RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563276.5

ZNF688-203, Transcript of zinc finger protein 688, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ZNF688, Length 1,492 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF688-203ENST00000563276 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.28■■■■■ 7.08
ZNF688-203ENST00000563276 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.13■■■■■ 6.1
ZNF688-203ENST00000563276 ABCC9O60706 1549 aa53.08■■■■■ 6.09
ZNF688-203ENST00000563276 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.54■■■■■ 5.68
ZNF688-203ENST00000563276 NACADO15069 1562 aa50.24■■■■■ 5.63
ZNF688-203ENST00000563276 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.88■■■■■ 5.57
ZNF688-203ENST00000563276 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.77■■■■■ 5.56
ZNF688-203ENST00000563276 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.61■■■■■ 5.53
ZNF688-203ENST00000563276 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.42■■■■■ 5.5
ZNF688-203ENST00000563276 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.37■■■■■ 5.49
ZNF688-203ENST00000563276 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.17■■■■■ 5.46
ZNF688-203ENST00000563276 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.12■■■■■ 5.45
ZNF688-203ENST00000563276 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa48.99■■■■■ 5.43
ZNF688-203ENST00000563276 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.46■■■■■ 5.35
ZNF688-203ENST00000563276 SCRIBQ14160 1630 aa48.41■■■■■ 5.34
ZNF688-203ENST00000563276 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.95■■■■■ 5.27
ZNF688-203ENST00000563276 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.88■■■■■ 5.25
ZNF688-203ENST00000563276 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.81■■■■■ 5.24
ZNF688-203ENST00000563276 NCAPD3P42695 1498 aa46.4■■■■■ 5.02
ZNF688-203ENST00000563276 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.27■■■■■ 5
ZNF688-203ENST00000563276 SMARCA4P51532 1647 aa46.21■■■■■ 4.99
ZNF688-203ENST00000563276 SMARCA2P51531 1590 aa46.11■■■■■ 4.97
ZNF688-203ENST00000563276 HMGXB3Q12766 1538 aa46.06■■■■■ 4.96
ZNF688-203ENST00000563276 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP45.98■■■■■ 4.95
ZNF688-203ENST00000563276 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.8■■■■■ 4.92
ZNF688-203ENST00000563276 ERCC6Q03468 1493 aa45.78■■■■■ 4.92
ZNF688-203ENST00000563276 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.78■■■■■ 4.92
ZNF688-203ENST00000563276 CUX2O14529 1486 aa45.73■■■■■ 4.91
ZNF688-203ENST00000563276 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.69■■■■■ 4.9
ZNF688-203ENST00000563276 NESP48681 1621 aa45.63■■■■■ 4.9
ZNF688-203ENST00000563276 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.62■■■■■ 4.89
ZNF688-203ENST00000563276 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.3■■■■■ 4.84
ZNF688-203ENST00000563276 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.17■■■■■ 4.82
ZNF688-203ENST00000563276 WIZO95785 1651 aa45.1■■■■■ 4.81
ZNF688-203ENST00000563276 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.03■■■■■ 4.8
ZNF688-203ENST00000563276 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45■■■■■ 4.79
ZNF688-203ENST00000563276 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.97■■■■■ 4.79
ZNF688-203ENST00000563276 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.77■■■■■ 4.76
ZNF688-203ENST00000563276 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.67■■■■■ 4.74
ZNF688-203ENST00000563276 WDR62O43379 1518 aa44.58■■■■■ 4.73
ZNF688-203ENST00000563276 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.56■■■■■ 4.72
ZNF688-203ENST00000563276 CFTRP13569 1480 aa44.5■■■■■ 4.71
ZNF688-203ENST00000563276 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.49■■■■■ 4.71
ZNF688-203ENST00000563276 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.47■■■■■ 4.71
ZNF688-203ENST00000563276 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.11■■■■■ 4.65
ZNF688-203ENST00000563276 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.06■■■■■ 4.64
ZNF688-203ENST00000563276 PRDM2Q13029 1718 aa43.96■■■■■ 4.63
ZNF688-203ENST00000563276 TOPBP1Q92547 1522 aa43.64■■■■■ 4.58
ZNF688-203ENST00000563276 OSCARQ8IYS5 282 aa43.61■■■■■ 4.57
ZNF688-203ENST00000563276 IFT140Q96RY7 1462 aa43.61■■■■■ 4.57
ZNF688-203ENST00000563276 TRIM41Q8WV44 630 aa43.59■■■■■ 4.57
ZNF688-203ENST00000563276 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.56■■■■■ 4.56
ZNF688-203ENST00000563276 ABCC8Q09428 1581 aa43.5■■■■■ 4.55
ZNF688-203ENST00000563276 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.46■■■■■ 4.55
ZNF688-203ENST00000563276 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.29■■■■■ 4.52
ZNF688-203ENST00000563276 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.25■■■■■ 4.51
ZNF688-203ENST00000563276 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.2■■■■■ 4.51
ZNF688-203ENST00000563276 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.15■■■■■ 4.5
ZNF688-203ENST00000563276 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.06■■■■■ 4.48
ZNF688-203ENST00000563276 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.06■■■■■ 4.48
ZNF688-203ENST00000563276 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.06■■■■■ 4.48
ZNF688-203ENST00000563276 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.02■■■■■ 4.48
ZNF688-203ENST00000563276 SOGA1O94964 1423 aa42.97■■■■■ 4.47
ZNF688-203ENST00000563276 ARHGEF11O15085 1522 aa42.96■■■■■ 4.47
ZNF688-203ENST00000563276 CUX1P39880 1505 aa42.92■■■■■ 4.46
ZNF688-203ENST00000563276 FGD5Q6ZNL6 1462 aa42.92■■■■■ 4.46
ZNF688-203ENST00000563276 CHD1O14646 1710 aa42.92■■■■■ 4.46
ZNF688-203ENST00000563276 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.88■■■■■ 4.46
ZNF688-203ENST00000563276 WDR97A6NE52 1622 aa42.79■■■■■ 4.44
ZNF688-203ENST00000563276 FBLN2P98095 1184 aa42.77■■■■■ 4.44
ZNF688-203ENST00000563276 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.73■■■■■ 4.43
ZNF688-203ENST00000563276 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.71■■■■■ 4.43
ZNF688-203ENST00000563276 GRIN2BQ13224 1484 aa42.6■■■■■ 4.41
ZNF688-203ENST00000563276 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.6■■■■■ 4.41
ZNF688-203ENST00000563276 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.58■■■■■ 4.41
ZNF688-203ENST00000563276 ARAP1Q96P48 1450 aa42.55■■■■■ 4.4
ZNF688-203ENST00000563276 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.5■■■■■ 4.39
ZNF688-203ENST00000563276 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.49■■■■■ 4.39
ZNF688-203ENST00000563276 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.46■■■■■ 4.39
ZNF688-203ENST00000563276 SYNJ2O15056 1496 aa42.46■■■■■ 4.39
ZNF688-203ENST00000563276 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.46■■■■■ 4.39
ZNF688-203ENST00000563276 SYNJ1O43426 1573 aa42.42■■■■■ 4.38
ZNF688-203ENST00000563276 PBRM1Q86U86 1689 aa42.4■■■■■ 4.38
ZNF688-203ENST00000563276 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.39■■■■■ 4.38
ZNF688-203ENST00000563276 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.28■■■■■ 4.36
ZNF688-203ENST00000563276 TOP2BQ02880 1626 aa42.23■■■■■ 4.35
ZNF688-203ENST00000563276 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.22■■■■■ 4.35
ZNF688-203ENST00000563276 GRIN2AQ12879 1464 aa42.07■■■■■ 4.32
ZNF688-203ENST00000563276 ADAMTS12P58397 1594 aa42.06■■■■■ 4.32
ZNF688-203ENST00000563276 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.04■■■■■ 4.32
ZNF688-203ENST00000563276 NUP160Q12769 1436 aa41.96■■■■■ 4.31
ZNF688-203ENST00000563276 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.93■■■■■ 4.3
ZNF688-203ENST00000563276 CEP170Q5SW79 1584 aa41.92■■■■■ 4.3
ZNF688-203ENST00000563276 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.91■■■■■ 4.3
ZNF688-203ENST00000563276 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.84■■■■■ 4.29
ZNF688-203ENST00000563276 SHROOM2Q13796 1616 aa41.74■■■■■ 4.27
ZNF688-203ENST00000563276 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.49■■■■■ 4.23
ZNF688-203ENST00000563276 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.46■■■■■ 4.23
ZNF688-203ENST00000563276 JPH4Q96JJ6 628 aa41.46■■■■■ 4.23
ZNF688-203ENST00000563276 IGF1RP08069 1367 aa41.41■■■■■ 4.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms