RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.78■■■■■ 4.6
CS-219ENST00000550655 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.13■■■■□ 3.85
CS-219ENST00000550655 ABCC9O60706 1549 aa38.36■■■■□ 3.73
CS-219ENST00000550655 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.85■■■■□ 3.49
CS-219ENST00000550655 NACADO15069 1562 aa36.75■■■■□ 3.47
CS-219ENST00000550655 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.47■■■■□ 3.43
CS-219ENST00000550655 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.46■■■■□ 3.43
CS-219ENST00000550655 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.44■■■■□ 3.42
CS-219ENST00000550655 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.24■■■■□ 3.39
CS-219ENST00000550655 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.17■■■■□ 3.38
CS-219ENST00000550655 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.81■■■■□ 3.32
CS-219ENST00000550655 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.72■■■■□ 3.312e-8■■■□□ 14.8
CS-219ENST00000550655 SCRIBQ14160 1630 aa35.63■■■■□ 3.29
CS-219ENST00000550655 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.36■■■■□ 3.25
CS-219ENST00000550655 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.36■■■■□ 3.25
CS-219ENST00000550655 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.84■■■■□ 3.17
CS-219ENST00000550655 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.76■■■■□ 3.15
CS-219ENST00000550655 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.49■■■■□ 3.11
CS-219ENST00000550655 SMARCA4P51532 1647 aa34.08■■■■□ 3.05
CS-219ENST00000550655 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.95■■■■□ 3.03
CS-219ENST00000550655 NCAPD3P42695 1498 aa33.88■■■■□ 3.01
CS-219ENST00000550655 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.88■■■■□ 3.01
CS-219ENST00000550655 SMARCA2P51531 1590 aa33.84■■■■□ 3.01
CS-219ENST00000550655 HMGXB3Q12766 1538 aa33.76■■■■□ 3
CS-219ENST00000550655 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.76■■■□□ 2.99
CS-219ENST00000550655 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.75■■■□□ 2.99
CS-219ENST00000550655 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.57■■■□□ 2.97
CS-219ENST00000550655 WIZO95785 1651 aa33.42■■■□□ 2.94
CS-219ENST00000550655 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.24■■■□□ 2.91
CS-219ENST00000550655 NESP48681 1621 aa33.17■■■□□ 2.9
CS-219ENST00000550655 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.07■■■□□ 2.88
CS-219ENST00000550655 ERCC6Q03468 1493 aa33.05■■■□□ 2.88
CS-219ENST00000550655 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.02■■■□□ 2.88
CS-219ENST00000550655 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.87■■■□□ 2.85
CS-219ENST00000550655 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.83■■■□□ 2.85
CS-219ENST00000550655 CUX2O14529 1486 aa32.83■■■□□ 2.85
CS-219ENST00000550655 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.8■■■□□ 2.84
CS-219ENST00000550655 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.76■■■□□ 2.83
CS-219ENST00000550655 CFTRP13569 1480 aa32.65■■■□□ 2.82
CS-219ENST00000550655 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.58■■■□□ 2.81
CS-219ENST00000550655 PRDM2Q13029 1718 aa32.56■■■□□ 2.8
CS-219ENST00000550655 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.5■■■□□ 2.79
CS-219ENST00000550655 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.5■■■□□ 2.79
CS-219ENST00000550655 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.49■■■□□ 2.79
CS-219ENST00000550655 WDR62O43379 1518 aa32.46■■■□□ 2.79
CS-219ENST00000550655 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
CS-219ENST00000550655 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.09■■■□□ 2.73
CS-219ENST00000550655 TOPBP1Q92547 1522 aa31.99■■■□□ 2.71
CS-219ENST00000550655 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.98■■■□□ 2.71
