 TOPBP1Q92547 1522 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-204ENST00000546621 ERICH3Q5RHP9 1530 aa12.18□□□□□ -0.46
CS-204ENST00000546621 PRXQ9BXM0 1461 aa12.17□□□□□ -0.46
CS-204ENST00000546621 CUX2O14529 1486 aa12.16□□□□□ -0.46
CS-204ENST00000546621 PCGF6Q9BYE7 350 aa12.15□□□□□ -0.46
CS-204ENST00000546621 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa12.14□□□□□ -0.47
CS-204ENST00000546621 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP12.14□□□□□ -0.47
CS-204ENST00000546621 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
CS-204ENST00000546621 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
CS-204ENST00000546621 NPM3O75607 178 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
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