RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543175.4

PTRH1-208, Transcript of peptidyl-tRNA hydrolase 1 homolog, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTRH1, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTRH1-208ENST00000543175 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.03■■■■■ 7.04
PTRH1-208ENST00000543175 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa52.96■■■■■ 6.07
PTRH1-208ENST00000543175 ABCC9O60706 1549 aa52.45■■■■■ 5.99
PTRH1-208ENST00000543175 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.16■■■■■ 5.62
PTRH1-208ENST00000543175 NACADO15069 1562 aa49.9■■■■■ 5.58
PTRH1-208ENST00000543175 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.51■■■■■ 5.52
PTRH1-208ENST00000543175 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.33■■■■■ 5.49
PTRH1-208ENST00000543175 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.15■■■■■ 5.46
PTRH1-208ENST00000543175 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.03■■■■■ 5.44
PTRH1-208ENST00000543175 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.83■■■■■ 5.41
PTRH1-208ENST00000543175 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.79■■■■■ 5.4
PTRH1-208ENST00000543175 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.79■■■■■ 5.4
PTRH1-208ENST00000543175 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.68■■■■■ 5.38
PTRH1-208ENST00000543175 SCRIBQ14160 1630 aa48.18■■■■■ 5.3
PTRH1-208ENST00000543175 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.09■■■■■ 5.29
PTRH1-208ENST00000543175 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.46■■■■■ 5.19
PTRH1-208ENST00000543175 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.45■■■■■ 5.19
PTRH1-208ENST00000543175 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.21■■■■■ 5.15
PTRH1-208ENST00000543175 SMARCA4P51532 1647 aa46.03■■■■■ 4.96
PTRH1-208ENST00000543175 NCAPD3P42695 1498 aa46■■■■■ 4.95
PTRH1-208ENST00000543175 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa45.91■■■■■ 4.94
PTRH1-208ENST00000543175 SMARCA2P51531 1590 aa45.86■■■■■ 4.93
PTRH1-208ENST00000543175 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.84■■■■■ 4.93
PTRH1-208ENST00000543175 HMGXB3Q12766 1538 aa45.76■■■■■ 4.92
PTRH1-208ENST00000543175 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.58■■■■■ 4.89
PTRH1-208ENST00000543175 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.5■■■■■ 4.87
PTRH1-208ENST00000543175 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.49■■■■■ 4.87
PTRH1-208ENST00000543175 ERCC6Q03468 1493 aa45.26■■■■■ 4.84
PTRH1-208ENST00000543175 NESP48681 1621 aa45.16■■■■■ 4.82
PTRH1-208ENST00000543175 CUX2O14529 1486 aa45.1■■■■■ 4.81
PTRH1-208ENST00000543175 WIZO95785 1651 aa45.01■■■■■ 4.8
PTRH1-208ENST00000543175 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.99■■■■■ 4.79
PTRH1-208ENST00000543175 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.73■■■■■ 4.75
PTRH1-208ENST00000543175 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.72■■■■■ 4.75
PTRH1-208ENST00000543175 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.63■■■■■ 4.73
PTRH1-208ENST00000543175 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.62■■■■■ 4.73
PTRH1-208ENST00000543175 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.58■■■■■ 4.73
PTRH1-208ENST00000543175 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.57■■■■■ 4.73
PTRH1-208ENST00000543175 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.46■■■■■ 4.71
PTRH1-208ENST00000543175 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.26■■■■■ 4.68
PTRH1-208ENST00000543175 CFTRP13569 1480 aa44.19■■■■■ 4.66
PTRH1-208ENST00000543175 WDR62O43379 1518 aa44.17■■■■■ 4.66
PTRH1-208ENST00000543175 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.16■■■■■ 4.66
PTRH1-208ENST00000543175 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.12■■■■■ 4.65
PTRH1-208ENST00000543175 PRDM2Q13029 1718 aa43.99■■■■■ 4.63
PTRH1-208ENST00000543175 CCDC88BA6NC98 1476 aa43.88■■■■■ 4.61
PTRH1-208ENST00000543175 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.74■■■■■ 4.59
PTRH1-208ENST00000543175 TOPBP1Q92547 1522 aa43.34■■■■■ 4.53
PTRH1-208ENST00000543175 ABCC8Q09428 1581 aa43.29■■■■■ 4.52
PTRH1-208ENST00000543175 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.25■■■■■ 4.51
PTRH1-208ENST00000543175 IFT140Q96RY7 1462 aa43.25■■■■■ 4.51
PTRH1-208ENST00000543175 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.12■■■■■ 4.49
PTRH1-208ENST00000543175 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43■■■■■ 4.47
PTRH1-208ENST00000543175 OSCARQ8IYS5 282 aa42.99■■■■■ 4.47
PTRH1-208ENST00000543175 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP42.98■■■■■ 4.47
PTRH1-208ENST00000543175 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP42.91■■■■■ 4.46
PTRH1-208ENST00000543175 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.83■■■■■ 4.45
PTRH1-208ENST00000543175 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42.74■■■■■ 4.43
PTRH1-208ENST00000543175 TRIM41Q8WV44 630 aa42.74■■■■■ 4.43
PTRH1-208ENST00000543175 CUX1P39880 1505 aa42.72■■■■■ 4.43
PTRH1-208ENST00000543175 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.71■■■■■ 4.43
PTRH1-208ENST00000543175 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.7■■■■■ 4.43
PTRH1-208ENST00000543175 SOGA1O94964 1423 aa42.68■■■■■ 4.42
PTRH1-208ENST00000543175 CHD1O14646 1710 aa42.66■■■■■ 4.42
PTRH1-208ENST00000543175 WDR97A6NE52 1622 aa42.6■■■■■ 4.41
PTRH1-208ENST00000543175 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.54■■■■■ 4.4
PTRH1-208ENST00000543175 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.54■■■■■ 4.4
PTRH1-208ENST00000543175 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.54■■■■■ 4.4
PTRH1-208ENST00000543175 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.52■■■■■ 4.4
PTRH1-208ENST00000543175 ARHGEF11O15085 1522 aa42.41■■■■■ 4.38
PTRH1-208ENST00000543175 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.37■■■■■ 4.37
PTRH1-208ENST00000543175 FBLN2P98095 1184 aa42.34■■■■■ 4.37
PTRH1-208ENST00000543175 PBRM1Q86U86 1689 aa42.31■■■■■ 4.36
PTRH1-208ENST00000543175 GRIN2BQ13224 1484 aa42.3■■■■■ 4.36
PTRH1-208ENST00000543175 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.3■■■■■ 4.36
PTRH1-208ENST00000543175 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.24■■■■■ 4.35
PTRH1-208ENST00000543175 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.23■■■■■ 4.35
PTRH1-208ENST00000543175 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.22■■■■■ 4.35
PTRH1-208ENST00000543175 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.2■■■■■ 4.35
PTRH1-208ENST00000543175 TOP2BQ02880 1626 aa42.18■■■■■ 4.34
PTRH1-208ENST00000543175 SYNJ2O15056 1496 aa42.14■■■■■ 4.34
PTRH1-208ENST00000543175 SYNJ1O43426 1573 aa42.13■■■■■ 4.33
PTRH1-208ENST00000543175 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.12■■■■■ 4.33
PTRH1-208ENST00000543175 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.11■■■■■ 4.33
PTRH1-208ENST00000543175 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.1■■■■■ 4.33
PTRH1-208ENST00000543175 ARAP1Q96P48 1450 aa41.99■■■■■ 4.31
PTRH1-208ENST00000543175 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.95■■■■■ 4.31
PTRH1-208ENST00000543175 ADAMTS12P58397 1594 aa41.86■■■■■ 4.29
PTRH1-208ENST00000543175 GRIN2AQ12879 1464 aa41.79■■■■■ 4.28
PTRH1-208ENST00000543175 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.74■■■■■ 4.27
PTRH1-208ENST00000543175 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.67■■■■■ 4.26
PTRH1-208ENST00000543175 CEP170Q5SW79 1584 aa41.65■■■■■ 4.26
PTRH1-208ENST00000543175 NUP160Q12769 1436 aa41.61■■■■■ 4.25
PTRH1-208ENST00000543175 SHROOM2Q13796 1616 aa41.47■■■■■ 4.23
PTRH1-208ENST00000543175 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.45■■■■■ 4.23
PTRH1-208ENST00000543175 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.37■■■■■ 4.21
PTRH1-208ENST00000543175 KIF27Q86VH2 1401 aa41.29■■■■■ 4.2
PTRH1-208ENST00000543175 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.28■■■■■ 4.2
PTRH1-208ENST00000543175 CUL7Q14999 1698 aa41.26■■■■■ 4.2
PTRH1-208ENST00000543175 IGF1RP08069 1367 aa41.18■■■■■ 4.18
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