RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543175.4

PTRH1-208, Transcript of peptidyl-tRNA hydrolase 1 homolog, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTRH1, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTRH1-208	ENST00000543175	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		59.03	■■■■■ 7.04
PTRH1-208	ENST00000543175	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		52.96	■■■■■ 6.07
PTRH1-208	ENST00000543175	ABCC9	O60706	1549 aa		52.45	■■■■■ 5.99
PTRH1-208	ENST00000543175	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		50.16	■■■■■ 5.62
PTRH1-208	ENST00000543175	NACAD	O15069	1562 aa		49.9	■■■■■ 5.58
PTRH1-208	ENST00000543175	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		49.51	■■■■■ 5.52
PTRH1-208	ENST00000543175	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		49.33	■■■■■ 5.49
PTRH1-208	ENST00000543175	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		49.15	■■■■■ 5.46
PTRH1-208	ENST00000543175	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	49.03	■■■■■ 5.44
PTRH1-208	ENST00000543175	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		48.83	■■■■■ 5.41
PTRH1-208	ENST00000543175	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	48.79	■■■■■ 5.4
PTRH1-208	ENST00000543175	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		48.79	■■■■■ 5.4
PTRH1-208	ENST00000543175	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		48.68	■■■■■ 5.38
PTRH1-208	ENST00000543175	SCRIB	Q14160	1630 aa		48.18	■■■■■ 5.3
PTRH1-208	ENST00000543175	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		48.09	■■■■■ 5.29
PTRH1-208	ENST00000543175	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		47.46	■■■■■ 5.19
PTRH1-208	ENST00000543175	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	47.45	■■■■■ 5.19
PTRH1-208	ENST00000543175	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		47.21	■■■■■ 5.15
PTRH1-208	ENST00000543175	SMARCA4	P51532	1647 aa		46.03	■■■■■ 4.96
PTRH1-208	ENST00000543175	NCAPD3	P42695	1498 aa		46	■■■■■ 4.95
PTRH1-208	ENST00000543175	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		45.91	■■■■■ 4.94
PTRH1-208	ENST00000543175	SMARCA2	P51531	1590 aa		45.86	■■■■■ 4.93
PTRH1-208	ENST00000543175	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	45.84	■■■■■ 4.93
PTRH1-208	ENST00000543175	HMGXB3	Q12766	1538 aa		45.76	■■■■■ 4.92
PTRH1-208	ENST00000543175	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		45.58	■■■■■ 4.89
PTRH1-208	ENST00000543175	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	45.5	■■■■■ 4.87
PTRH1-208	ENST00000543175	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		45.49	■■■■■ 4.87
PTRH1-208	ENST00000543175	ERCC6	Q03468	1493 aa		45.26	■■■■■ 4.84
PTRH1-208	ENST00000543175	NES	P48681	1621 aa		45.16	■■■■■ 4.82
PTRH1-208	ENST00000543175	CUX2	O14529	1486 aa		45.1	■■■■■ 4.81
PTRH1-208	ENST00000543175	WIZ	O95785	1651 aa		45.01	■■■■■ 4.8
PTRH1-208	ENST00000543175	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		44.99	■■■■■ 4.79
PTRH1-208	ENST00000543175	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	44.73	■■■■■ 4.75
PTRH1-208	ENST00000543175	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		44.72	■■■■■ 4.75
PTRH1-208	ENST00000543175	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	44.63	■■■■■ 4.73
PTRH1-208	ENST00000543175	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		44.62	■■■■■ 4.73
PTRH1-208	ENST00000543175	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		44.58	■■■■■ 4.73
PTRH1-208	ENST00000543175	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		44.57	■■■■■ 4.73
PTRH1-208	ENST00000543175	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	44.46	■■■■■ 4.71
PTRH1-208	ENST00000543175	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		44.26	■■■■■ 4.68
PTRH1-208	ENST00000543175	CFTR	P13569	1480 aa		44.19	■■■■■ 4.66
PTRH1-208	ENST00000543175	WDR62	O43379	1518 aa		44.17	■■■■■ 4.66
PTRH1-208	ENST00000543175	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		44.16	■■■■■ 4.66
PTRH1-208	ENST00000543175	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		44.12	■■■■■ 4.65
PTRH1-208	ENST00000543175	PRDM2	Q13029	1718 aa		43.99	■■■■■ 4.63
PTRH1-208	ENST00000543175	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		43.88	■■■■■ 4.61
PTRH1-208	ENST00000543175	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	43.74	■■■■■ 4.59
PTRH1-208	ENST00000543175	TOPBP1	Q92547	1522 aa		43.34	■■■■■ 4.53
PTRH1-208	ENST00000543175	ABCC8	Q09428	1581 aa		43.29	■■■■■ 4.52
PTRH1-208	ENST00000543175	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		43.25	■■■■■ 4.51
PTRH1-208	ENST00000543175	IFT140	Q96RY7	1462 aa		43.25	■■■■■ 4.51
PTRH1-208	ENST00000543175	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	43.12	■■■■■ 4.49
PTRH1-208	ENST00000543175	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	43	■■■■■ 4.47
PTRH1-208	ENST00000543175	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		42.99	■■■■■ 4.47
PTRH1-208	ENST00000543175	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	42.98	■■■■■ 4.47
PTRH1-208	ENST00000543175	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	42.91	■■■■■ 4.46
PTRH1-208	ENST00000543175	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	42.83	■■■■■ 4.45
PTRH1-208	ENST00000543175	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	42.74	■■■■■ 4.43
PTRH1-208	ENST00000543175	TRIM41	Q8WV44	630 aa		42.74	■■■■■ 4.43
PTRH1-208	ENST00000543175	CUX1	P39880	1505 aa		42.72	■■■■■ 4.43
PTRH1-208	ENST00000543175	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		42.71	■■■■■ 4.43
PTRH1-208	ENST00000543175	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		42.7	■■■■■ 4.43
PTRH1-208	ENST00000543175	SOGA1	O94964	1423 aa		42.68	■■■■■ 4.42
PTRH1-208	ENST00000543175	CHD1	O14646	1710 aa		42.66	■■■■■ 4.42
PTRH1-208	ENST00000543175	WDR97	A6NE52	1622 aa		42.6	■■■■■ 4.41
PTRH1-208	ENST00000543175	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		42.54	■■■■■ 4.4
PTRH1-208	ENST00000543175	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		42.54	■■■■■ 4.4
PTRH1-208	ENST00000543175	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		42.54	■■■■■ 4.4
PTRH1-208	ENST00000543175	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	42.52	■■■■■ 4.4
PTRH1-208	ENST00000543175	ARHGEF11	O15085	1522 aa		42.41	■■■■■ 4.38
PTRH1-208	ENST00000543175	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		42.37	■■■■■ 4.37
PTRH1-208	ENST00000543175	FBLN2	P98095	1184 aa		42.34	■■■■■ 4.37
PTRH1-208	ENST00000543175	PBRM1	Q86U86	1689 aa		42.31	■■■■■ 4.36
PTRH1-208	ENST00000543175	GRIN2B	Q13224	1484 aa		42.3	■■■■■ 4.36
PTRH1-208	ENST00000543175	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	42.3	■■■■■ 4.36
PTRH1-208	ENST00000543175	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		42.24	■■■■■ 4.35
PTRH1-208	ENST00000543175	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		42.23	■■■■■ 4.35
PTRH1-208	ENST00000543175	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		42.22	■■■■■ 4.35
PTRH1-208	ENST00000543175	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		42.2	■■■■■ 4.35
PTRH1-208	ENST00000543175	TOP2B	Q02880	1626 aa		42.18	■■■■■ 4.34
PTRH1-208	ENST00000543175	SYNJ2	O15056	1496 aa		42.14	■■■■■ 4.34
PTRH1-208	ENST00000543175	SYNJ1	O43426	1573 aa		42.13	■■■■■ 4.33
PTRH1-208	ENST00000543175	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	42.12	■■■■■ 4.33
PTRH1-208	ENST00000543175	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		42.11	■■■■■ 4.33
PTRH1-208	ENST00000543175	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	42.1	■■■■■ 4.33
PTRH1-208	ENST00000543175	ARAP1	Q96P48	1450 aa		41.99	■■■■■ 4.31
PTRH1-208	ENST00000543175	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		41.95	■■■■■ 4.31
PTRH1-208	ENST00000543175	ADAMTS12	P58397	1594 aa		41.86	■■■■■ 4.29
PTRH1-208	ENST00000543175	GRIN2A	Q12879	1464 aa		41.79	■■■■■ 4.28
PTRH1-208	ENST00000543175	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		41.74	■■■■■ 4.27
PTRH1-208	ENST00000543175	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		41.67	■■■■■ 4.26
PTRH1-208	ENST00000543175	CEP170	Q5SW79	1584 aa		41.65	■■■■■ 4.26
PTRH1-208	ENST00000543175	NUP160	Q12769	1436 aa		41.61	■■■■■ 4.25
PTRH1-208	ENST00000543175	SHROOM2	Q13796	1616 aa		41.47	■■■■■ 4.23
PTRH1-208	ENST00000543175	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		41.45	■■■■■ 4.23
PTRH1-208	ENST00000543175	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	41.37	■■■■■ 4.21
PTRH1-208	ENST00000543175	KIF27	Q86VH2	1401 aa		41.29	■■■■■ 4.2
PTRH1-208	ENST00000543175	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		41.28	■■■■■ 4.2
PTRH1-208	ENST00000543175	CUL7	Q14999	1698 aa		41.26	■■■■■ 4.2
PTRH1-208	ENST00000543175	IGF1R	P08069	1367 aa		41.18	■■■■■ 4.18

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