RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369875.3

CNNM2-201, Transcript of cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CNNM2, Length 2,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM2-201ENST00000369875 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.2■■■■■ 6.43
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CNNM2-201ENST00000369875 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.5■■■■■ 4.87
CNNM2-201ENST00000369875 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.49■■■■■ 4.87
CNNM2-201ENST00000369875 ABCC9O60706 1549 aa45.43■■■■■ 4.86
CNNM2-201ENST00000369875 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.83■■■■■ 4.77
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CNNM2-201ENST00000369875 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.25■■■■■ 4.67
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CNNM2-201ENST00000369875 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.94■■■■■ 4.46
CNNM2-201ENST00000369875 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.73■■■■■ 4.43
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CNNM2-201ENST00000369875 SMARCA4P51532 1647 aa42.41■■■■■ 4.38
CNNM2-201ENST00000369875 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.94■■■■■ 4.3
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CNNM2-201ENST00000369875 SMARCA2P51531 1590 aa41.6■■■■■ 4.25
CNNM2-201ENST00000369875 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.53■■■■■ 4.24
CNNM2-201ENST00000369875 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.49■■■■■ 4.23
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CNNM2-201ENST00000369875 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.02■■■■■ 4.16
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CNNM2-201ENST00000369875 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.48■■■■■ 4.07
CNNM2-201ENST00000369875 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.44■■■■■ 4.06
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CNNM2-201ENST00000369875 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.24■■■■■ 4.03
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CNNM2-201ENST00000369875 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.25■■■■□ 3.87
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CNNM2-201ENST00000369875 IGF1RP08069 1367 aa39.02■■■■□ 3.84
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CNNM2-201ENST00000369875 PCGF6Q9BYE7 350 aa38.85■■■■□ 3.81
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CNNM2-201ENST00000369875 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.82■■■■□ 3.8
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CNNM2-201ENST00000369875 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.62■■■■□ 3.77
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CNNM2-201ENST00000369875 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.52■■■■□ 3.76
CNNM2-201ENST00000369875 VPS8Q8N3P4 1428 aa38.48■■■■□ 3.75
CNNM2-201ENST00000369875 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.45■■■■□ 3.75
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CNNM2-201ENST00000369875 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP38.4■■■■□ 3.74
CNNM2-201ENST00000369875 ARAP1Q96P48 1450 aa38.4■■■■□ 3.74
CNNM2-201ENST00000369875 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa38.36■■■■□ 3.73
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CNNM2-201ENST00000369875 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.27■■■■□ 3.72
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