RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410062.8

UBE2E3-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-202ENST00000410062 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.58■■■■■ 6.81
UBE2E3-202ENST00000410062 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.06■■■■■ 5.76
UBE2E3-202ENST00000410062 ABCC9O60706 1549 aa49.88■■■■■ 5.58
UBE2E3-202ENST00000410062 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.13■■■■■ 5.3
UBE2E3-202ENST00000410062 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48■■■■■ 5.27
UBE2E3-202ENST00000410062 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.99■■■■■ 5.27
UBE2E3-202ENST00000410062 NACADO15069 1562 aa47.97■■■■■ 5.27
UBE2E3-202ENST00000410062 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.7■■■■■ 5.23
UBE2E3-202ENST00000410062 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.59■■■■■ 5.21
UBE2E3-202ENST00000410062 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.96■■■■■ 5.11
UBE2E3-202ENST00000410062 SCRIBQ14160 1630 aa46.7■■■■■ 5.07
UBE2E3-202ENST00000410062 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.68■■■■■ 5.06
UBE2E3-202ENST00000410062 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.57■■■■■ 5.05
UBE2E3-202ENST00000410062 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.99■■■■■ 4.95
UBE2E3-202ENST00000410062 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.63■■■■■ 4.9
UBE2E3-202ENST00000410062 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.32■■■■■ 4.84
UBE2E3-202ENST00000410062 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.1■■■■■ 4.81
UBE2E3-202ENST00000410062 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.88■■■■■ 4.78
UBE2E3-202ENST00000410062 SMARCA4P51532 1647 aa44.65■■■■■ 4.74
UBE2E3-202ENST00000410062 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.6■■■■■ 4.73
UBE2E3-202ENST00000410062 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.41■■■■■ 4.7
UBE2E3-202ENST00000410062 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.35■■■■■ 4.69
UBE2E3-202ENST00000410062 SMARCA2P51531 1590 aa44.27■■■■■ 4.68
UBE2E3-202ENST00000410062 NCAPD3P42695 1498 aa44.27■■■■■ 4.68
UBE2E3-202ENST00000410062 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.16■■■■■ 4.66
UBE2E3-202ENST00000410062 HMGXB3Q12766 1538 aa44.06■■■■■ 4.64
UBE2E3-202ENST00000410062 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44■■■■■ 4.63
UBE2E3-202ENST00000410062 WIZO95785 1651 aa43.97■■■■■ 4.63
UBE2E3-202ENST00000410062 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.96■■■■■ 4.63
UBE2E3-202ENST00000410062 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.46■■■■■ 4.55
UBE2E3-202ENST00000410062 NESP48681 1621 aa43.23■■■■■ 4.51
UBE2E3-202ENST00000410062 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.07■■■■■ 4.49
UBE2E3-202ENST00000410062 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.07■■■■■ 4.49
UBE2E3-202ENST00000410062 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.01■■■■■ 4.48
UBE2E3-202ENST00000410062 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.97■■■■■ 4.47
UBE2E3-202ENST00000410062 ERCC6Q03468 1493 aa42.95■■■■■ 4.47
UBE2E3-202ENST00000410062 CFTRP13569 1480 aa42.79■■■■■ 4.44
UBE2E3-202ENST00000410062 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.78■■■■■ 4.44
UBE2E3-202ENST00000410062 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.71■■■■■ 4.43
UBE2E3-202ENST00000410062 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.54■■■■■ 4.4
UBE2E3-202ENST00000410062 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.49■■■■■ 4.39
UBE2E3-202ENST00000410062 PRDM2Q13029 1718 aa42.48■■■■■ 4.39
UBE2E3-202ENST00000410062 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.45■■■■■ 4.39
UBE2E3-202ENST00000410062 CUX2O14529 1486 aa42.37■■■■■ 4.37
UBE2E3-202ENST00000410062 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.34■■■■■ 4.37
UBE2E3-202ENST00000410062 WDR62O43379 1518 aa42.19■■■■■ 4.34
UBE2E3-202ENST00000410062 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.11■■■■■ 4.33
UBE2E3-202ENST00000410062 TOPBP1Q92547 1522 aa41.87■■■■■ 4.29
