RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570388.5

PCYT2-204, Transcript of phosphate cytidylyltransferase 2, ethanolamine, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PCYT2, Length 1,474 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCYT2-204ENST00000570388 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.67■■■■■ 6.82
PCYT2-204ENST00000570388 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.29■■■■■ 5.8
PCYT2-204ENST00000570388 ABCC9O60706 1549 aa50■■■■■ 5.6
PCYT2-204ENST00000570388 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.21■■■■■ 5.31
PCYT2-204ENST00000570388 NACADO15069 1562 aa48.19■■■■■ 5.3
PCYT2-204ENST00000570388 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.1■■■■■ 5.29
PCYT2-204ENST00000570388 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.05■■■■■ 5.28
PCYT2-204ENST00000570388 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.95■■■■■ 5.27
PCYT2-204ENST00000570388 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.76■■■■■ 5.24
PCYT2-204ENST00000570388 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.13■■■■■ 5.14
PCYT2-204ENST00000570388 SCRIBQ14160 1630 aa46.72■■■■■ 5.07
PCYT2-204ENST00000570388 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.72■■■■■ 5.071e-7■■□□□ 12.9
PCYT2-204ENST00000570388 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.72■■■■■ 5.07
PCYT2-204ENST00000570388 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.3■■■■■ 5
PCYT2-204ENST00000570388 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.8■■■■■ 4.92
PCYT2-204ENST00000570388 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.48■■■■■ 4.87
PCYT2-204ENST00000570388 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.28■■■■■ 4.84
PCYT2-204ENST00000570388 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.94■■■■■ 4.79
PCYT2-204ENST00000570388 SMARCA4P51532 1647 aa44.74■■■■■ 4.75
PCYT2-204ENST00000570388 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.71■■■■■ 4.75
PCYT2-204ENST00000570388 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.46■■■■■ 4.71
PCYT2-204ENST00000570388 SMARCA2P51531 1590 aa44.45■■■■■ 4.71
PCYT2-204ENST00000570388 NCAPD3P42695 1498 aa44.44■■■■■ 4.71
PCYT2-204ENST00000570388 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.42■■■■■ 4.7
PCYT2-204ENST00000570388 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.33■■■■■ 4.69
PCYT2-204ENST00000570388 HMGXB3Q12766 1538 aa44.24■■■■■ 4.67
PCYT2-204ENST00000570388 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.1■■■■■ 4.65
PCYT2-204ENST00000570388 WIZO95785 1651 aa43.96■■■■■ 4.63
PCYT2-204ENST00000570388 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.95■■■■■ 4.63
PCYT2-204ENST00000570388 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.57■■■■■ 4.57
PCYT2-204ENST00000570388 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.51■■■■■ 4.56
PCYT2-204ENST00000570388 NESP48681 1621 aa43.29■■■■■ 4.52
PCYT2-204ENST00000570388 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.28■■■■■ 4.52
PCYT2-204ENST00000570388 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.14■■■■■ 4.5
PCYT2-204ENST00000570388 ERCC6Q03468 1493 aa43.12■■■■■ 4.49
PCYT2-204ENST00000570388 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.98■■■■■ 4.47
PCYT2-204ENST00000570388 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.97■■■■■ 4.47
PCYT2-204ENST00000570388 CFTRP13569 1480 aa42.9■■■■■ 4.46
PCYT2-204ENST00000570388 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.83■■■■■ 4.45
PCYT2-204ENST00000570388 CUX2O14529 1486 aa42.67■■■■■ 4.42
PCYT2-204ENST00000570388 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.66■■■■■ 4.42
PCYT2-204ENST00000570388 PRDM2Q13029 1718 aa42.66■■■■■ 4.42
PCYT2-204ENST00000570388 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.64■■■■■ 4.42
PCYT2-204ENST00000570388 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.58■■■■■ 4.41
PCYT2-204ENST00000570388 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.5■■■■■ 4.39
PCYT2-204ENST00000570388 WDR62O43379 1518 aa42.37■■■■■ 4.37
PCYT2-204ENST00000570388 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.19■■■■■ 4.34