CS-219ENST00000550655 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.96■■■□□ 2.71
CS-219ENST00000550655 ABCC8Q09428 1581 aa31.91■■■□□ 2.7
CS-219ENST00000550655 IFT140Q96RY7 1462 aa31.8■■■□□ 2.68
CS-219ENST00000550655 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
CS-219ENST00000550655 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.71■■■□□ 2.67
CS-219ENST00000550655 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.66
CS-219ENST00000550655 CUX1P39880 1505 aa31.69■■■□□ 2.66
CS-219ENST00000550655 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
CS-219ENST00000550655 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.59■■■□□ 2.65
CS-219ENST00000550655 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.53■■■□□ 2.64
CS-219ENST00000550655 SOGA1O94964 1423 aa31.49■■■□□ 2.63
CS-219ENST00000550655 WDR97A6NE52 1622 aa31.48■■■□□ 2.63
CS-219ENST00000550655 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.46■■■□□ 2.632e-12■■■■□ 25.6
CS-219ENST00000550655 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.42■■■□□ 2.62
CS-219ENST00000550655 SYNJ1O43426 1573 aa31.37■■■□□ 2.61
CS-219ENST00000550655 TOP2BQ02880 1626 aa31.37■■■□□ 2.61
CS-219ENST00000550655 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.33■■■□□ 2.61
CS-219ENST00000550655 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.32■■■□□ 2.61
CS-219ENST00000550655 CHD1O14646 1710 aa31.32■■■□□ 2.61
CS-219ENST00000550655 OSCARQ8IYS5 282 aa31.29■■■□□ 2.6
CS-219ENST00000550655 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.27■■■□□ 2.6
CS-219ENST00000550655 PBRM1Q86U86 1689 aa31.25■■■□□ 2.59
CS-219ENST00000550655 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.25■■■□□ 2.59
CS-219ENST00000550655 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.21■■■□□ 2.59
CS-219ENST00000550655 GRIN2BQ13224 1484 aa31.19■■■□□ 2.58
CS-219ENST00000550655 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.15■■■□□ 2.58
CS-219ENST00000550655 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
CS-219ENST00000550655 SYNJ2O15056 1496 aa31.02■■■□□ 2.56
CS-219ENST00000550655 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.02■■■□□ 2.56
CS-219ENST00000550655 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.02■■■□□ 2.56
CS-219ENST00000550655 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.02■■■□□ 2.56
CS-219ENST00000550655 FBLN2P98095 1184 aa31■■■□□ 2.55
CS-219ENST00000550655 ADAMTS12P58397 1594 aa30.95■■■□□ 2.54
CS-219ENST00000550655 ARHGEF11O15085 1522 aa30.94■■■□□ 2.54
CS-219ENST00000550655 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.94■■■□□ 2.54
CS-219ENST00000550655 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.9■■■□□ 2.54
CS-219ENST00000550655 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
CS-219ENST00000550655 GRIN2AQ12879 1464 aa30.82■■■□□ 2.52
CS-219ENST00000550655 TRIM41Q8WV44 630 aa30.8■■■□□ 2.52
CS-219ENST00000550655 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.78■■■□□ 2.52
CS-219ENST00000550655 CEP170Q5SW79 1584 aa30.73■■■□□ 2.51
CS-219ENST00000550655 NUP160Q12769 1436 aa30.69■■■□□ 2.5
CS-219ENST00000550655 ARAP1Q96P48 1450 aa30.69■■■□□ 2.5
CS-219ENST00000550655 KIF27Q86VH2 1401 aa30.66■■■□□ 2.5
CS-219ENST00000550655 CUL7Q14999 1698 aa30.62■■■□□ 2.49
CS-219ENST00000550655 SHROOM2Q13796 1616 aa30.57■■■□□ 2.48
CS-219ENST00000550655 IGF1RP08069 1367 aa30.56■■■□□ 2.48
CS-219ENST00000550655 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.52■■■□□ 2.48
CS-219ENST00000550655 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.51■■■□□ 2.47
CS-219ENST00000550655 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.49■■■□□ 2.47
CS-219ENST00000550655 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.37■■■□□ 2.45
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