UBE2E3-202ENST00000410062 ABCC8Q09428 1581 aa41.82■■■■■ 4.29
UBE2E3-202ENST00000410062 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.82■■■■■ 4.29
UBE2E3-202ENST00000410062 CUX1P39880 1505 aa41.65■■■■■ 4.26
UBE2E3-202ENST00000410062 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.54■■■■■ 4.24
UBE2E3-202ENST00000410062 IFT140Q96RY7 1462 aa41.54■■■■■ 4.24
UBE2E3-202ENST00000410062 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.47■■■■■ 4.23
UBE2E3-202ENST00000410062 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.44■■■■■ 4.22
UBE2E3-202ENST00000410062 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.4■■■■■ 4.22
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.39■■■■■ 4.22
UBE2E3-202ENST00000410062 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.39■■■■■ 4.22
UBE2E3-202ENST00000410062 SOGA1O94964 1423 aa41.37■■■■■ 4.21
UBE2E3-202ENST00000410062 SYNJ1O43426 1573 aa41.35■■■■■ 4.21
UBE2E3-202ENST00000410062 TOP2BQ02880 1626 aa41.32■■■■■ 4.2
UBE2E3-202ENST00000410062 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.3■■■■■ 4.2
UBE2E3-202ENST00000410062 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.22■■■■■ 4.19
UBE2E3-202ENST00000410062 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.19■■■■■ 4.18
UBE2E3-202ENST00000410062 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
UBE2E3-202ENST00000410062 WDR97A6NE52 1622 aa41.1■■■■■ 4.17
UBE2E3-202ENST00000410062 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.05■■■■■ 4.16
UBE2E3-202ENST00000410062 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.89■■■■■ 4.14
UBE2E3-202ENST00000410062 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.89■■■■■ 4.14
UBE2E3-202ENST00000410062 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.88■■■■■ 4.13
UBE2E3-202ENST00000410062 GRIN2BQ13224 1484 aa40.84■■■■■ 4.13
UBE2E3-202ENST00000410062 PBRM1Q86U86 1689 aa40.81■■■■■ 4.12
UBE2E3-202ENST00000410062 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.8■■■■■ 4.12
UBE2E3-202ENST00000410062 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.7■■■■■ 4.11
UBE2E3-202ENST00000410062 OSCARQ8IYS5 282 aa40.69■■■■■ 4.11
UBE2E3-202ENST00000410062 FBLN2P98095 1184 aa40.68■■■■■ 4.1
UBE2E3-202ENST00000410062 CHD1O14646 1710 aa40.68■■■■■ 4.1
UBE2E3-202ENST00000410062 TRIM41Q8WV44 630 aa40.63■■■■■ 4.09
UBE2E3-202ENST00000410062 SYNJ2O15056 1496 aa40.56■■■■■ 4.08
UBE2E3-202ENST00000410062 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.56■■■■■ 4.08
UBE2E3-202ENST00000410062 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.55■■■■■ 4.08
UBE2E3-202ENST00000410062 KIF27Q86VH2 1401 aa40.55■■■■■ 4.08
UBE2E3-202ENST00000410062 ADAMTS12P58397 1594 aa40.48■■■■■ 4.07
UBE2E3-202ENST00000410062 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.41■■■■■ 4.06
UBE2E3-202ENST00000410062 IGF1RP08069 1367 aa40.38■■■■■ 4.05
UBE2E3-202ENST00000410062 GRIN2AQ12879 1464 aa40.33■■■■■ 4.05
UBE2E3-202ENST00000410062 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.32■■■■■ 4.04
UBE2E3-202ENST00000410062 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.27■■■■■ 4.04
UBE2E3-202ENST00000410062 CUL7Q14999 1698 aa40.23■■■■■ 4.03
UBE2E3-202ENST00000410062 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.2■■■■■ 4.03
UBE2E3-202ENST00000410062 CEP170Q5SW79 1584 aa40.15■■■■■ 4.02
UBE2E3-202ENST00000410062 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.14■■■■■ 4.02
UBE2E3-202ENST00000410062 NUP160Q12769 1436 aa40.13■■■■■ 4.01
UBE2E3-202ENST00000410062 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.04■■■■■ 4
UBE2E3-202ENST00000410062 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.04■■■■■ 4
UBE2E3-202ENST00000410062 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.04■■■■■ 4
UBE2E3-202ENST00000410062 ARHGEF11O15085 1522 aa40.04■■■■■ 4
UBE2E3-202ENST00000410062 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.91■■■■□ 3.98
UBE2E3-202ENST00000410062 EEA1Q15075 1411 aa39.85■■■■□ 3.97
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP39.84■■■■□ 3.97
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