RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262947.7

MYDGF-201, Transcript of myeloid derived growth factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MYDGF, Length 1,018 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYDGF-201ENST00000262947 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.88■■■■■ 6.86
MYDGF-201ENST00000262947 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.42■■■■■ 5.82
MYDGF-201ENST00000262947 ABCC9O60706 1549 aa50.33■■■■■ 5.65
MYDGF-201ENST00000262947 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.43■■■■■ 5.34
MYDGF-201ENST00000262947 NACADO15069 1562 aa48.39■■■■■ 5.34
MYDGF-201ENST00000262947 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.35■■■■■ 5.33
MYDGF-201ENST00000262947 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.21■■■■■ 5.31
MYDGF-201ENST00000262947 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.12■■■■■ 5.29
MYDGF-201ENST00000262947 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.91■■■■■ 5.26
MYDGF-201ENST00000262947 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.27■■■■■ 5.16
MYDGF-201ENST00000262947 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.06■■■■■ 5.12
MYDGF-201ENST00000262947 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.96■■■■■ 5.11
MYDGF-201ENST00000262947 SCRIBQ14160 1630 aa46.9■■■■■ 5.1
MYDGF-201ENST00000262947 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.5■■■■■ 5.03
MYDGF-201ENST00000262947 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.24■■■■■ 4.99
MYDGF-201ENST00000262947 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.71■■■■■ 4.91
MYDGF-201ENST00000262947 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.52■■■■■ 4.88
MYDGF-201ENST00000262947 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.24■■■■■ 4.83
MYDGF-201ENST00000262947 SMARCA4P51532 1647 aa44.89■■■■■ 4.78
MYDGF-201ENST00000262947 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.86■■■■■ 4.77
MYDGF-201ENST00000262947 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.68■■■■■ 4.74
MYDGF-201ENST00000262947 NCAPD3P42695 1498 aa44.67■■■■■ 4.74
MYDGF-201ENST00000262947 SMARCA2P51531 1590 aa44.61■■■■■ 4.73
MYDGF-201ENST00000262947 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.59■■■■■ 4.73
MYDGF-201ENST00000262947 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.48■■■■■ 4.71
MYDGF-201ENST00000262947 HMGXB3Q12766 1538 aa44.42■■■■■ 4.7
MYDGF-201ENST00000262947 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.29■■■■■ 4.68
MYDGF-201ENST00000262947 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.1■■■■■ 4.65
MYDGF-201ENST00000262947 WIZO95785 1651 aa44.09■■■■■ 4.65
MYDGF-201ENST00000262947 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.64■■■■■ 4.58
MYDGF-201ENST00000262947 NESP48681 1621 aa43.55■■■■■ 4.56
MYDGF-201ENST00000262947 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.46■■■■■ 4.55
MYDGF-201ENST00000262947 ERCC6Q03468 1493 aa43.38■■■■■ 4.54
MYDGF-201ENST00000262947 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.37■■■■■ 4.53
MYDGF-201ENST00000262947 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.2■■■■■ 4.51
MYDGF-201ENST00000262947 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.14■■■■■ 4.5
MYDGF-201ENST00000262947 CFTRP13569 1480 aa43.1■■■■■ 4.49
MYDGF-201ENST00000262947 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.01■■■■■ 4.48
MYDGF-201ENST00000262947 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.97■■■■■ 4.47
MYDGF-201ENST00000262947 CUX2O14529 1486 aa42.95■■■■■ 4.47
MYDGF-201ENST00000262947 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.89■■■■■ 4.46
MYDGF-201ENST00000262947 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.84■■■■■ 4.45
MYDGF-201ENST00000262947 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.78■■■■■ 4.44
MYDGF-201ENST00000262947 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.73■■■■■ 4.43
MYDGF-201ENST00000262947 PRDM2Q13029 1718 aa42.71■■■■■ 4.43
MYDGF-201ENST00000262947 WDR62O43379 1518 aa42.58■■■■■ 4.41
MYDGF-201ENST00000262947 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.41■■■■■ 4.38
MYDGF-201ENST00000262947 ABCC8Q09428 1581 aa42.18■■■■■ 4.34
MYDGF-201ENST00000262947 TOPBP1Q92547 1522 aa42.15■■■■■ 4.34
MYDGF-201ENST00000262947 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.1■■■■■ 4.33
MYDGF-201ENST00000262947 IFT140Q96RY7 1462 aa41.91■■■■■ 4.3
MYDGF-201ENST00000262947 CUX1P39880 1505 aa41.83■■■■■ 4.29
MYDGF-201ENST00000262947 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
MYDGF-201ENST00000262947 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.69■■■■■ 4.27
MYDGF-201ENST00000262947 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.69■■■■■ 4.26
MYDGF-201ENST00000262947 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.69■■■■■ 4.26
MYDGF-201ENST00000262947 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.68■■■■■ 4.26
MYDGF-201ENST00000262947 SOGA1O94964 1423 aa41.65■■■■■ 4.26
MYDGF-201ENST00000262947 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.62■■■■■ 4.25
MYDGF-201ENST00000262947 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.58■■■■■ 4.25
MYDGF-201ENST00000262947 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
MYDGF-201ENST00000262947 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.47■■■■■ 4.235e-7■■■■□ 20.5
MYDGF-201ENST00000262947 TOP2BQ02880 1626 aa41.47■■■■■ 4.23
MYDGF-201ENST00000262947 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.45■■■■■ 4.23
MYDGF-201ENST00000262947 SYNJ1O43426 1573 aa41.44■■■■■ 4.22
MYDGF-201ENST00000262947 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.4■■■■■ 4.22
MYDGF-201ENST00000262947 WDR97A6NE52 1622 aa41.38■■■■■ 4.21
MYDGF-201ENST00000262947 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.31■■■■■ 4.2
MYDGF-201ENST00000262947 OSCARQ8IYS5 282 aa41.2■■■■■ 4.19
MYDGF-201ENST00000262947 GRIN2BQ13224 1484 aa41.15■■■■■ 4.18
MYDGF-201ENST00000262947 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.15■■■■■ 4.18
MYDGF-201ENST00000262947 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.11■■■■■ 4.17
MYDGF-201ENST00000262947 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.08■■■■■ 4.17
MYDGF-201ENST00000262947 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.04■■■■■ 4.16
MYDGF-201ENST00000262947 PBRM1Q86U86 1689 aa41.01■■■■■ 4.16
MYDGF-201ENST00000262947 CHD1O14646 1710 aa40.97■■■■■ 4.15
MYDGF-201ENST00000262947 FBLN2P98095 1184 aa40.97■■■■■ 4.15
MYDGF-201ENST00000262947 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.89■■■■■ 4.14
MYDGF-201ENST00000262947 SYNJ2O15056 1496 aa40.89■■■■■ 4.14
MYDGF-201ENST00000262947 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.81■■■■■ 4.12
MYDGF-201ENST00000262947 KIF27Q86VH2 1401 aa40.72■■■■■ 4.11
MYDGF-201ENST00000262947 ADAMTS12P58397 1594 aa40.71■■■■■ 4.11
MYDGF-201ENST00000262947 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.69■■■■■ 4.1
MYDGF-201ENST00000262947 GRIN2AQ12879 1464 aa40.61■■■■■ 4.09
MYDGF-201ENST00000262947 TRIM41Q8WV44 630 aa40.6■■■■■ 4.09
MYDGF-201ENST00000262947 IGF1RP08069 1367 aa40.58■■■■■ 4.09
MYDGF-201ENST00000262947 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.57■■■■■ 4.08
MYDGF-201ENST00000262947 ARHGEF11O15085 1522 aa40.49■■■■■ 4.07
MYDGF-201ENST00000262947 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.48■■■■■ 4.07
MYDGF-201ENST00000262947 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.48■■■■■ 4.07
MYDGF-201ENST00000262947 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.48■■■■■ 4.07
MYDGF-201ENST00000262947 NUP160Q12769 1436 aa40.45■■■■■ 4.07
MYDGF-201ENST00000262947 CUL7Q14999 1698 aa40.41■■■■■ 4.06
MYDGF-201ENST00000262947 CEP170Q5SW79 1584 aa40.4■■■■■ 4.06
MYDGF-201ENST00000262947 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.33■■■■■ 4.05
MYDGF-201ENST00000262947 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.32■■■■■ 4.05
MYDGF-201ENST00000262947 ARAP1Q96P48 1450 aa40.17■■■■■ 4.02
MYDGF-201ENST00000262947 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.14■■■■■ 4.02
MYDGF-201ENST00000262947 CHIC1Q5VXU3 224 aa40.13■■■■■ 4.01
MYDGF-201ENST00000262947 SHROOM2Q13796 1616 aa40.12■■■■■ 4.01
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