PCYT2-204ENST00000570388 ABCC8Q09428 1581 aa42.03■■■■■ 4.32
PCYT2-204ENST00000570388 TOPBP1Q92547 1522 aa41.97■■■■■ 4.31
PCYT2-204ENST00000570388 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.94■■■■■ 4.31
PCYT2-204ENST00000570388 IFT140Q96RY7 1462 aa41.7■■■■■ 4.27
PCYT2-204ENST00000570388 CUX1P39880 1505 aa41.66■■■■■ 4.26
PCYT2-204ENST00000570388 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.61■■■■■ 4.25
PCYT2-204ENST00000570388 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.52■■■■■ 4.24
PCYT2-204ENST00000570388 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
PCYT2-204ENST00000570388 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.45■■■■■ 4.23
PCYT2-204ENST00000570388 SOGA1O94964 1423 aa41.45■■■■■ 4.23
PCYT2-204ENST00000570388 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.45■■■■■ 4.23
PCYT2-204ENST00000570388 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.4■■■■■ 4.22
PCYT2-204ENST00000570388 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.38■■■■■ 4.21
PCYT2-204ENST00000570388 TOP2BQ02880 1626 aa41.37■■■■■ 4.21
PCYT2-204ENST00000570388 SYNJ1O43426 1573 aa41.34■■■■■ 4.21
PCYT2-204ENST00000570388 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
PCYT2-204ENST00000570388 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.3■■■■■ 4.2
PCYT2-204ENST00000570388 WDR97A6NE52 1622 aa41.25■■■■■ 4.19
PCYT2-204ENST00000570388 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.24■■■■■ 4.19
PCYT2-204ENST00000570388 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.24■■■■■ 4.193e-8■■■■■ 34.6
PCYT2-204ENST00000570388 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
PCYT2-204ENST00000570388 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.15■■■■■ 4.18
PCYT2-204ENST00000570388 TRIM41Q8WV44 630 aa41.06■■■■■ 4.16
PCYT2-204ENST00000570388 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.98■■■■■ 4.15
PCYT2-204ENST00000570388 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.98■■■■■ 4.15
PCYT2-204ENST00000570388 GRIN2BQ13224 1484 aa40.97■■■■■ 4.15
PCYT2-204ENST00000570388 PBRM1Q86U86 1689 aa40.91■■■■■ 4.14
PCYT2-204ENST00000570388 OSCARQ8IYS5 282 aa40.91■■■■■ 4.14
PCYT2-204ENST00000570388 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.87■■■■■ 4.13
PCYT2-204ENST00000570388 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.86■■■■■ 4.13
PCYT2-204ENST00000570388 CHD1O14646 1710 aa40.81■■■■■ 4.12
PCYT2-204ENST00000570388 FBLN2P98095 1184 aa40.73■■■■■ 4.11
PCYT2-204ENST00000570388 SYNJ2O15056 1496 aa40.69■■■■■ 4.1
PCYT2-204ENST00000570388 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.67■■■■■ 4.1
PCYT2-204ENST00000570388 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
PCYT2-204ENST00000570388 KIF27Q86VH2 1401 aa40.59■■■■■ 4.09
PCYT2-204ENST00000570388 ADAMTS12P58397 1594 aa40.57■■■■■ 4.08
PCYT2-204ENST00000570388 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.51■■■■■ 4.08
PCYT2-204ENST00000570388 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.48■■■■■ 4.07
PCYT2-204ENST00000570388 GRIN2AQ12879 1464 aa40.43■■■■■ 4.06
PCYT2-204ENST00000570388 IGF1RP08069 1367 aa40.39■■■■■ 4.06
PCYT2-204ENST00000570388 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.36■■■■■ 4.05
PCYT2-204ENST00000570388 CUL7Q14999 1698 aa40.33■■■■■ 4.05
PCYT2-204ENST00000570388 EEA1Q15075 1411 aa40.32■■■■■ 4.04
PCYT2-204ENST00000570388 NUP160Q12769 1436 aa40.25■■■■■ 4.03
PCYT2-204ENST00000570388 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.25■■■■■ 4.03
PCYT2-204ENST00000570388 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.23■■■■■ 4.03
PCYT2-204ENST00000570388 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.23■■■■■ 4.03
PCYT2-204ENST00000570388 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.23■■■■■ 4.03
PCYT2-204ENST00000570388 ARHGEF11O15085 1522 aa40.23■■■■■ 4.03
PCYT2-204ENST00000570388 CEP170Q5SW79 1584 aa40.22■■■■■ 4.03
PCYT2-204ENST00000570388 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.17■■■■■ 4.02
PCYT2-204ENST00000570388 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.07■■■■■ 4.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms