RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444469.3

TMEM238-201, Transcript of transmembrane protein 238, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM238, Length 1,000 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM238-201ENST00000444469 NISCHQ9Y2I1 1504 aa58.59■■■■■ 6.97
TMEM238-201ENST00000444469 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.49■■■■■ 5.99
TMEM238-201ENST00000444469 ABCC9O60706 1549 aa52.25■■■■■ 5.95
TMEM238-201ENST00000444469 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.89■■■■■ 5.58
TMEM238-201ENST00000444469 NACADO15069 1562 aa49.58■■■■■ 5.53
TMEM238-201ENST00000444469 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.53■■■■■ 5.52
TMEM238-201ENST00000444469 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.94■■■■■ 5.43
TMEM238-201ENST00000444469 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.68■■■■■ 5.38
TMEM238-201ENST00000444469 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.61■■■■■ 5.37
TMEM238-201ENST00000444469 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.6■■■■■ 5.37
TMEM238-201ENST00000444469 UNC13AQ9UPW8 1703 aa48.59■■■■■ 5.37
TMEM238-201ENST00000444469 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.41■■■■■ 5.34
TMEM238-201ENST00000444469 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.26■■■■■ 5.32
TMEM238-201ENST00000444469 SCRIBQ14160 1630 aa47.87■■■■■ 5.25
TMEM238-201ENST00000444469 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa47.79■■■■■ 5.24
TMEM238-201ENST00000444469 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.17■■■■■ 5.14
TMEM238-201ENST00000444469 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.15■■■■■ 5.14
TMEM238-201ENST00000444469 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.05■■■■■ 5.12
TMEM238-201ENST00000444469 NCAPD3P42695 1498 aa45.72■■■■■ 4.91
TMEM238-201ENST00000444469 SMARCA4P51532 1647 aa45.66■■■■■ 4.9
TMEM238-201ENST00000444469 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.62■■■■■ 4.89
TMEM238-201ENST00000444469 SMARCA2P51531 1590 aa45.59■■■■■ 4.89
TMEM238-201ENST00000444469 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.54■■■■■ 4.88
TMEM238-201ENST00000444469 HMGXB3Q12766 1538 aa45.44■■■■■ 4.86
TMEM238-201ENST00000444469 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.29■■■■■ 4.84
TMEM238-201ENST00000444469 ERCC6Q03468 1493 aa45.21■■■■■ 4.83
TMEM238-201ENST00000444469 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.17■■■■■ 4.82
TMEM238-201ENST00000444469 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.12■■■■■ 4.81
TMEM238-201ENST00000444469 CUX2O14529 1486 aa44.94■■■■■ 4.78
TMEM238-201ENST00000444469 NESP48681 1621 aa44.9■■■■■ 4.78
TMEM238-201ENST00000444469 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.71■■■■■ 4.75
TMEM238-201ENST00000444469 WIZO95785 1651 aa44.61■■■■■ 4.73
TMEM238-201ENST00000444469 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.55■■■■■ 4.72
TMEM238-201ENST00000444469 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.5■■■■■ 4.71
TMEM238-201ENST00000444469 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.39■■■■■ 4.7
TMEM238-201ENST00000444469 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.39■■■■■ 4.7
TMEM238-201ENST00000444469 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.34■■■■■ 4.69
TMEM238-201ENST00000444469 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.3■■■■■ 4.68
TMEM238-201ENST00000444469 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.12■■■■■ 4.65
TMEM238-201ENST00000444469 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.05■■■■■ 4.64
TMEM238-201ENST00000444469 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.96■■■■■ 4.63
TMEM238-201ENST00000444469 CFTRP13569 1480 aa43.9■■■■■ 4.62
TMEM238-201ENST00000444469 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.9■■■■■ 4.62
TMEM238-201ENST00000444469 WDR62O43379 1518 aa43.88■■■■■ 4.61
TMEM238-201ENST00000444469 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.58■■■■■ 4.57
TMEM238-201ENST00000444469 PRDM2Q13029 1718 aa43.5■■■■■ 4.55
TMEM238-201ENST00000444469 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.45■■■■■ 4.55
TMEM238-201ENST00000444469 ABCC8Q09428 1581 aa43.08■■■■■ 4.49
TMEM238-201ENST00000444469 TOPBP1Q92547 1522 aa43.07■■■■■ 4.48
TMEM238-201ENST00000444469 IFT140Q96RY7 1462 aa43.06■■■■■ 4.48
TMEM238-201ENST00000444469 OSCARQ8IYS5 282 aa42.98■■■■■ 4.47
TMEM238-201ENST00000444469 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.96■■■■■ 4.47
TMEM238-201ENST00000444469 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.87■■■■■ 4.45
TMEM238-201ENST00000444469 TRIM41Q8WV44 630 aa42.84■■■■■ 4.45
TMEM238-201ENST00000444469 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.7■■■■■ 4.43
TMEM238-201ENST00000444469 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP42.69■■■■■ 4.43
TMEM238-201ENST00000444469 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.64■■■■■ 4.42
TMEM238-201ENST00000444469 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.61■■■■■ 4.41
TMEM238-201ENST00000444469 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.55■■■■■ 4.4
TMEM238-201ENST00000444469 SOGA1O94964 1423 aa42.51■■■■■ 4.4
TMEM238-201ENST00000444469 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.47■■■■■ 4.39
TMEM238-201ENST00000444469 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.44■■■■■ 4.38
TMEM238-201ENST00000444469 CUX1P39880 1505 aa42.39■■■■■ 4.38
TMEM238-201ENST00000444469 FBLN2P98095 1184 aa42.37■■■■■ 4.37
TMEM238-201ENST00000444469 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
TMEM238-201ENST00000444469 CHD1O14646 1710 aa42.31■■■■■ 4.36
TMEM238-201ENST00000444469 WDR97A6NE52 1622 aa42.3■■■■■ 4.36
TMEM238-201ENST00000444469 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.3■■■■■ 4.36
TMEM238-201ENST00000444469 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.3■■■■■ 4.36
TMEM238-201ENST00000444469 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.3■■■■■ 4.36
TMEM238-201ENST00000444469 ARHGEF11O15085 1522 aa42.21■■■■■ 4.35
TMEM238-201ENST00000444469 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.17■■■■■ 4.34
TMEM238-201ENST00000444469 GRIN2BQ13224 1484 aa42.12■■■■■ 4.33
TMEM238-201ENST00000444469 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.09■■■■■ 4.33
TMEM238-201ENST00000444469 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.08■■■■■ 4.33
TMEM238-201ENST00000444469 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.99■■■■■ 4.31
TMEM238-201ENST00000444469 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.95■■■■■ 4.31
TMEM238-201ENST00000444469 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.95■■■■■ 4.31
TMEM238-201ENST00000444469 SYNJ2O15056 1496 aa41.93■■■■■ 4.3
TMEM238-201ENST00000444469 PBRM1Q86U86 1689 aa41.93■■■■■ 4.3
TMEM238-201ENST00000444469 SYNJ1O43426 1573 aa41.93■■■■■ 4.3
TMEM238-201ENST00000444469 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.92■■■■■ 4.3
TMEM238-201ENST00000444469 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.84■■■■■ 4.29
TMEM238-201ENST00000444469 TOP2BQ02880 1626 aa41.82■■■■■ 4.29
TMEM238-201ENST00000444469 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.81■■■■■ 4.28
TMEM238-201ENST00000444469 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.8■■■■■ 4.28
TMEM238-201ENST00000444469 ARAP1Q96P48 1450 aa41.79■■■■■ 4.28
TMEM238-201ENST00000444469 GRIN2AQ12879 1464 aa41.54■■■■■ 4.24
TMEM238-201ENST00000444469 ADAMTS12P58397 1594 aa41.54■■■■■ 4.24
TMEM238-201ENST00000444469 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.49■■■■■ 4.23
TMEM238-201ENST00000444469 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.48■■■■■ 4.23
TMEM238-201ENST00000444469 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.46■■■■■ 4.23
TMEM238-201ENST00000444469 NUP160Q12769 1436 aa41.35■■■■■ 4.21
TMEM238-201ENST00000444469 CEP170Q5SW79 1584 aa41.33■■■■■ 4.21
TMEM238-201ENST00000444469 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.14■■■■■ 4.18
TMEM238-201ENST00000444469 SHROOM2Q13796 1616 aa41.11■■■■■ 4.17
TMEM238-201ENST00000444469 KIF27Q86VH2 1401 aa41.1■■■■■ 4.17
TMEM238-201ENST00000444469 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41■■■■■ 4.15
TMEM238-201ENST00000444469 JPH4Q96JJ6 628 aa40.99■■■■■ 4.15
TMEM238-201ENST00000444469 CUL7Q14999 1698 aa40.95■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms