Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
KDM2AQ9Y2K7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
KDM2AQ9Y2K7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
KDM2AQ9Y2K7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
KDM2AQ9Y2K7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
KDM2AQ9Y2K7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
KDM2AQ9Y2K7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
KDM2AQ9Y2K7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
KDM2AQ9Y2K7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
KDM2AQ9Y2K7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
KDM2AQ9Y2K7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
KDM2AQ9Y2K7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
KDM2AQ9Y2K7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
KDM2AQ9Y2K7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
KDM2AQ9Y2K7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
KDM2AQ9Y2K7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
KDM2AQ9Y2K7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
KDM2AQ9Y2K7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
KDM2AQ9Y2K7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
KDM2AQ9Y2K7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
KDM2AQ9Y2K7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
KDM2AQ9Y2K7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
KDM2AQ9Y2K7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
KDM2AQ9Y2K7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
KDM2AQ9Y2K7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
KDM2AQ9Y2K7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
KDM2AQ9Y2K7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
KDM2AQ9Y2K7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
KDM2AQ9Y2K7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
KDM2AQ9Y2K7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
KDM2AQ9Y2K7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
KDM2AQ9Y2K7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
KDM2AQ9Y2K7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
KDM2AQ9Y2K7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
KDM2AQ9Y2K7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
KDM2AQ9Y2K7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
KDM2AQ9Y2K7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
KDM2AQ9Y2K7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
KDM2AQ9Y2K7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
KDM2AQ9Y2K7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
KDM2AQ9Y2K7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
KDM2AQ9Y2K7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
KDM2AQ9Y2K7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
KDM2AQ9Y2K7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
KDM2AQ9Y2K7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
KDM2AQ9Y2K7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
KDM2AQ9Y2K7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
KDM2AQ9Y2K7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
KDM2AQ9Y2K7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
KDM2AQ9Y2K7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
KDM2AQ9Y2K7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
KDM2AQ9Y2K7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
KDM2AQ9Y2K7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
KDM2AQ9Y2K7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
KDM2AQ9Y2K7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
KDM2AQ9Y2K7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
KDM2AQ9Y2K7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
KDM2AQ9Y2K7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
KDM2AQ9Y2K7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
KDM2AQ9Y2K7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
KDM2AQ9Y2K7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
KDM2AQ9Y2K7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
KDM2AQ9Y2K7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
KDM2AQ9Y2K7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
KDM2AQ9Y2K7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
KDM2AQ9Y2K7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
KDM2AQ9Y2K7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
KDM2AQ9Y2K7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
KDM2AQ9Y2K7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
KDM2AQ9Y2K7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
KDM2AQ9Y2K7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
KDM2AQ9Y2K7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
KDM2AQ9Y2K7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
KDM2AQ9Y2K7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
KDM2AQ9Y2K7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
KDM2AQ9Y2K7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
KDM2AQ9Y2K7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
KDM2AQ9Y2K7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
KDM2AQ9Y2K7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
KDM2AQ9Y2K7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
KDM2AQ9Y2K7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
KDM2AQ9Y2K7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
KDM2AQ9Y2K7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
KDM2AQ9Y2K7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
KDM2AQ9Y2K7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
KDM2AQ9Y2K7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
KDM2AQ9Y2K7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
KDM2AQ9Y2K7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
KDM2AQ9Y2K7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
KDM2AQ9Y2K7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
KDM2AQ9Y2K7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
KDM2AQ9Y2K7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
KDM2AQ9Y2K7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
KDM2AQ9Y2K7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
KDM2AQ9Y2K7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
KDM2AQ9Y2K7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms